Význam geochemického modelování
Geochemické modelování jako nástroj pro pochopení procesů
Josef Zeman2017
Časový harmonogram
Josef Zeman 2
Obsah
1 Základní principy
2 Vodné prostředí
3 Rozpustnost pevných látek
4 Rozpuštěné plyny
5 Pokročilé modelování
6 Úplný model pH-redox systémů
7 Kinetika reakcí
8 Vyhodnocení reálných dat
9 Literatura
1 Základní principy
Je třeba si uvědomit, že …
❖ model sám o sobě nic nevyřeší
❖ je třeba mít nějakou představu o systému, který je modelován
❖ je třeba klást otázky, na které je požadována odpověď (jinak není možné se něco dozvědět, nebo se získají údaje, které nejsou pro řešení problému významné)
❖ je třeba začínat od nejjednodušší představy
Josef Zeman 1 Základní principy 4
Je třeba respektovat, že …
❖ model nemůže postihnout a popsat realitu v její úplnosti a komplexní složitosti
❖ model slouží ke zkoumání a je cestou k porozumění určitým stránkám reality, které nás bezprostředně zajímají
❖ neexistuje ideální nebo nejlepší program
❖ každý program má své přednosti, schopnosti a omezení
❖ existuje jen program, který nejlépe naplní požadavky a očekávání uživatele
Josef Zeman 1 Základní principy 5
Úvod do geochemického modelování…
❖ není o ovládání určitého programu
❖ je o principech, které je nutné znát či respektovat při geochemickém modelování
❖ se stejnými výsledky je možné modelovat v různých programech
❖ Geochemist‘s Worbench❖ snadné zadání úloh❖ snadné zobrazení výsledků❖ provázání jednotlivých typů úloh❖ svázáno s jednotnou databází dat z reálných systémů
Josef Zeman 1 Základní principy 6
Klíčové principy
❖ geochemické modelování je založeno na dvou principech, které leží v samotné podstatě „Světa“ (Vesmíru, Universa, Všehomíra, …)
❖ zachování veličiny, kterou označujeme jako „energie“❖ při jakékoliv změně růst veličiny, kterou označujeme jako „entropie“
❖ tím získáváme odpověď na otázky
❖ Jaké probíhají v „Přírodě“ procesy či změny?Jen takové, při kterých se zachovává energie.
❖ Kterým směrem probíhají?Ve směru zvyšování entropie. Při dosažení maximální hodnoty entropie dosáhl systém rovnováhy (za daných podmínek stabilního stavu).
Josef Zeman 1 Základní principy 7
Klíčové principy
❖ měřítkem je Gibbsova funkce či z ní odvozené rovnovážné konstanty
❖ geochemické modelování není povrchovým obrazem jevů kolem nás a v nás („skořápkou“), ale ukazuje samotnou podstatu procesů
minimalizace hodnoty Gibbsovy funkce
Josef Zeman 1 Základní principy 8
2
3 3
A B C D
HCO H CO
a b c d
Řešení
❖ řešení systému nelineárních rovnic
❖ rovnice působení hmotnosti
❖ rovnice hmotových bilancí
❖ rovnice elektroneutrality
❖ Newtonova-Raphsonova metoda
Josef Zeman 1 Základní principy 9
C D
A B
c d
a b
a aK
a a C D
A B
0c d
a b
a aK
a a
X X
i
i
M m X X 0i
i
m M
i i i i
i i
z m z m 0i i i i
i i
z m z m
Terminologie
❖ složkycelková koncentrace daného prvku
❖ speciekonkrétní forma prvku v roztoku
❖ aktivityhodnota koncentrace, jakou by měla látka, kdyby se chovala ideálně
Josef Zeman 1 Základní principy 10
22 2 3 0
4Fe Fe Fe OH Fe Fe OH FeSOsložka
2
3 2 2 3 3 3 4HCO CO ( ) H CO HCO CO CHsložka
aq aq
22 3 0
4Fe , Fe OH , Fe , Fe OH , FeSO ,
A Aa c
Aktivita
Josef Zeman 1 Základní principy 11
Model
❖ modeluje se vodný roztok
❖ rovnováha s plynnou či pevnou fází slouží k definování okrajových podmínek
❖ modeluje se rovnováhav reálných systémech téměř neexistuje (je to ideál)
❖ přesto velmi užitečné❖ je systém v rovnováze?❖ jaký by byl za daných podmínek rovnovážný stav?❖ co se stane když… (změna vnějších podmínek, změna koncentrací, vstup dalších látek…)?
❖ transportně-reakční modelování
Josef Zeman 1 Základní principy 12
Vstupy
❖ Textový soubor ❖ Menu
temperature = 25
H2O = 1 kg
swap CO2(g) for HCO3-
CO2(g) = -3.5 log fugacity
swap O2(g) for O2(aq)
O2(g) = .2 fugacity
Al+++ = 1e-20 mol
Ca++ = 1e-15 mol
Cl- = 1e-20 mol
K+ = 1e-20 mol
Mg++ = 1e-20 mol
Na+ = 1e-20 mol
SO4-- = 1e-15 mol
SiO2(aq) = 1e-20 mol
H+ = 1e-4 mmolal
balance on H+
react .1 mmol of Montmor-Ca
Josef Zeman 1 Základní principy 13
script
Výstupy
❖ Textové
Step # 0 Xi = 0.0000
Temperature = 23.4 C Pressure = 1.013 bars
pH = 6.910 log fO2 = -52.363
Eh = 0.0530 volts pe = 0.9008
Ionic strength = 0.099157
Activity of water = 0.999865
Solvent mass = 0.998910 kg
Solution mass = 1.004626 kg
Solution density = 1.014 g/cm3
Chlorinity = 0.003925 molal
Dissolved solids = 5690 mg/kg sol'n
Rock mass = 0.000000 kg
Carbonate alkalinity= 505.55 mg/kg as CaCO3
No minerals in system.
Aqueous species molality mg/kg sol'n act. coef. log act.
---------------------------------------------------------------------------
SO4-- 0.02235 2135. 0.3567 -2.0984
Na+ 0.02071 473.5 0.7775 -1.7930
Mg++ 0.01022 246.9 0.4512 -2.3363
HCO3- 0.009136 554.3 0.7847 -2.1446
Ca++ 0.006923 275.9 0.4072 -2.5499
MgSO4 0.006208 742.9 1.0000 -2.2071
CaSO4 0.004739 641.4 1.0000 -2.3243
Josef Zeman 1 Základní principy 14
fyz.-chem. parametry
koncentrace specií
Výstupy
❖ Textové
Mineral saturation states
log Q/K log Q/K
----------------------------------------------------------------
CuFeO2(c) 11.6379s/sat Rhodochrosite 0.3079s/sat
Cronstedt-7A 11.2833s/sat Chalcedony 0.2319s/sat
Magnetite 10.2673s/sat Fe(OH)3(ppd) 0.2133s/sat
Hematite 10.1952s/sat Magnesite -0.0483
NiFe2O4 7.6164s/sat Cristobalite -0.0499
Ferrite-Cu 4.7400s/sat Ferrite-Ca -0.1752
Goethite 4.6215s/sat Gypsum -0.1977
Minnesotaite 3.1264s/sat Anhydrite -0.3908
Dolomite 2.0731s/sat Monohydrocalcite -0.5087
Dolomite-ord 2.0731s/sat Ferrosilite -0.5920
Siderite 1.5464s/sat Amrph^silica -0.7967
(only minerals with log Q/K > -3 listed)
Gases fugacity log fug.
-----------------------------------------------
CO2(g) 0.05680 -1.246
N2(g) 0.03453 -1.462
Steam 0.02820 -1.550
H2(g) 2.185e-016 -15.661
H2S(g) 2.169e-037 -36.664
CH4(g) 1.848e-041 -40.733
Josef Zeman 1 Základní principy 15
index nasycení
rovnovážné koncentrace plynů
Výstupy
❖ Textové
Reactants remaining reacted reacted reacted
-------------------------------------------------------------------------
Montmor-Ca 0.0003500 0.0000 0.0000
No minerals in system.
Aqueous species molality mg/kg sol'n act. coef. log act.
--------------------------------------------------------------------------
O2(aq) 0.0002528 8.088 1.0000 -3.5973
CO2(aq) 1.074e-005 0.4728 1.0000 -4.9689
H+ 2.210e-006 0.002228 0.9983 -5.6563
HCO3- 2.205e-006 0.1346 0.9983 -5.6573
(only species > 1e-8 molal listed)
In fluid Sorbed Kd
Original basis total moles moles mg/kg moles mg/kg L/kg
-------------------------------------------------------------------------
Al+++ 1.00e-020 1.00e-020 2.70e-016
Ca++ 1.00e-015 1.00e-015 4.01e-011
Cl- 1.00e-020 1.00e-020 3.55e-016
Josef Zeman 1 Základní principy 16
reagující minerálya minerály v systémupo dosažení rovnováhy
koncentrace specií
celkové složení
0 2 4 6 8 10 12 14
–.5
0
.5
1
pH
Eh
(vo
lts)
HCO3-
Methane(aq)
CO2(aq)
CO3--
C
25°C
Výstupy
❖ Grafické
Josef Zeman 1 Základní principy 17
0 50 100 150 2000
20
40
60
80
100
120
140
Calcite reacted (μmoles)
So
me
sp
ecie
s (
μm
ola
l)
CO2(aq)
CO3
2–
Ca2+
CaCO3(aq)
CaHCO3
+CaOH
+
HCO3
– OH–
vývoj parametrů systému(reakční cesta)
stabilitní diagram
3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 130
.1
.2
.3
.4
.5
.6
.7
.8
.9
1
1.1
pH
So
me
sp
ecie
s w
/ H
CO
3- (m
mo
lal)
CO2(aq) CO
3
--
HCO3
-
Výstupy
❖ Grafické
Josef Zeman 1 Základní principy 18
distribuční diagram stabilitní diagram s reakční cestou
2 Vodné prostředí
Klíčové parametry
❖ pH
❖ Eh – ORP, EH, pe, pε, fO2, log fO2
❖ T (°C)
❖ elektrická vodivost (µS cm–1)
❖ TDS (total dissolved solids), mineralizace❖ alkalita, acidita
❖ koncentrace jednotlivých složek❖ Na+, K+, Ca2+, Mg2+
❖ HCO3–, SO4
2–, Cl–
Josef Zeman 2 Vodné prostředí 20
fyzikálně-chemické parametry
chemické složení
pH
záporný dekadický logaritmus aktivity protonů
Josef Zeman 2 Vodné prostředí 21
autoprotolýza vodyH
pH log a 2H O H OH
H OHa a neutrální pH
2 2CO ( ) CO ( )g aq
2
3 3CaCO ( ) Ca HCOkalcit
regulace pH
Regulace pH v přírodních systémech
❖ Reakce rozpouštění plynu (Henryho zákon)
❖ Změna vazeb, hydratace a disociace kyseliny (protolýza) jsou spojeny do jedné reakce
Je to kombinace
Zastoupení H2CO3 je jen malé, proto se často používá zkráceného zápisu u konstanty K1.
❖ Disociace (protolýza) kyseliny uhličité do druhého stupně
❖ Reakce rozpouštění nebo srážení. K je označována indexem „sp“ (solubility product)
Josef Zeman 2 Vodné prostředí 22
KH2 2CO ( ) CO ( )g aq
2 2
3 3CaCO ( ) Ca COkalcit
K12 2 3CO ( ) H O H HCOaq
2 2 2 3CO ( ) H O H COaq
2 3 3H CO H HCO
2
3 3HCO H CO K2
Ksp
Eh
❖ záporný dekadický logaritmus aktivity elektronů* – pe (pε)
❖ oxidačně-redukční (redox) potenciál – přímo měřený ORP elektrodou
Josef Zeman 2 Vodné prostředí 23
redox reakce
Ox
Red
Eh Eh lnaRT
nF a
epe log a
Ox e Redn Ox
Red
1pe pe log
a
n a
Nernstova rovnice
pe Eh2,303
F
RT 2,303
Eh peRT
F
* na rozdíl od pH nevyjadřuje absolutní aktivitu, ale porovnání se standardní vodíkovou elektrodou (SHE)
Regulace Eh v přírodních systémech
❖ Fotosyntéza
❖ Redfieldova reakce
❖ dýchání, tlení
Josef Zeman 2 Vodné prostředí 24
dvě poločlánkové reakce
2 2 2 2472CO H O ( ) CH O O kJ
+IV +I +I0 0
2
II II II
2 2 2C O H O ( 472 kJ) C H O O
+IV +I +III II0
2
I
2
I
2C O 4 e 4 H C H O H O
0
2 2
I+I I2 H O O 4 e 4 H
změna oxidačního stavu
2
2 2 3 4 106 263 110 16 2106 CO 122 H O 16 NO 18 H HPO C H O N P 138 O
2 2 2 2CH O O CO H 4O ( )72 kJ
Regulace pH a Eh v přírodních systémech
❖ stabilita
❖ pH – karbonátový systém, výměnné reakce jílových minerálůRezervoáry: kyselost – CO2 v atmosféře, bazicita - vápencové a silkátové horniny
❖ Eh – fotosyntéza, dýchání a tlení; redox reakce na povrchuRezervoáry: oxidační – kyslík v atmosféře a oxidované látky (oxohydroxidy trojmocného železa), redukční –odumřelá biota, sulfidy
❖ změny pH jsou často důsledkem redox reakcí (a ne naopak)
❖ redukce kyslíku
❖ zvětrávání pyritu
❖ oxidace dvojmocného železa a následná hydrolýza
Josef Zeman 2 Vodné prostředí 25
2I+II +I +VII
4
I 2
2 2Fe S 8 H O Fe 2 S O 14 e 16 H
0 I+
2
I I
21 O 2 e 2 H H O
2
obvykle kombinace spotřebya produkce protonů,výsledek závisí na konkrétníchpodmínkách a speciaci složek
2 3Fe Fe e
+III3
3Fe Fe OH 3 Hs
Stabilita vody
Josef Zeman 2 Vodné prostředí 26
0 2 4 6 8 10 12 14
–.5
0
.5
1
pH
Eh
(vo
lts)
25°C
0 2 4 6 8 10 12 14
–10
–5
0
5
10
15
20
pH
pe
25°C
Model 2-01 H2O pH-Eh.ac2
v čisté vodě je rovnováha mezi molekulami vody, protony a hydroxylya zároveň mezi molekulami vody, molekulárním kyslíkem a vodíkem
0
2H 2 H 2 e
2H H
2 2H O O
0
2 2
+I II 1H O O 2 H 2 e2
2 2H O O
2H H
Model čisté vody
❖ pH – závislost na T
Josef Zeman 2 Vodné prostředí 27
závislost pH na T
závislost parc. tlakuvodní páry na T
Model čisté vody
❖ stabilitní diagram
Josef Zeman 2 Vodné prostředí 28
podmínky, pro kterébyl diagram konstruován
výpis výsledků
3 Rozpustnost pevných látek
Nasycený roztok: Z přesyceného roztoku
❖ Halit (NaCl, Halite)
Josef Zeman 3 Rozpustnost pevných látek 30
Model 3-01 NaCl presyceny.rea Model 3-02 NaCl presyceny.ac2
vloženo více, nežse může rozpustit
pozice vestabilitnímdiagramu
Nasycený roztok: Výměnou za minerál
❖ Halit (NaCl, Halite)
Josef Zeman 3 Rozpustnost pevných látek 31
Model 3-03 NaCl vymena.rea Model 3-04 NaCl vymena.ac2
koncentrace složkyurčena nepřímo – rozpustností minerálu
Cl– pouzez rozpuštěnéhohalitu
pozice vestabilitnímdiagramu
Nasycený roztok: Rozpouštěním
❖ Halit (NaCl, Halite)
Josef Zeman 3 Rozpustnost pevných látek 32
Model 3-06 NaCl rozpousteni.ac2
dosaženonasycení
reakčnícesta
rozpouštění
nasycení
Nasycený roztok: Rozpouštěním
❖ Halit (NaCl, Halite)
Josef Zeman 3 Rozpustnost pevných látek 33
speciace
mineralizace (TDS)
Nasycený roztok: Výměnou za minerál
❖ sádrovec (CaSO4×2H2O, Gypsum)
Josef Zeman 3 Rozpustnost pevných látek 34
Model 3-08 CaSO4 vymena.rea Model 3-09 CaSO4 vymena.ac2
SO42– je určeno
rozpustností sádrovce,Ca2+ je všechen zesádrovce
výslednárovnováha
Nasycený roztok: Výměnou za minerál
❖ sádrovec (CaSO4×2H2O, Gypsum): závislost na teplotě
Josef Zeman 3 Rozpustnost pevných látek 35
Model 3-10 CaSO4 vymena T.rea
nasycenýroztok
teplotnírozmezí
rozpuštěno CaSO4
příčina zlomuv rozpustnosti?
Nasycený roztok: Výměnou za minerál
❖ sádrovec (CaSO4×2H2O, Gypsum): závislost na teplotě
Josef Zeman 3 Rozpustnost pevných látek 36
díky tomu že se při rozpouštění sádrovce zabavuje teplo,roste se zvyšující se teplotou jeho rozpustnost, u anhydrituje tomu naopak
při 44 °C semění sádrovecna anhydrit
Nasycený roztok: Výměnou za minerál
❖ sádrovec (CaSO4×2H2O, Gypsum): závislost na teplotě
Josef Zeman 3 Rozpustnost pevných látek 37
vnímatjednotky
Nasycený roztok: Výměnou za minerál
❖ sádrovec (CaSO4×2H2O, Gypsum): při 60 °C
Josef Zeman 3 Rozpustnost pevných látek 38
Model 3-11 CaSO4 vymena 60.rea
nasycenýroztok
teplota
rovnováhas anhydritem
Model 3-12 CaSO4 vymena 60.ac2
Nasycený roztok: Výměnou za minerál
❖ kalcit (CaCO3, Calcite)
Josef Zeman 3 Rozpustnost pevných látek 39
Model 3-13 CaCO3 vymena.rea Model 3-14 CaCO3 vymena.ac2
nasycenýroztok
výslednárovnováha
příčinazměny pH?
Nasycený roztok: Rozpouštěním (reakční cesta)
❖ kalcit (CaCO3, Calcite)
Josef Zeman 3 Rozpustnost pevných látek 40
reakční cesta
změna pH
Nasycený roztok: Rozpouštěním (reakční cesta)
❖ kalcit (CaCO3, Calcite)
Josef Zeman 3 Rozpustnost pevných látek 41
složky Ca2+ a HCO3–
v poměru 1:1
hlavní specie Ca2+,CO3
2– a HCO3–
Nasycený roztok: Rozpouštěním (reakční cesta)
❖ kalcit (CaCO3, Calcite)
CaCO3(kalcit) → Ca2+ + CO32–
CO32– + H2O → HCO3
– + OH–
HCO3– + H2O → H2CO3 + OH–
H2CO3 → CO2(aq) + H2O
CO32– + H+ → HCO3
–
HCO3– + H+ → H2CO3
Josef Zeman 3 Rozpustnost pevných látek 42
rozpouštění
hydrolýza
hydrolýza
produkce hydroxylových ionů je ekvivalentníspotřebě protonů a vede ke stejnému zvýšení pH
4 Rozpuštěné plyny
Koncentrace plynů v atmosféře
koncentrace fugacita
plyn ppmv bar
N2 780 840 0,7912
O2 209 476 0,2123
Ar 9 340 0,0095
CO2* 314 0,000318
Ne 18,18 0,0000184
He 5,24 0,00000531
CH4* 2 0,000002
Kr 1,14
H2 0,5
Xe 0,087
ostatní† 2,853
celkem 1 000 000
pára H2O* 0–40 000† doplněno tak, aby celkový součet tvořil 1; * mají proměnlivou koncentraci
Josef Zeman 4 Rozpuštěné plyny 44
Koncentrace plynů ve vodě
Josef Zeman 4 Rozpuštěné plyny 45
Henryho konstanta
A Ag aq
A AH
A A
( ) ( )
( )
a aq a aqK
a g f
AH
A
( )a aqK
p
p
Modely rozpuštěných plynů
❖ dusík N2(aq)
N2(g) ↔ N2(aq)
N2(aq) + 4 H2O ↔ 2 NO2– + 6 e– + 8 H+
2 NO2– + H2O ↔ NO3
– + 2 e– + 2 H+
N2(aq) + + 6 e– + 8 H+ ↔ 2 NH3
NH3 + H+ ↔ NH3+
Josef Zeman 4 Rozpuštěné plyny 46
Ideálně – rovnováha mezi všemi speciemi
N2(g) ↔ N2(aq)
––––––––––––––––––––––––––––
NH3 + 2 H2O ↔ NO2– + 6 e– + 7 H+
NO2– + H2O ↔ NO3
– + 2 e– + 2 H+
reálně – molekulární dusík s ostatními formami nereaguje, jsou to dva systémy
Modely rozpuštěných plynů
❖ dusík N2(aq)
Josef Zeman 4 Rozpuštěné plyny 47
Model 4-06 N2 atm uplny.ac2 Model 4-07 N2 atm rozpojeny.ac2
úplný rozpojený
Modely rozpuštěných plynů
❖ oxid uhličitý CO2(aq)
CO2(g) ↔ CO2(aq)
CO2(aq) + H2O ↔ H2CO3
H2CO3 ↔ H+ + HCO3–
HCO3– ↔ H+ + CO3
2–
fCO2 = 0,000318 log fCO2 = –3,5
Josef Zeman 4 Rozpuštěné plyny 48
Modely rozpuštěných plynů
❖ oxid uhličitý CO2(aq)
Josef Zeman 4 Rozpuštěné plyny 49
Model 4-08 CO2 atm.rea Model 4-09 CO2.ac2
atmosféra:log fCO2 ~ –3,5
půda, podzemní voda:
log fCO2 ~ –1,5
Modely rozpuštěných plynů
❖ oxid uhličitý CO2(aq): speciační diagram
Josef Zeman 4 Rozpuštěné plyny 50
koncentrace specií aktivity specií
koncentrace aktivity
5 Pokročilé modelování
Rozpouštění za vzniku nového minerálu
❖ kaolinit (Al2Si2O5(OH)4, Kaolinite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 52
nasycení roztokuvůči kaolinitu,
rozpouštění končínasycení roztokuvůči kaolinitu,rozpouštění končí
nasycení roztokuvůči gibbsitu
gibbsit v rovnovázes kaolinitem
gibbsit – Al(OH)3
Rozpouštění za vzniku nového minerálu
❖ kaolinit (Al2Si2O5(OH)4, Kaolinite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 53
nasycení roztokuvůči kaolinitu,rozpouštění končí
všechen Al3+ spotřebovávánvznikem nových fází
signalizuje změnyv mechanismu reakcí
Rozpouštění za vzniku nového minerálu
❖ kaolinit (Al2Si2O5(OH)4, Kaolinite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 54
nasycení roztokuvůči kaolinitu,rozpouštění končí
nasycení roztokuvůči kaolinitu
nasycenívůči gibbsitu
rozpouštěníkaolinitu
srážení gibbsitu, pokles Al3+
speciace složek Al3+ a SiO2(aq)koncentrace složky Al3+
Rozpouštění za vzniku nového minerálu
❖ kaolinit (Al2Si2O5(OH)4, Kaolinite)
kaolinite + 6 H+ → 5 H2O + 2 Al3+ + 2 SiO2(aq)
–––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––
kaolinite + 3 H2O → 2 Al(OH)4– + 2 SiO2(aq) + 2 H+
kaolinite + 5 H2O → 2 gibbsit + 2 H3SiO4– + 2 H+
Al(OH)4– + H+ → H2O + gibbsit
kaolinit + H2O ↔ 2 gibbsit + 2 SiO2(aq)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 55
pro dané podmínky je třeba respektovat speciaci složek; formální rovnice „0“ by vedla k silné alkalizaciprostředí, zatímco skutečný průběh podle rovnic „1–3“ vede naopak k mírnému poklesu pH
1
2
0
3
1
2
3
obecná rovnice „0“ signalizuje, že by mělodocházet ke spotřebě H+, modelový průběhukazuje, že jsou H+ naopak produkovány
Rozpouštění za vzniku nového minerálu
❖ kaolinit (Al2Si2O5(OH)4, Kaolinite) – speciace Al3+
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 56
rozpouštění kaolinituaž do nasycení vůčigibbsitu
další rozpouštěníkaolinitu, roztokje nasycen vůči gibbsitu
reakceodpovídárovnici 1
reakceodpovídárovnici 2
speciace Al3+
detail
dosaženo rovnováhypodle rovnice
3
Rozpouštění za vzniku nového minerálu
❖ kaolinit (Al2Si2O5(OH)4, Kaolinite) – speciace SiO2(aq)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 57
speciace SiO2(aq)pro danépodmínky
odpovídárovnici
2
speciace SiO2(aq)
dosaženo rovnováhypodle rovnice
3
detail
Rozpouštění za vzniku nového minerálu
❖ kaolinit (Al2Si2O5(OH)4, Kaolinite) – další varianty speciačních diagramů
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 58
Model 5-04 Al3+ SiO2-Al(OH)4.ac2 Model 5-05 SiO2 SiO2-(Al(OH)4-H).ac2
speciace Al3+ speciace SiO2(aq)
dosažení rovnováhygibbsit-kaolinit-roztok
Vodné prostředí v kontaktu s minerály a atmosférou
❖ úplný karbonátový systém
CO2(g)
–––––––– ↑↓ ––––––––
CO2(aq)
CO2(aq) + H2O ↔ H2CO3
H2CO3 ↔ H+ + HCO3–
HCO3– ↔ H+ + CO3
2–
CO32– + Ca2+
–––––––– ↑↓ ––––––––
CaCO3(s)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 59
atmosféra
vodnýroztok
sediment
obvykle: CO2(aq) + H2CO3* = H2CO3
H2CO3* – skutečná kyselina uhličitá
Vodné prostředí v kontaktu s minerály a atmosférou
❖ úplný karbonátový systém
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 60
Model 5-16 HCO3 pH-HCO3.ac2
aktivitaz výpisu
zobrazovanáspecie rovnováha
roztok přesycenývůči kalcitu
roztok přesycenýrozpuštěnému CO2
speciaceHCO3
–speciaceHCO3
–
Vodné prostředí v kontaktu s minerály a atmosférou
❖ úplný karbonátový systém
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 61
Model 5-17 HCO3 pH-Ca.ac2 Model 5-18 HCO3 HCO3-Ca.ac2
speciaceHCO3
–speciaceHCO3
–
Vodné prostředí v kontaktu s minerály a atmosférou
❖ úplný karbonátový systém
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 62
Model 5-19 Ca pH-Ca.ac2
speciaceCa2+
aktivita z výpisu,v celém diagramujako specie HCO3
–
Vodné prostředí v kontaktu s minerály a atmosférou
❖ úplný karbonátový systém
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 63
Model 5-20 Ca pH-Ca spec HCO3.ac2
speciaceCa2+
aktivita z výpisu,podle pH bránapřevažující specie
Vodné prostředí v kontaktu s minerály a atmosférou
❖ úplný karbonátový systém s redox reakcemi
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 64
Model 5-21 atm. O2, CO2-voda-kalcit.rea Model 5-22 HCO3 pH-Eh rovn atm kalcit.ac2
rovnováha s kalcitem,atm. O2 a CO2
rovnováha
Vodné prostředí v kontaktu s minerály a atmosférou
❖ karbonátový systém s redox reakcemi – uvolňování plynů do atmosféry
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 65
Model 5-24 HCO3 pH-Eh atm O2, CO2 1 bar.ac2 Model 5-25 HCO3 pH-Eh atm O2, CO2 1 bar supp g.ac2
roztok přesycenývůči CH4
roztok přesycenývůči CO2 potlačeno zobrazení
plynů
Vodné prostředí v kontaktu s minerály a atmosférou
❖ karbonátový systém s redox reakcemi – uvolňování plynů do atmosféry
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 66
Model 5-26 HCO3 pH-Eh atm O2, CO2 10 bar supp g.ac2
aktivita přidestinásobkunormálního
tlaku
ryzí uhlík
Vodné prostředí v kontaktu s minerály a atmosférou
❖ oxidace pyritu (FeS2, Pyrite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 67
Model 5-27 Pyrit Fe pH-Eh.ac2
hranice platí pouze prouvedené aktivity složeka dané minerály
konc. konc. ~akt.
složka mg/l mol/l log
SO42– 100 1,04E-03 -2,98
Fe2+ 0,5 8,95E-06 -5,05
speciace Fe
Vodné prostředí v kontaktu s minerály a atmosférou
❖ oxidace pyritu (FeS2, Pyrite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 68
Config→Suppress: Hematite Config→Suppress: Goethite
Vodné prostředí v kontaktu s minerály a atmosférou
❖ oxidace pyritu (FeS2, Pyrite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 69
Config→Suppress: Magnetite Config→Suppress: FeO(c)
Vodné prostředí v kontaktu s minerály a atmosférou
❖ oxidace pyritu (FeS2, Pyrite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 70
speciace S
Model 5-28 Pyrit SO4 pH-Eh.ac2
Vodné prostředí v kontaktu s minerály a atmosférou
❖ oxidace pyritu (FeS2, Pyrite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 71
Model 5-29 Fe pH-Eh.ac2 Model 5-30 Fe pH-Eh supp all.ac2
bez sirných látek bez minerálů
speciace Fe
Vodné prostředí v kontaktu s minerály a atmosférou
❖ oxidace pyritu (FeS2, Pyrite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 72
Model 5-31 SO4 pH-Eh.ac2 Model 5-32 SO4 pH-Eh supp all.ac2
bez Fe bez minerálů
speciace S
Vodné prostředí v kontaktu s minerály a atmosférou
❖ oxidace pyritu (FeS2, Pyrite)
❖ pyrit se dostal do vody s rozpuštěným kyslíkem
❖ pyrit je v rovnováze s anoxickým prostředím a dostává se k němu kyslík
❖ pyrit se dostává do vody, která je v kontaktu s atmosférou
❖ horninové anoxické prostředí se postupně dostává do kontaktu s atmosférou
❖ pyrit je oxidován hydroxidy železa …
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 73
jednotlivémodelovésituace
Pyrit oxidován difundujícím kyslíkem
❖ oxidace pyritu (FeS2, Pyrite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 74
Model 5-33 Pyrit rovnovaha.rea Model 5-34 Pyrit pH-Eh.ac2
rovnováhas pyritem
rovnováhas pyritem
voda v rovnovázes pyritem
Pyrit oxidován difundujícím kyslíkem
❖ oxidace pyritu (FeS2, Pyrite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 75
Model 5-35 Pyrit oxidace O2.rea Model 5-36 Pyrit oxidace O2 pH-Eh.ac2
reakce s postupnědifundujícímkyslíkem
reakčnícesta
Pyrite + H2O + 3.5 O2(aq) == Fe++ + 2 SO4-- + 2 H+
Fe++ + H+ + .25 O2(aq) == Fe+++ + .5 H2O
Fe++ + 2.5 H2O + .25 O2(aq) == Fe(OH)3(ppd) + 2 H+
Fe(OH)2+ + H2O == Fe(OH)3(ppd) + H+
Pyrit oxidován difundujícím kyslíkem
❖ oxidace pyritu (FeS2, Pyrite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 76
minerály pH
Pyrit oxidován difundujícím kyslíkem
❖ oxidace pyritu (FeS2, Pyrite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 77
Eh složky
Pyrit oxidován difundujícím kyslíkem
❖ oxidace pyritu (FeS2, Pyrite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 78
specie index nasycení
Pyrit oxidován postupnou změnou prostředí
❖ oxidace pyritu (FeS2, Pyrite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 79
Model 5-37 Pyrit oxidace fO2.rea
postupný růst fugacity O2při změně horninovéhoprostředí z redukčníhona oxidační;
log použito kvůli velikostikroku změny
Pyrit oxidován postupnou změnou prostředí
❖ oxidace pyritu (FeS2, Pyrite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 80
pH minerály
Pyrit oxidován postupnou změnou prostředí
❖ oxidace pyritu (FeS2, Pyrite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 81
Eh složky
Pyrit oxidován postupnou změnou prostředí
❖ oxidace pyritu (FeS2, Pyrite)
Josef Zeman 5 Pokročilé modelování 82
specie elektrická vodivost
6 Úplný model pH-redoxsystémů
Oxidace pyritu v horninovém prostředí
❖ interakce pyritu (FeS2) v přítomnosti kalcitu (CaCO3)
Josef Zeman 6 Úplný model pH-redox systémů 84
Model 6-02 Pyrit Kalcit.ac2
úplný stabilitnídiagram pro Fe
Oxidace pyritu v horninovém prostředí
❖ interakce pyritu (FeS2) v přítomnosti kalcitu (CaCO3)
Josef Zeman 6 Úplný model pH-redox systémů 85
pH Eh
Oxidace pyritu v horninovém prostředí
❖ interakce pyritu (FeS2) v přítomnosti kalcitu (CaCO3)
Josef Zeman 6 Úplný model pH-redox systémů 86
minerály složky
Oxidace pyritu v horninovém prostředí
❖ interakce pyritu (FeS2) v přítomnosti kalcitu (CaCO3)
Josef Zeman 6 Úplný model pH-redox systémů 87
specie Fe specie S
7 Kinetika
Rychlostní rovnice
❖ vyjádření rychlosti reakcí
Josef Zeman 7 Kinetika 89
celková rychlost
–MS M Sn n
–MS M Sn n
–MS M Sn n
MS
d MS
dr k A
t
MS
d MSM S
d
n nr k At
MS MS 1Q
r A kK
rovnováha
rozpouštění
srážení
rychlost rozpouštění
rychlost srážení
Mechanismus reakce
❖ nefelín (NaAlSiO4, Nepheline)
Josef Zeman 7 Kinetika 90
mechanismus reakcí
3
2 2nefelín 4 H 2 H O Na Al SiO aq
2nefelín 0,5 H O H Na 0,5 kaolinit
2 2nefelín H O H Na gibbsit SiO aq
3
2nefelín 4 H 2 H O Na Al chalcedon
2nefelín H O H Na gibbsit chalcedon
2chalcedon gibbsit 0,5 kaolinit 0,5 H O
nefelín k = 1,5×10–13mol cm–2 s–1
kaolinit k = 2×10–15mol cm–2 s–1
gibbsit k = 1,5×10–12mol cm–2 s–1
chalcedon k = 2×10–12mol cm–2 s–1
rychlostní konstanty
Kinetika rozpouštění
❖ nefelín (NaAlSiO4, Nepheline)
Josef Zeman 7 Kinetika 91
minerály stupeň nasycení
v průběhu reakce
není dosaženo rovnováhy
Kinetika rozpouštění
❖ nefelín (NaAlSiO4, Nepheline)
Josef Zeman 7 Kinetika 92
složky specie důsledek udržováníkonstantního pH
8 Vyhodnocení reálných dat
Důlní vody Kaňk
❖ Fe, As – data v databázi Geochemist‘s spreadsheet (GSS – viz dále)
Josef Zeman 8 Vyhodnocení reálných dat 94
Model 8-01 Kank pH Eh Fe Goethite.ac2 Model 8-02 Kank pH Eh As Fe log converted units.gss
speciace Fe
úplná
analýzavody
data v GSS
výtok DV
hluboké DV
Důlní vody Kaňk
❖ Fe, As – data v databázi Geochemist‘s spreadsheet (GSS – viz dále)
Josef Zeman 8 Vyhodnocení reálných dat 95
Model 8-03 Kank pH Eh Fe Jarosite-K.ac2 Model 8-04 Kank pH Eh As.ac2
Config→Suppress: Goethite
speciace Fe speciace As
Chemická analýza
❖ ÚChR – úplný chemický rozbor vody
Josef Zeman 8 Vyhodnocení reálných dat 96
hlavička
Chemická analýza
❖ ÚChR – úplný chemický rozbor vody
Josef Zeman 8 Vyhodnocení reálných dat 97
výsledkyanalýzy
Chemická analýza
❖ ÚChR – úplný chemický rozbor vody
Josef Zeman 8 Vyhodnocení reálných dat 98
celkovýsouhrn
Chemická analýza
❖ The Geochemist’s Spreadsheet (GSS)
Josef Zeman 8 Vyhodnocení reálných dat 99
Model 8-05 Hajek vrty a vody.gss
Chemická analýza
❖ HPV-4 ❖ S-17
Josef Zeman 8 Vyhodnocení reálných dat 100
Graph→Bar Chart
sloupcové diagramy
Chemická analýza
❖ J-5 ❖ HJ-2
Josef Zeman 8 Vyhodnocení reálných dat 101
Graph→Stiff Diagram
Chemická analýza
❖ Piperův diagram: interpretace
Josef Zeman 8 Vyhodnocení reálných dat 102
genetickáinterpretace
hydrochemickáinterpretace
Chemická analýza
❖ Piperův diagram
Josef Zeman 8 Vyhodnocení reálných dat 103
Graph→Piper Diagram
Chemická analýza
❖ Durovův diagram
Josef Zeman 8 Vyhodnocení reálných dat 104
Graph→Durov Diagram
9 Literatura
Literatura pro další studium
❖ Bethke C. M. (2010): Geochemical and Biogeochemical Reaction Modeling.Cambridge University Press, 2 edition, 564 pages.
❖ Rimstidt J. D. (2013): Geochemical Rate Models: An Introduction to Geochemical Kinetics.Cambridge University Press, 239 pages.
❖ Slingerland R., Kump L.(2011): Mathematical Modeling of Earth's Dynamical Systems: A Primer.Princeton University Press, 248 pages.
❖ Zhu C., Anderson G. (2002): Environmental Applications of Geochemical Modeling Cambridge.University Press, 300 pages.
❖ Zhang Y. (2008): Geochemical Kinetics. Princeton University Press, 664 pages.
Josef Zeman 9 Literatura 106
Vedoucí týmu vývojářů GWB; kniha vychází z GWB (není to však uživatelská příručka programu; modely z knihy jsou v podadresářiGWB/Script/GBRM scripts