Mikrobiologický ústav MUMikrobiologický ústav MU, Brno, Brno

Vladana WoznicováVladana Woznicová

Miroslav Votava Miroslav Votava

Ondřej ZahradníčekOndřej Zahradníček

Klinická mikrobiologieKlinická mikrobiologie

Zubní lékařství podzim 2015Zubní lékařství podzim 2015

Původci respiračních infekcíPůvodci respiračních infekcí

Význam respiračních infekcíVýznam respiračních infekcí

•• nejčastějšínejčastější infekce (dýchací trakt = inkubátor)infekce (dýchací trakt = inkubátor)

•• ekonomický dopadekonomický dopad

•• časté časté epidemie epidemie

•• 75 %75 % (u dětí i více) působí (u dětí i více) působí viryviry

LokalizaceLokalizace

•• klinická symptomatologie + specifická agensklinická symptomatologie + specifická agens

A) Infekce HCDA) Infekce HCD a oka, ucha, dutin a oka, ucha, dutin

B) Infekce DCDB) Infekce DCD (dolních cest dýchacích a (dolních cest dýchacích a

plic)plic)

Infekce HCDInfekce HCD

–– infekce infekce nosu a nasopharynxunosu a nasopharynxu

–– infekce infekce oropharynxu aoropharynxu a tonsiltonsil

–– infekce infekce paranasálních sinusůparanasálních sinusů

–– otitis mediaotitis media

–– conjunctivitisconjunctivitis

Infekce DCD a plicInfekce DCD a plic

-- infekce infekce epiglottisepiglottis

-- infekce infekce larynxularynxu and and tracheytrachey

-- infekce infekce bronchůbronchů

-- infekce infekce bronchiolůbronchiolů

•• infekce infekce plicplic

Běžná flóra dýchacích cestBěžná flóra dýchacích cest

•• Dutina nosní:Dutina nosní: S. epidermidisS. epidermidis, koryneformní tyčinky, S. aureusS. aureus, pneumokokypneumokoky

•• Pharynx:Pharynx: vždyvždy neisseriae a streptokoky neisseriae a streptokoky (viridující)(viridující), obvykle hemofily, vzácněji pneumokoky, meningokoky, enterobacteriae, kvasinkykvasinky

•• DCDDCD sterilnísterilní, klinický materiál často kontminován flórou HCD

Běžná flóra dýchacích cestBěžná flóra dýchacích cest

•• Dutina nosní:Dutina nosní: S. epidermidisS. epidermidis, koryneformní tyčinky, S. aureusS. aureus, pneumokokypneumokoky

•• Pharynx:Pharynx: vždyvždy neisseriae a streptokoky neisseriae a streptokoky (viridující)(viridující), obvykle hemofily, vzácněji pneumokoky, meningokoky, enterobacteriae, kvasinkykvasinky

•• DCDDCD sterilnísterilní, klinický materiál často kontminován flórou HCD

Rhinitis/nasopharyngitis Rhinitis/nasopharyngitis -- ETIOLOGIEETIOLOGIE

•• ViryViry –– „nachlazení“„nachlazení“::

–– Víc než 50 % rhinoviryVíc než 50 % rhinoviry

–– koronaviry koronaviry

–– další respirační viry (ne chřipka!)další respirační viry (ne chřipka!)

•• BakterieBakterie: :

–– Akutní Akutní infekce: obvykle sekundárníinfekce: obvykle sekundární

•• S. aureus, H. influenzae, S. pneumoniae, S. aureus, H. influenzae, S. pneumoniae,

Moraxella catarrhalisMoraxella catarrhalis

–– Chronické Chronické infekce: infekce:

•• Klebsiella ozaenae, Kl. rhinoscleromatisKlebsiella ozaenae, Kl. rhinoscleromatis

Rhinitis/nasopharyngitis Rhinitis/nasopharyngitis -- LÉČBALÉČBA

•• Nevyžaduje antibiotikaNevyžaduje antibiotika a a bakteriologické vyšetřeníbakteriologické vyšetření

•• Polymorfonukleáry, vysoké CRP Polymorfonukleáry, vysoké CRP markery bakt. markery bakt.

Infekce, léčba podleInfekce, léčba podle výsledků bakteriologického výsledků bakteriologického

vyšetřenívyšetření

•• Lokální terapie Lokální terapie -- nosičinosiči epidemiolgicky závažných epidemiolgicky závažných

patogenůpatogenů -- např. MRSA např. MRSA –– mupirocin (Bactroban)mupirocin (Bactroban)

Sinusitis/otitis media Sinusitis/otitis media –– ETIOLOGIE ETIOLOGIE

•• AkutníAkutní sinusitis a otitis začínají infekcemisinusitis a otitis začínají infekcemi

respiračními viryrespiračními viry, , M. pneumoniae M. pneumoniae (myringitis)(myringitis)

•• Sekundární Sekundární pyogenní infekcepyogenní infekce: :

S.S. pneumoniaepneumoniae, , H. influenzae H. influenzae bb, Moraxella , Moraxella

catarrhalis, S. aureus, S. pyogenes, catarrhalis, S. aureus, S. pyogenes, anaeroby anaeroby

((BacteroidesBacteroides, , PrevotellaPrevotella, , Porphyromonas...Porphyromonas...))

KomplikaceKomplikace: mastoiditis, purulentní meningitis : mastoiditis, purulentní meningitis

Sinusitis/otitis media Sinusitis/otitis media –– ETIOLOGIEETIOLOGIE

•• SinusitisSinusitis maxillaris maxillaris chronicachronica, sinusitis , sinusitis

frontalis chronica: frontalis chronica: S. aureusS. aureus, ,

PeptostreptococcusPeptostreptococcus

•• OtitisOtitis media media chronicachronica: : Pseudomonas Pseudomonas

aeruginosa, Proteus mirabilisaeruginosa, Proteus mirabilis

Sinusitis/otitis media Sinusitis/otitis media -- LÉČBALÉČBA

•• Vhodný vzorekVhodný vzorek –– punktát ze středního ucha apunktát ze středního ucha a

paranasálního sinu; NE výtěr z nosu, ucha paranasálního sinu; NE výtěr z nosu, ucha

(kontaminanty)(kontaminanty)

•• Sinusitis Sinusitis ATB pouze uATB pouze u bolestivé sinusitidybolestivé sinusitidy, s bolestí, s bolestí zubůzubů, ,

hlavy, horečkou, trvající nejmíň týden, ev. neuralgie hlavy, horečkou, trvající nejmíň týden, ev. neuralgie

trigeminutrigeminu

•• Otitis mediaOtitis media -- ATB u zánětu (bolest, zarudnutí, horečka), ATB u zánětu (bolest, zarudnutí, horečka),

když antiinflamatorní léčba nedostačujekdyž antiinflamatorní léčba nedostačuje

•• Aminopenicilin nebo cefalosporin 1.generace Aminopenicilin nebo cefalosporin 1.generace

http://www.drgreene.org/body.cfm?xyzpdqabc=0&id=21&action=detail&ref=1285

Otitis media

http://www.medem.com/Me

dLB/article_detaillb.cfm?arti

cle_ID=ZZZPMV6D1AC&su

b_cat=544

http://www.otol.uic.edu/rese

arch/microto/Microtoscopy/

acute1.htm

• Agens jako u sinusitidy

Konjunktivitis Konjunktivitis -- ETIOLOGIE ETIOLOGIE

•• Obvykle Obvykle virová, virová, u akutních infekcí HCD u akutních infekcí HCD

adenovirus, enterovirusadenovirus, enterovirus -- hemorrhagická conjunctivitis, hemorrhagická conjunctivitis,

HSVHSV -- herpetic keratoconjunctivitisherpetic keratoconjunctivitis

•• Bakteriální Bakteriální

a. a. Akutní:Akutní:

hnisavá konjunktivitis: hnisavá konjunktivitis: S. pneumoniae, S. aureusS. pneumoniae, S. aureus

inkluzní konjunkt.: inkluzní konjunkt.: C. trachomatisC. trachomatis D D –– KK

b. b. Chronická:Chronická: S. aureusS. aureus, , C. trachomatisC. trachomatis A A –– C (trachoma)C (trachoma)

•• Alergická, mechanická Alergická, mechanická (cizí těleso)(cizí těleso)

•• Obvykle Obvykle topická topická léčbaléčba

Orofaryngeální infekce Orofaryngeální infekce -- ETIOLOGIEETIOLOGIE

•• Akutní tonsillitis a pharyngitis:Akutní tonsillitis a pharyngitis:

obvykle obvykle virovávirová (rhinoviry, coronaviry, adenoviry, (rhinoviry, coronaviry, adenoviry, EBV EBV –– inf. mononucleosis, coxsackieviry inf. mononucleosis, coxsackieviry –– herpangina)herpangina)

Nejvýznamnější bakteriálníNejvýznamnější bakteriální: : S. pyogenesS. pyogenes (= (= ββ-- hemol. streptokok hemol. streptokok skupiny Askupiny A))

•• Streptokoky skupiny C, F, G, pneumokoky, Streptokoky skupiny C, F, G, pneumokoky, H. influenzaeH. influenzae, , N. meningitidisN. meningitidis

•• Vzácné, ale Vzácné, ale důležitédůležité: : Corynebacterium diphtheriae, Corynebacterium diphtheriae, Neisseria gonorrhoeaeNeisseria gonorrhoeae

Orofaryngeální infekce Orofaryngeální infekce -- LÉČBALÉČBA

•• Výtěr z krku u všech případů Výtěr z krku u všech případů , vč. „typické , vč. „typické

tonsilitidy“tonsilitidy“

•• Streptococcus pyogenesStreptococcus pyogenes -- penicilinpenicilin

•• Makrolidy u alergických pacientů (rezistence, horší Makrolidy u alergických pacientů (rezistence, horší

efekt)efekt)

•• stanovení CRPstanovení CRP (marker bakteriální infekce) (marker bakteriální infekce)

Tonsillopharyngitis

http://medicine.ucsd.edu/Clinicalimg/He

ad-Pharyngitis.htm

http://www.newagebd.com/2005/sep/12

/img2.html

Virová tonsillopharyngitis

http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b1/Pharyngitis.jpg/250px-

Pharyngitis.jpg

Hnisavá bakt. tonsillitis http://www.meddean.luc.edu/lumen/MedEd/medicine/PULMONAR/diseases/pul43b.htm

Epiglottitis

http://health.allrefer.com/health/epiglottitis-throat-

anatomy.html

de.wikipedia.org/wiki/

Epiglottitis

George Washington

www.fathom.com/course/10701018/session4.html

EpiglottitisEpiglottitis

•• Riziko udušení!Riziko udušení!

•• Haemophilus influenzaeHaemophilus influenzae typ b typ b -- vakcinacevakcinace

Laryngitis a tracheitisLaryngitis a tracheitis

RespiračníRespirační viry viry (jiné než u(jiné než u nasopharyngitis):nasopharyngitis):

parainfluenza/influenzaparainfluenza/influenza A A && RSVRSV

Symptomatická léčba Symptomatická léčba –– NE ATBNE ATB

BakteriálníBakteriální

•• Chlamydophila pneumoniaeChlamydophila pneumoniae, , Mycoplasma pneumoniaeMycoplasma pneumoniae, , sekundární: sekundární: S. aureusS. aureus a a Haemophilus influenzae, Haemophilus influenzae, laryngotracheitis pseudomembranosa (záškrt): laryngotracheitis pseudomembranosa (záškrt): Corynebacterium diphtheriaeCorynebacterium diphtheriae

•• Výtěr z krku obvykle bezcenný Výtěr z krku obvykle bezcenný

Lagyngitis acuta

http://www.emedicine.com/asp/image_search.as

p?query=Acute%20Laryngitis

www.cartoonstock.com/directory/l/laryngitis.asp

Bronchitis Bronchitis -- ETIOLOGIEETIOLOGIE

•• Akutní bronchitis:Akutní bronchitis:

chřipka, parainfluenza, adenoviruses, RSV , parainfluenza, adenoviruses, RSV

Bakteriální Bakteriální -- sekundární: pneumokoky, haemofily, sekundární: pneumokoky, haemofily,

stafylokoky, moraxelystafylokoky, moraxely

Bakteriální Bakteriální -- primární: primární: MycoplasmaMycoplasma pneumoniae,pneumoniae,

Chlamydophila pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, BordetellaBordetella pertussispertussis

•• Chronická bronchitisChronická bronchitis (cystická fibrosa): (cystická fibrosa):

Pseudomonas aeruginosa, Burholderia cepaciaPseudomonas aeruginosa, Burholderia cepacia

Bronchitis acutaBronchitis acuta http://www.yourlunghealt

h.org/lung_disease/copd

/nutshell/index.cfm

http://www.lhsc.on.ca/resptherapy/students/p

atho/brnchit5.htm

BronchiolitisBronchiolitis •• Izolovaná bronchiolitida uIzolovaná bronchiolitida u novorozenců novorozenců

a kojencůa kojenců::

PneumovirusPneumovirus (= (= RSVRSV))

MetapneumovirusMetapneumovirus

https://www.nlm.nih.gov

PneumoniePneumonie

www.medicin

enet.com/pn

eumonia/arti

cle.htm

Typy pneumoniíTypy pneumonií

•• Akutní Akutní –– komunitní (communitykomunitní (community--acquired pneumonia acquired pneumonia CAP)CAP)

– u původně zdravých

• dospělých

• dětí

– u oslabených – Po kontaktu se zvířaty (Pasteurella multocida, Coxiella

burnetii - Q-horečka, Chlamydophila psittaci - psittakóza)

•• Akutní Akutní –– nosokomiálnínosokomiální pneumoniepneumonie

- ventilátorové

a) časné

b) pozdní

•• Subakutní a chronické pneumonieSubakutní a chronické pneumonie

Pneumoniae Pneumoniae –– ETIOLOGIEETIOLOGIE

AkutníAkutní komunitníkomunitní

•• bronchopneumoniabronchopneumonia a lobární pneumonia:a lobární pneumonia:

–– Streptococcus pneumoniaeStreptococcus pneumoniae

–– S. aureusS. aureus

–– Haemophilus influenzae Haemophilus influenzae typ btyp b

•• atypická pneumonie:atypická pneumonie:

–– Mycoplasma pneumoniaeMycoplasma pneumoniae

–– Chlamydophila pneumoniaeChlamydophila pneumoniae

–– Influenza A virus Influenza A virus

Pneumoniae Pneumoniae –– ETIOLOGIE IIETIOLOGIE II

AkutníAkutní komunitní, u oslabenýchkomunitní, u oslabených::

–– pneumokoky, stafylokoky, haemofilypneumokoky, stafylokoky, haemofily

–– KlebsiellaKlebsiella pneumoniaepneumoniae (alkoholici)(alkoholici)

–– LegionellaLegionella pneumophilapneumophila

•• ImunodeficicityImunodeficicity::

–– Pneumocystis jiroveciiPneumocystis jirovecii

–– CMVCMV

–– atypical mycobacteriaatypical mycobacteria

–– Nocardia asteroidesNocardia asteroides

–– aspergilli, candidaeaspergilli, candidae

Pneumoniae Pneumoniae –– ETIOLOGIE IIIETIOLOGIE III

AkutníAkutní nosokomiální:nosokomiální:

•• VentilátorováVentilátorová -- VAP:VAP:

–– časnáčasná (do 4. dne hospitalizace):(do 4. dne hospitalizace):

citlivé citlivé komunitníkomunitní kmenykmeny

–– pozdní pozdní (od 5. dne):(od 5. dne):

rezistentní rezistentní nemocniční kmenynemocniční kmeny

•• DalšíDalší

–– viry (RSV, CMV)viry (RSV, CMV)

–– LegionellaLegionella

Pneumoniae Pneumoniae –– ETIOLOGIE IVETIOLOGIE IV

•• Subakutní a chronické:Subakutní a chronické:

–– aspiračníaspirační pneumonie a plicní abscespneumonie a plicní absces

•• PrevotellaPrevotella melaninogenicamelaninogenica

•• BacteroidesBacteroides fragilisfragilis

•• peptokoky a peptokoky a peptostreptokokypeptostreptokoky

–– plicní tuberkulóza a mykobakteriózyplicní tuberkulóza a mykobakteriózy

•• Mycobacterium tuberculosisMycobacterium tuberculosis

•• Mycobacterium bovisMycobacterium bovis

•• atypická mykobaktériaatypická mykobaktéria

PneumoniePneumonie

http://www.uspharmacist.com/in

dex.asp?page=ce/105057/defau

lt.htm

BronchopneumoniaBronchopneumonia

www.szote.u-szeged.hu/radio/mellk1/amelk4a.htm

See the inhomogenous shadow in the lower and middle lobes of the right lung

Lobární a lobulární pneumonie

www.supplementnews.org/

pneumonia

Infekce plic Infekce plic -- vyšetřenívyšetření

•• Klinické vyšetření a RTG, rozlišení klasickáKlinické vyšetření a RTG, rozlišení klasická atypická pneumonieatypická pneumonie

•• Klasická pneumonie Klasická pneumonie -- sputumsputum, krev na , krev na hemokulturu, hemokulturu, S. pneumonie Ag v močiS. pneumonie Ag v moči

•• Atypická pneumonie Atypická pneumonie -- serologieserologie -- mykoplasma a mykoplasma a chlamydophila (+ „viral screen“).chlamydophila (+ „viral screen“).

•• Nemocniční pneumonieNemocniční pneumonie LegionellaLegionella –– Ag v močiAg v moči

Bronchitis a pneumonie Bronchitis a pneumonie -- léčbaléčba

•• CAP CAP amoxicilinamoxicilin + ev. makrolid+ ev. makrolid

•• Atypická pneumoniae Atypická pneumoniae tetracyklin nebotetracyklin nebo (děti < 8) (děti < 8)

makrolidymakrolidy

•• Kombinovaná terapieKombinovaná terapie

•• U nemocničníchU nemocničních infekcí infekcí -- citlivostcitlivost -- rezistence!rezistence!

•• TB kombinační terapie TB kombinační terapie

Gerrit Dou (1613 Gerrit Dou (1613 -- 1675) 1675)

LékařLékař