KLINICKÁ MIKROBIOLOGIE

MUDr. Pavel Čermák, CSc.

Meningitis

Původce

věk20 60

P

N

HS

PNeisseria meningitis A, B, C

N

Streptococcus pneumoniae

Haemophillus influenzae

S Streptococcus agalactiae (sk.B)

Klinika

- akutní až PERAKUTNÍ průběh- sepse – v akutní fázi průnik bakterií do krve, petechie- pneumokoky !!! infaustní šok (destrukce bakt. těl)

-zdroj meningokok. infekce = nosič (5% populace?)v nasofaryngu

- hemofily (v krku) – u očkované populace „non B“ typy- streptokoky (pochva) – u matek preventivní kultivace- pneumokoky – chronická infekce středního uchau starší populace

-po zvládnutí meningitidy těžké infekční komplikaceventilátorové pneumonie, močové infekcesuperinfekce kvasinkami

- poškození CNS- dlouhodobá rehabilitace

Dg. - lumbální punkce - analýza moku- Mikroskopie – masivně velké polymoronukleáry,

bakterií relativně málo- latexová aglutinace – nutná dostatečná kvantita bakterií

-klasická kultivace – pomalá, neiserie rostou až 48 hod.- PCR

- !! Basilární TBC meningitída !!

RYCHLOST

Terapie - Ceftriaxon (Rocefin) 1- 2x denně- Chloramfenikol - hemofilové inf.- PNC, Ampicilin + der. - průnik do zanícených

mozkových blanostatní ATB nepronikají !!!

(Aseptické) meningoencefalitidy

Původce - viry (virus klíšťové encefalitidy, herpesviry, enteroviry, CMV)

Klinika - podobná bakteriální meningitidě, většinou lehčí průběhklíšťová encefalitida – většinou inaparentní infekce, můžebýt velmi těžká až letální průběh.

DG - v likvoru lymfocyty- PCR průkaz viru

Terapie – vakcinace- pasivní imunizace- antivirotika – podle původce (acyklovir – herpesviry,

gancyklovir – CMV)

Infekce horních cest dýchacích

Původce

Klinika

Dg.

- G+ koky - streptokoky, stafylokoky- G- tyčky – H. influenzae

- mykoplasmata-rhinoviry, adenoviry, paramyxoviry, myxoviry-EB

katarální hnisavý zánět

-klas. kultivace, fluoresc. mikroskopie, -serologie

Infekce horních cest dýchacích

streptokoková angína

-Streptococcus pyogenes a další hemolyt. streptokoky (sk.C,G,B,F)

- výjimečně jiní původci

-pozdní následky – revmatická horečka (pošk. chlopní) a glomerulonefritis(zkřížená imunitní reakce – podobnáantigenní struktura)

-nosiči !!!

- kultivace, koaglutinace- ASLO (antistreptolysin O) – dynamika

(absolutní hodnota nic neříká)

streptokoková angína

katarální fázečepy

Terapiepenicilin (p.o., i.m.) nejúčinnější terapie, min. 5 dní, lépe 7 dnípouze u alergií na PNC makrolidy (!! statické, podstatně méně účinné)MLS streptokoky = rezistentní na makrolidy a linkosamidy !!!

opakované angíny – pátrat po nosiči, tonsilektomie

Infekce horních cest dýchacích

chř

ipka

Chřipka – typy A,B,Cinfluenzavirus A: H hemaglutinin

N neuraminidáza1918 H1N1 španělská chřipka1957 H2N2 asijská chřipka1968 H3N2 honkongská chřipka1997, 2003 H5N1 ptačí chřipka

drift = antigenní posun – mutace, menší změna Agshift = antigenní výměna – nový podtyp H,N

- není rýma! nespecifické horečnaté onemocnění až sepse, bronchitida,bakteriální superinfekce

-izolace na TK z nasofaryngeálního výplachu, stanovení protilátek, HIT- terapie

nespecifickáinhibitory proteinu M2 – amantadin, rimantadininhibitory neuraminidázy

očkování

Infekce horních cest dýchacích

Infekční mononukleóza

-EB virus- nemoc z „líbání“ – mladiství

- angína nereagující na ATB terapii- poškození jater

-krevní obraz – atypické buňky- Paul-Bunnelova reakce = heterofilní protilátky shlukující beraní erytrocytyELISA- VCA antigen – kapsulární antigen- protilátky proti VCA, EBNA (nukleární antigen)

- terapie symptomatická, podpůrná

Infekce horních cest dýchacíchSinusitis- první fáze virová- druhá fáze bakteriální 70% S.pneumoniae, H.influenzae.

25% B.catarrhalis

S.aureus, streptokoky, anaeroby

kultivace – obtížná, často kontaminace- tukutina z výplachu, rychlé zpracování, pozor na podchlazení

pneumokoky nevydrží

terapieamoxicilin a cotrimoxazolpotencované aminopeniciliny, tetracykliny – velmi dobrý průnik

méně časté infekce horních cest dýchacích

Akutní epiglotitidaděti 1 – 5 let, rychlá progrese, H.influenzae typ Bterapie – potencované aminopeniciliny, cefalosporiny II., III.očkování

PertusseBordetella pertussis – obtížná kultivace, speciální půdy, serologiev posledních letech zvýšený výskyterapie - makrolidyočkování

DiftérieC. dipthriae – očkování proti toxinu !!, pablánový zánět, obtížná kultivacepopsány případy výskytuterapie – peniciliny, cefalosporiny I., makrolidy

Infekce dolních cest dýchacíchPůvodce

Klinika

Dg.

Terapie

- G+ koky (pneumokoky, S. aureus, koag. neg. staf.)- G- tyčky (K. pneumoniae, P. aeruginosa a další)- mykoplasmata- TBC včetně atyp. MB- pneumocystis carini, vláknité plísně, legionelly

- bronchopneumonie pneumonie

- klas. kultivace obtížná, mikroskopie, serologie

- dle původce a citlivosti- peniciliny, makrolidycefalosporiny, chinolonyTTC

Bronchopneumonie, CHOPNCHOPN = chronická obstrukční choroba plicní

Akutní bronchopneumonie- viry + bakteriální superinfekce (S. aureus)- Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae

- obtížné zachycení patogenaIF, protilátky

- terapie – aminopeniciliny (potencované), cefalosporiny I., II.- makrolidy, tetracykliny

Chronická bronchopneumonievětšinou spojena s CHOPN

- kouření, horníci- životní prostředí

závažný problémsoučasné medicíny

CHOPN

akutní exacerbace

virová infekce

bakteriální superinfekce

Schäfer H a kol.:Therapie der schweren Exazerbation bei chronish obstructiver Lungener-

erkrankung (COPD).Intenzivmed 2000;37:176-186

50% obtížně identifikovatelné

kontaminace vzorku běžnou ústní flórous podmíněně patog.bakteriemi => interpretace výsledku

Problémy mikrobiol.diagnostiky

25-75% pac.s OCHPN má chronickoubakteriální kolonizaci i ve stabilní fázi

72% exacerbací se pouze zvyšuje množství těchto původců.44% tvoří enterobakterie a Stenotrophomonas

maltophilia.

původce nekultivovatelný citlivý na transport

Schäfer H a kol.:Therapie der schweren Exazerbation bei chronish obstructiver Lungener-

erkrankung (COPD).Intenzivmed 2000;37:176-186

Odběr materiálusputum, laryngeální výtěr

sputum, laryngeální výtěr kvantitativní vyšetření

chráněný kartáček

bronchoalveolární lavážkvantitativní vyšetření

Speich R a kol.:Low specifity of the bacterial index for thr diagnosis of bacterialpneumonia by bronchoalveolar lavage.Eur J Clin Microbiol Infect Dis 1998;17:78-84.

Monsó Ea kol.: Bacterial infection in chronic obstructive pulmonary disease. A studyof stable and exacerbated outpatients using the protected specimen brush.

Am J Respir Crit Care Med 1995;152:1316-1320.

Bakteriální patogeny

Streptococcus pneumoniaeHaemophillus infuenzaeBranhamella catarrhalis

EnterobacteriaceaePseudomonas aeruginosa

Stenotr.maltophilia

OCHPN

Sethi S, Murphy TF. Bacterial infection in chronic obstructive pulmonary disease in 2000:a state-of-the-art rewiew. Clin Microbiol Rev 2001;14(2):336-363.

Monsó E, Rosell A, Bonet G. Risk factors for lower airway bacterial colonization in chronic bronchitis. Eur Respir J 1999;13(2):338-42.

Eller J, Ede A, Schaberg T, Niederman MS. Infective exacerbations of chronic bronchitis:relation between bacteriologic etiology and lung function. Chest 1998; 113(6):1542-8.

Bakteriální patogeny

Sethi S, Ewans N, Grant BJ, Murphy TF. New strains of bacteria and exacerbationsof chronic obstructive pulmonary disease. N Engl J Med 2002;347(7):465-71.

Chronická kolonizaceNový patogen

akutní exacerbace

Bakteriální index (BI)

BI = suma x log10 CFU/ml BI >= 5

Ps.aeruginosa 105 BI = 5Kl.pneumoniae 102

Acin.baumanii 102

Candida albicans 101

BI = 5

X

! imunokompromitovanípacienti - bez exacerbace !

akutní exacerbace

Speich R a kol.:Low specifity of the bacterial index for thr diagnosis of bacterialpneumonia by bronchoalveolar lavage.Eur J Clin Microbiol Infect Dis 1998;17:78-84.

Bakteriální patogenyChlamydia pneumoniae

- akutní exacerbace ojediněle- neprokázán vztah k vývoji CHOPN- chronická infekce u CHOPN

Aspergillus sp. - terapie kortikosteroidy

Mycobacterium sp. - spíše příčina CHOPN

Clementsen Pa kol.: Chlamydia pneumoniae and chronic obstructive pulmonary disease:

bronchial biopses (PCR and culture) and specific serum antibodies in patients and controls.

Inflamm.res. 2000; 49 Supplement 1:37-38.

Lieberman D a kol.: Chlamydia pneumoniae infection in acute exacerbations of chronic

obstructive pulmonary disease: analysis of 250 hospitalizations. Eur J Clin Microbiol Infect

Dis 2001;20:698-704.

Kistemann T a kol.: Role of increased environmental Aspergillus exposure for patients with

chronic obstructive pulmonary disease (COPD) treated with corticosteroids in an intensive

unit. International Journal of Hygiene and Environmental Health 2002;204(5-6):347-351.

Vlastní výsledky

ÚKM FN Hradec Králové: �Fakultní nemocnice�okolní nemocnice – Nový Bydžov, Rychnov n.K., ….� praktičtí lékaři a ambulantní specialisté

Období 1.1.2001 – 31.12.2002

Celkem: 3937 materiálů z dýchacích cest1527 pacientů

Počty mikrobiologických vyšetření

393719661971Celkem

239117122BAL

2367988Trach.výtěr

221511921023sputum

265137128Laryng.výt.

1051441610Výtěr HCD

Celkem20022001Materiál

Zachycené bakteriální patogeny

627967241H.influenzae

15014S.pneumoniae

5281034Beta hem.

streptokoky

BALsputumlaryng. výtěr

výtěr HCD

Zachycené bakteriální patogeny

110111Stenotroph.

matophilia

739104120Klebsiella

pneumoniae

1271118218Pseudomon.aeruginosa

naso

phar.

vytěr

trach.vytěr

BALsputumlaryng. vytěr

Komunitní pneumonie

získané mimo nemocnici80 – 90% všech pneumonií- typické pneumonie – S.pneumoniae, H. influenzae, B. catarrhalis, S.aureus…- atypické pneumonie – M.pneumoniae (30%), Ch.pneumoniae (10%),

respirační viry (RSV)v max. 50% případů je znám původce, většinou pneumokoky

-až těžký průběh, v minulosti vysoká úmrtnost

- mikroskopické a kultivační vyšetření sputa (kvantita!!!)hemokultivace (pneumokokové pneumonie !!!)průkaz antigenu – moč, sputum (pneumokoky)protilátky – atypické pneumonie

terapie- aminopeniciliny (potencované), cefalosporiny II.,III., aminoglykosidy, fluorochin.- makrolidy, tetracykliny

ventilátorové pneumonieventilovaní pacienti – riziko pneumonie denně o 2-3%endogenní infekceexogenní infekce – ruce personálu, zevní prostředí, ventilátory

K.pneumoniae, P.aeruginosa, S.maktophilie, S.marcescens, S.aureus

BAL, tracheální aspirát, sputum – kvantitativní kultivace !!!

terapiesystémová ATB dle citlivosti . cefalosporiny III., IV., monobactamykombinace s aminoglykosidy, fluorochinolony

problém ATB rezistenceselektivní dekontaminace střevadodržování hygienyaspirace

K.pneumoniae

Výskyt rezistentních kmenů K. pneumoniae

cystická fibrózadědičné onemocnění postihující hlavně plíce a pankreas- chronické infekce DCD – P. aeruginosa, Stenotrophomonas.maltophilia,

Burkholderia cepacia, K. pneumoniae, - pomalu rostoucí- dlouhodobé podávání ATB rezistentní kmeny

méně obvyklé plicní infekce

SARS – Severe Acute Respiratory Syndromekoronaviry, Asie – Čína, Hongkong, Tchai-wan

Legionelózy – Legionella pneumophila

legionářská nemoc – těžší průběh, pneumoniepontiacké horečka – lehčí průběhoslabení jedinci, OCHPN, častěji muži- rozvody teplé vody, slepé větve, plastové trubky- antigen v moči, sputu, kultivace sputa, přímá IF sputaterapie – fluorochinolony, makrolidy

AktinomykózaAspergilózy – difusní, plicní aspergilom-průkaz antigenu, kultivaceNokardiózy – imunodeficience (transplantace), pneumocystózy - AIDS