Proteinové inženýrství Josef „Faskal“ Novák

Dogma molekulární biologie

• Tok informací v buňce

– Kde se může stát chyba? Všude

– Kde ji opravit? Na DNA!

Určování struktury proteinů Krystalografie

• Proč krystaly? Obsahují opakující se jednotky

• Konstruktivní interference (Braggův zákon)

Odbočka - DNA

Nezapomenout:

Šroubek a laserové ukazovátko

Proteiny

• Výpočetně velmi náročné

• Kvalita závisí na kvalitě krystalu a měření

• Může obsahovat chyby

Fold It!

Další metody určování struktury

• Jaderná magnetická resonance

– Hlavně na malé molekuly

• Mrazová elektronová mikroskopie

– Hlavně velké struktury

Celkem

Jenom NMR

Jenom CryoEM

Myoglobin, původní model z plastelíny

GFP

• Aequorea victoria

• První mutace objeveny náhodou, další uměle připravené

• Martin Chalfie, Osamu Shimomura and Roger Y. Tsien 2008 – Nobelova cena

Hledání léků

• Hledání malé molekuly, která by přesně seděla do klíčového místa proteinu

Čas na diskuzi

Děkuji za pozornost

Mgr. Josef „Faskal“ Novák faskal@seznam.cz

josef.novak@natur.cuni.cz