Molekulární fylogenetika primárních endosymbiontů hmyzu

Benjamín Skála

vedoucí práce: Václav Hypša

Endosymbionti hmyzu

• bakterie žijící v tělních buňkách

• primární X sekundární

Moran, 2006

P-endosymbionti

• mutualistický vztah s hostitelem

• vertikální přenos

• redukce genomu

• koevoluce s hostitelem

• Buchnera, Wigglesworthia, Blochmannia

Molekulární fylogenetika

• metodologické problémy:• vysoký obsah AT• potenciální horizontální přenos genů

• příbuzenské vztahy jsou zatím nejasné

groEL Herbeck et al., 2005

Otázky

• Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou??

Otázky

• Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou??

• Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete.

Flegr, 2005

Otázky

• Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou??

• Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete.

• Proč se odhad množství genů získaných prostřednictvím horizontálního přenosu genů (HGT) u různých autorů tak výrazně liší? (nepatrný počet až 60%)

Otázky

• Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou??

• Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete.

• Proč se odhad množství genů získaných prostřednictvím HGT u různých autorů tak výrazně liší? (nepatrný počet až 60%)

• Co je to nehomogenní (substituční) model? Vysvětlete.

Otázky

• Co je podmínkou toho, aby mohli být P-endosymbionti hmyzu označeni jako organely? Existují skutečně důkazy, že již organelami nejsou??

• Uvádíte, že duplikace genomů bakterií způsobují vznik paralogů a tak mohou zapříčinit špatnou topologii stromů. Prosím blíže a podrobně vysvětlete.

• Proč se odhad množství genů získaných prostřednictvím HGT u různých autorů tak výrazně liší? (nepatrný počet až 60%)

• Co je to nehomogenní (substituční) model? Vysvětlete.• Jaké symbiotické „houbovité organismy“ byly nalezeny u mšic?

Xet-Mull, 2004

Některé mšice tribu Cerataphidini obsahují tzv. YLS – yeast-like symbiont

vřeckovýtrusné houby (Ascomycota),Sordariomycetes

Hypomyces lactifluorum