+ All Categories
Home > Documents > Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic...

Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic...

Date post: 16-Feb-2020
Category:
Upload: others
View: 3 times
Download: 0 times
Share this document with a friend
40
Fotobionti aneb lišejník není jen houba, ale i řasa Ondřej Peksa Západočeské muzeum v Plzni
Transcript
Page 1: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Fotobionti

aneb

lišejník není jen houba, ale i řasa

Ondřej Peksa

Západočeské muzeum v

Plzni

Page 2: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Lišejníky

• stará definice lišejníku… podvojný organismus

složený z houby (mykobionta) a

fotosyntetizujícího partnera (fotobionta)

• ale jsou to „organismy“ vskutku komplexní

Page 3: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Stélka

• Stavba stélky (thallus) – většinou dominuje

mykobiont a fotobiont je omezen na tzv. řasovou

vrstvu

heteromerická lupenitá stélka homeomerická leprózní stélka

Obrázky: http://www.earthlife.net/lichens/lichen.html

Page 4: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

http://www.sciencephoto.com/med

ia/16655/enlarge

řez stélkou

lupenitého

lišejníku

Page 5: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Peltigera aphthosa

foto: D. Svoboda

Page 6: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Peltigera aphthosa – cephalodiafoto: D. Svoboda

Page 7: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Peltigera aphthosa

(mykobiont)

foto D. Svoboda

Coccomyxa (primární fotobiont)

Nostoc (cephalodia)

http://www.botany.hawaii.edu/faculty/webb/bot311/cyanobacteria/cyanophyta-8.htm

http://www.nhm.ac.uk/research-curation/departments/botany/organisms/algae/definition.html

Page 8: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Procaryota - Bacteria - CyanobacteriaKeeling (2004)

zelené šipky - fotobionti

Page 9: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Cyanobacteria Eukaryotic algae

Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae

Aphanocapsa (Synechococcales) Cephaleuros Ulvophyceae

Calothrix Nostocales Coccobotrys Chlorophyceae

Cyanosarcina Chroococcales Coccomyxa Trebouxiophyceae

Dichothrix Nostocales Desmococcus Chlorophyceae

Entophysalis Chroococcales Dictyochloropsis Trebouxiophyceae

Gloeocapsa Chroococcales Dilabifilum Ulvophyceae

Hormathonema Chroococcales Diplosphaera Chlorophyceae

Hyella Chroococcales Elliptochloris Trebouxiophyceae

Hyphomorpha Stigonematales Gloeocystis Chlorophyceae

Chroococcidiopsis Chroococcales Heterococcus Xanthophyceae

Chroococcus Chroococcales Chlorella Chlorophyceae/Trebouxiophyceae

Microcystis Chroococcales Chlorosarcinopsis Chlorophyceae

Myxosarcina Chroococcales Leptosira Trebouxiophyceae

Nostoc Nostocales Myrmecia Trebouxiophyceae

Rhizonema Nostocales Nannochloris Trebouxiophyceae

Scytonema Nostocales Pelvetia * Phaeophyceae

Stigonema Nostocales Petroderma Fucophyceae

Tolypothrix Nostocales Phycopeltis Ulvophyceae

Prasiola ** Trebouxiophyceae

Protococcus *** Trebouxiophyceae

Pseudochlorella Trebouxiophyceae

Stichococcus Trebouxiophyceae

Trebouxia Trebouxiophyceae

Trentepohlia Ulvophyceae

Trochiscia Chlorophyceae

* photobiont of marine "borderline lichen" Collemopsidium pelvetiae

** photobiont of marine "borderline lichen" Mastodia tessellata

*** synonimized with Apatococcus

Page 10: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Trebouxia

Trentepohlia

Nostoc

Gloeocapsa

http://silicasecchidisk.conncoll.edu/

Page 11: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Jak lišejník funguje?

houba:

• tvoří „tělo“ lišejníku

• „pečuje“ o řasu

• ovlivňuje vodní režim

• (v interakci s řasou) tvoří sekundární metabolity

řasa:

• vyživuje celý systém

Smith et al. (1987)

sinice:

• dodává do systému dusík

Page 12: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

foto: Š. Bayerová

Page 13: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Je lišejník dobrou ukázkou symbiózy?

- mutualismus…parasitismus…kontrolovaný

parazitismus...

Schwenderer (1869) sec.

Ahmadjian (1993)

Page 14: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

www.globalgayz.com

...domestikace

Page 15: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

!!! Identifikováni jsou fotobionti ze 2-3 %

lišejníků

Proč?

- nejsou vidět, lišejník je hlavně houba...

- nesnadná determinace – fotobiont v lišejníku vypadá často naprosto odlišně než ve volně žijící formě -změna struktury vynucená houbou, deformace vnitřních struktur haustorii

Řešení:

- izolace a kultivace – problematická

- popis nových druhů dosti obtížný

- molekulární biologie (také má svá omezení)

Page 16: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

• asi 15 000 druhů hub ze skupin…

AscomycotaBasidiomycota

• ??? druhů řas a sinic

(popsaných něco přes

100)

Trebouxia

foto: E. Timdal © ET

foto: E. Timdal © ET

Page 17: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

„Výnos především“

Chloroplast řasy Asterochloris v

lišejníku (dojná kráva)

Chloroplast řasy Asterochloris v kultuře

Page 18: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

foto: František Šaržík

v lišejníku

Trentepohlia

Page 19: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Metody studia (foto)biontů

Laboratorní lichenologie

- izolace a kultivace biontů in vitro

- speciální metody izolace

- kultivace – specifická média, podmínky

výsledky: pěstování problematické

- partneři rostou odděleně velmi neochotně (hlavně houba)

- kultivace se často nezdaří vůbec

Pokud se podaří partnery izolovat a kultivovat v

axenické kultuře naskýtá se možnost laboratorní

resyntézy lišejníku

Page 20: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Cladia retipora

foto:Ulrich Kirschbaum (http://www.fotocommunity.de/pc/pc/display/23989004)

Page 21: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Stocker-Wörgötter E., Elix j.A. (2006): Morphogenetic strategies and induction of secondary metabolite

biosynthesis in cultured lichen-forming Ascomycota, as exemplified by Cladia retipora (Labill.) Nyl.

and Dactylina arctica (Richards) Nyl. - Symbiosis 41/1: 9-20.

kultura fotobionta

kultura mykobionta

kultura lišejníku

Page 22: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

kultury foto a mykobiontů

Page 23: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Morfologické studie

např. konfokální mikroskopie

snímky chloroplastu

řasy Asterochloris

Page 24: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Molekulární biologie

• bez sekvence v podstatě nelze druh účinně popsat

• absolutně dominuje sekvenování: řasy (ITS rDNA,

část genu pro actin, rbcL, chloroplastový spacer psbJ-

L, gen pro cytochrom oxidázu Cox2); sinice (16S

rRNA, rbcLXS)

• často se řeší diverzita fotobiontů v rámci nějaké

skupiny hub... specificita asociací...ekologie

fotobiontů

Page 25: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Specificita

= míra toho, s kolika potenciálními partnery je

symbiont schopen spolupracovat (vytvořit fungující

lišejník)

• v podstatě vyjadřuje míru koevoluce

• už morfologické studie naznačily, že to nebude úplně

triviální

Page 26: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Helms (2003)

Page 27: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Problém s rozmnožováním

nepohlavně × pohlavně

• kromě nalezení vhodného stanoviště musí navíc najít vhodného partnera – toto hledání je velmi nejspíš nesnadné a často končí neúspěchem

foto L. et A. Stridvall dle Kalina et Váňa (2005)

Page 28: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

klíčící spora mykobionta

nenajde partnera → †

najde „cizí“ řasu → dočasná „lichenizace“

najde „svou“ řasu → vznik lišejníku

Asterochloris + Cladonia

Page 29: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Specificita (selektivita)

• tzn. na vybíravosti

partnerů dost záleží, je

na ní závislý úspěch

celé asociace

• nejen ovšem u

pohlavně se množících

(viz Wornik et Grube

2010!)

Beck et al. (2002)

Page 30: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

euryekní lišejník vyhraněný druh

malá specificita vysoká specificita

„obecný“ biotop extrémní biotop

více hub – více řas více hub – málo řas?

Důležitou úlohu v celém procesu zřejmě hraje

nepohlavní rozmnožování lišejníků.

Page 31: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Lišejníkové gildy

Rikkinen et al.

(2002)

Page 32: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Ekologie fotobiontů

• fotobionti mají svou vlastní ekologii, do jisté míry

nezávislou na houbě

• řasa je možná o něco citlivější než houba (má

pádnější důvod – fotosyntézu) a možná že je to právě

fotobiont, kdo více ovládá ekologii a rozšíření

lišejníků

• i když samozřejmě jsou to spojené nádoby – jeden

ovlivňuje druhého

Page 33: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Příklady

• různí fotobionti v lišejníku Ramalina menziesii na různých druzích dubů v jednom území (Werth et Sork2010)

• různí fotobionti v lišejníku Lecanora rupicola v Alpách a v teplém mediteránu (Blaha et al. 2006)

• stejný fotobiont v různých lišejnících na železité skále (Beck et al. 1998)

Page 34: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

vysvětlení viz in Peksa O. & Škaloud P. (2011): Do photobionts influence the ecology of lichens? A case study of environmental

preferences in symbiotic green alga Asterochloris (Trebouxiophyceae). - Molecular Ecology 20: 3936-3948.

Page 35: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Ekologie se projevuje v rozšíření

• chladné oblasti – 8 % sinice, 9 % Trentepohliaceae,

83 % zelené kokální řasy

• teplé oblasti – 5-10 % sinice, 90-95 % Trentepohliaceae,

zelené kokální řasy minimum

• ale liší se to i u jednotlivých druhů – lišejník Cetraria

aculeata má jiný druh řasy Trebouxia v chladných

oblastech a v temperátní zóně (Fernadez-Mendoza et al.

2011)

Page 36: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Marini et al. (2011): Large-scale patterns of epiphytic lichen

species richness: Photobiont-dependent

response to climate and forest structure. - Science of the

Total Environment 409: 4381–4386

Page 37: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

tundra

poušť

Page 38: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Více fotobiontů v jedné stélce

• v jednom lišejníku může být více

fotobiontů

• otázkou je, zda je to dáno „ontogenezí“

nebo je to cílený proces a stav

• není jasné, jak může být tento jev

dynamický (přesuny a výměny v „hotové“

stélce)

• lišejníku by to samozřejmě mohlo přinášet

značné výhody (Vančurová et al. 2018)

Page 39: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Metabarcoding

• DNA metabarcoding - the identification of organisms

from environmental samples using high-throughput

sequencing of standardized DNA barcodes

• taxonomic assessments of a wide range of microbial

groups from a variety of habitats in marine and terrestrial

ecosystems

• metabarcoding has also advanced our understanding of

the distribution, abundance, and community structure of

both symbiotic and free-living microorganisms

• Illumina MiSeq, Ion Torrent, or PacBio platforms

Page 40: Department of Botany - Zajímavé problémy v botanice · 2020-01-10 · Cyanobacteria Eukaryotic algae Anabaena Nostocales Asterochloris Trebouxiophyceae Aphanocapsa (Synechococcales)

Konec

Za poskytnuté fotografie děkuji Š. Slavíkové, D. Svobodovi (Peltigera), P. Škaloudovi

(zelené kokální řasy) a dalším tvůrcům.


Recommended