+ All Categories
Home > Documents > konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. ·...

konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. ·...

Date post: 29-Mar-2021
Category:
Upload: others
View: 3 times
Download: 0 times
Share this document with a friend
49
konfokální mikroskopie (CLSM) Confocal Laser Scanning Microscopy
Transcript
Page 1: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

konfokální mikroskopie

(CLSM)

Confocal

Laser

Scanning

Microscopy

Page 2: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

fluorescenční zobrazení jednoho bodu

vzorek

objektivová čočka

excitační světlo zobrazovací čočka

emitované světlo

problém je fluorescence emitovaná z nezaostřěné roviny na vzorku

kamera

Page 3: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

konfokální mikroskop

vzorek

objektivová čočka

excitační světlo zobrazovací čočka

emitované světlo

pinhole

detektor

systém se pohybuje po vzorku a excituje bod po bodu, z toho následně

vytváří celkový obraz

Page 4: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

CONFOCAL Laser Scanning Microscopy

CONFOCAL = conjugated focal plane

Page 5: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

CONFOCAL Laser Scanning Microscopy

Page 6: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

principy fluorescenčního snímání

široké „widefield“ osvětlení bodové „point“ osvětlení

Page 7: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

The Point Spread Function (PSF)

Z=0

Z=+2µm

Z=-2µm

2D PSF for different defocus

image bodového objektu

x

y

Page 8: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

Measured

x

z Calculated

The Point Spread Function (PSF)

Z=0

Z=+2µm

Z=-2µm

2D PSF for different defocus

image bodového objektu

x

y

3D PSF

Page 9: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

„out of focus“ signál rozostřuje výsledný obraz „out of focus“ signál je blokován

porovnání fluorescenční a konfokální mikroskopie

fluorescenční konfokální

Page 10: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

porovnání fluorescenční a konfokální mikroskopie

Page 11: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

porovnání fluorescenční a konfokální mikroskopie

Page 12: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

Confocal LASER Scanning Microscopy

Page 13: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

Confocal LASER Scanning Microscopy

Page 14: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

Confocal LASER Scanning Microscopy

Page 15: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

Confocal LASER Scanning Microscopy

Page 16: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

Confocal LASER Scanning Microscopy

Page 17: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

Confocal Laser SCANNING Microscopy

Page 18: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

galvano-skenovací zrcátko

Confocal Laser SCANNING Microscopy

Page 19: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

optické řezy a 3D rekonstrukce

x y

z

Page 20: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

x y

z

optické řezy a 3D rekonstrukce

Page 21: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

x y

z

=

optické řezy a 3D rekonstrukce

Page 22: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

Confocal Laser SCANNING Microscopy

Page 23: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

Confocal Laser SCANNING Microscopy

Page 24: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

Confocal Laser SCANNING Microscopy

Page 25: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

spektrální detekce fluorescenčního signálu

Page 26: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

spektrální detekce fluorescenčního signálu

Page 27: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

velice nízká úroveň šumu a dramatická amplifikace signálu (~1x10)

detekce a amplifikace fluorescenčního signálu

Page 28: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

multifunkční systém

Confocal Laser Scanning Microscopy

Page 29: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

multifunkční systém

Confocal Laser Scanning Microscopy

Page 30: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

„bleed‐through“ (prosvítání) při emisi

Page 31: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

porovnání fluorescenční a konfokální mikroskopie

Page 32: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

„bleed‐through“ (prosvítání) při emisi

Page 33: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

„bleed‐through“ (prosvítání) při emisi

Page 34: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

„bleed‐through“ (prosvítání) při emisi

Page 35: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

spektrální detekce při emisi

Detekce celého spektra prostřednictvím 32

kanálů na vzorku značeného DAPI a Alexa 488

Page 36: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

spektrální detekce a separace signálů

Page 37: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

spektrální detekce a separace signálů

Page 38: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

spektrální detekce a separace signálů

Page 39: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

3-D projekce dat – rekonstrukce objektu z optických řezů v

jednoduchém 2-D obraze

volume rendering – zobrazení 3-D dat z různých uhlů

pohledu

time-lapse data – zobrazení dat jako sekvence jednotlivých

optických řezů, nebo 2-D projekce

několika optických řezů v čase

základní funkce konfokální mikroskopie

Page 40: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

Optické řezy

Page 41: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

3D-rekonstrukce

Page 42: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

3D-rekonstrukce

Page 43: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací
Page 44: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací
Page 45: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací
Page 46: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

Pokročilé analýzy

Page 47: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

Pokročilé analýzy

Page 48: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

Pokročilé analýzy

Page 49: konfokální mikroskopie (CLSM)cr-hana.upol.cz/cellbiol/bilder/BRB/BRB3.pdf · 2017. 11. 28. · konfokální mikroskop vzorek objektivová čočka excitační světlo zobrazovací

Pokročilé analýzy


Recommended