Životopis Mgr. DANUŠE TARKOWSKÁ, Ph.D. (narozena 25. listopadu 1975 v Ostravě, ČSSR) Identifikátor: ORCID: 0000-0003-1478-1904; Researcher ID: F-8709-2011 Webová stránka: http://www.rustreg.upol.cz/staff/mgr-danuse-tarkowska-ph-d/ VZDĚLÁNÍ 1999 – ukončené vysokoškolské vzdělání – Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, obor Analytická chemie, dosažený titul Mgr. Diplomová práce: „Voltametrické chování a stanovení některých cytokininů“ 2002 – ukončené doktorské studium – Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, obor Botanika, dosažený titul Ph.D. Disertační práce: “ Metabolism of aromatic cytokinins” PŘEHLED PŮSOBENÍ od r. 2002 – ÚEB AV ČR, vědecký pracovník od r. 2013 – PřF UP Olomouc, odborný asistent od r. 2014 – Centrum regionu Haná pro biotechnologický a zemědělský výzkum, PřF UP Olomouc & ÚEB AV ČR & VÚRV, Laboratoř růstových regulátorů, členka oddělení Metabolomiky MEZINÁRODNÍ ZKUŠENOSTI 2001 - 2002 – 10 měsíců, doktorská studijní stáž na katedře Lesnické genetiky a rostlinné fyziologie, Švédské zemědělské univerzity v Umeå, Švédsko 2004 - 2005 – 12 měsíců, post-doktorská studijní stáž, Umeå Plant Science Centre, Umeå, Švédsko VÝZKUMNÉ ZAMĚŘENÍ • vývoj metod pro extrakci a purifikaci rostlinných hormonů nebo jiných biologicky významných látek přítomných v biologických vzorcích ve stopových množstvích vývoj metod pro stanovení rostlinných hormonů a jiných signálních molekul metodou kombinující kapalinou chromatografii (LC) s hmotnostní spektrometrií (MS) • identifikace nových látek charakteru rostlinných hormonů v rostlinách (např. Brassica napus L., Lepidium sativum, Populus canadensis apod.). PUBLIKAČNÍ ČINNOST • autor a spoluautor 62 původních vědeckých prací v časopisech s impakt faktorem (analytická chemie, botanika, fyziologie) a 1 kapitola v knize (v přiloženém seznamu je autorka uvedena u 8 prací jako hlavní autor a u 11 prací vystupuje jako korespondující autor – označeno symbolem *) • WOS: 62 záznamů; počet citací: 1518 (bez autocitací: 1430); h-index: 18
Transcript
Životopis
Mgr. DANUŠE TARKOWSKÁ, Ph.D. (narozena 25. listopadu 1975 v Ostravě, ČSSR) Identifikátor: ORCID: 0000-0003-1478-1904; Researcher ID: F-8709-2011 Webová stránka: http://www.rustreg.upol.cz/staff/mgr-danuse-tarkowska-ph-d/ VZDĚLÁNÍ 1999 – ukončené vysokoškolské vzdělání – Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, obor
Analytická chemie, dosažený titul Mgr. Diplomová práce: „Voltametrické chování a stanovení některých cytokininů“ 2002 – ukončené doktorské studium – Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, obor
Botanika, dosažený titul Ph.D. Disertační práce: “ Metabolism of aromatic cytokinins” PŘEHLED PŮSOBENÍ od r. 2002 – ÚEB AV ČR, vědecký pracovník od r. 2013 – PřF UP Olomouc, odborný asistent od r. 2014 – Centrum regionu Haná pro biotechnologický a zemědělský výzkum, PřF UP Olomouc & ÚEB AV
ČR & VÚRV, Laboratoř růstových regulátorů, členka oddělení Metabolomiky MEZINÁRODNÍ ZKUŠENOSTI 2001 - 2002 – 10 měsíců, doktorská studijní stáž na katedře Lesnické genetiky a rostlinné fyziologie, Švédské
zemědělské univerzity v Umeå, Švédsko 2004 - 2005 – 12 měsíců, post-doktorská studijní stáž, Umeå Plant Science Centre, Umeå, Švédsko VÝZKUMNÉ ZAMĚŘENÍ • vývoj metod pro extrakci a purifikaci rostlinných hormonů nebo jiných biologicky významných látek
přítomných v biologických vzorcích ve stopových množstvích
vývoj metod pro stanovení rostlinných hormonů a jiných signálních molekul metodou kombinující kapalinou chromatografii (LC) s hmotnostní spektrometrií (MS)
• identifikace nových látek charakteru rostlinných hormonů v rostlinách (např. Brassica napus L., Lepidium sativum, Populus canadensis apod.).
PUBLIKAČNÍ ČINNOST • autor a spoluautor 62 původních vědeckých prací v časopisech s impakt faktorem (analytická chemie,
botanika, fyziologie) a 1 kapitola v knize (v přiloženém seznamu je autorka uvedena u 8 prací jako hlavní autor a u 11 prací vystupuje jako korespondující autor – označeno symbolem *)
• Původní/přehledový článek v odborném periodiku, které je obsaženo v databázi Web of Science (Jimp):
1. Barták P., Pěchová D., Tarkowski P., Bednář P., Kotouček M., Stránský Z., Vespalec R.: Determination of the first dissociation constant of 6-benzylaminopurine. A comparison of methods. ANALYTICA CHIMICA ACTA 421(2):221−229 (2000). DOI 10.1016/S0003-2670(00)01037-0; IF = 1.849
2. Huskova R., Pechova D., Kotoucek M., Lemr K., Dolezal K. Voltammetric behaviour and determination of some cytokinines on mercury electrode. CHEMICKE LISTY 94(11):1004−1009 (2000). No DOI issued; IF = 0.278
3. Tarkowská D.*, Kotouček M., and Doležal K.: Electrochemical reduction of 6-benzylaminopurine at mercury electrodes and its analytical application. COLLECTION OF CZECHOSLOVAK CHEMICAL COMMUNICATIONS 68(6):1076−1093 (2003). DOI 10.1135/cccc20031076; IF = 1.041
4. Tarkowská D.*, Doležal K., Tarkowski P., Åstot C., Holub J., Fuksová K., Schmülling T., Sandberg G.,
Strnad M.: Identification of new aromatic cytokinins in Arabidopsis thaliana and Populus canadensis leaves by LC- (+) ESI-MS and capillary liquid chromatography/frit-fast atom bombardment mass spectrometry. PHYSIOLOGIA PLANTARUM 117(4):579−590 (2003). DOI 10.1034/j.1399-3054.2003.00071.x; IF = 1.767
5. Novák O., Tarkowski P., Tarkowská D., Doležal K., Lenobel R., Strnad M.: Quantitative analysis of cytokinins in plants by liquid chromatography-single-quadrupole mass spectrometry. ANALYTICA CHIMICA ACTA 480(2):207−218 (2003). DOI 10.1016/S0003-2670(03)00025-4; IF = 2.210
6. Sun J.Q., Niu Q.W., Tarkowski P., Zheng B.L., Tarkowska D., Sandberg G., Chua N.H., Zuo J.R.: The Arabidopsis AtIPT8/PGA22 gene encodes an isopentenyl transferase that is involved in de novo cytokinin biosynthesis. PLANT PHYSIOLOGY 131(1):167−176 (2003). DOI 10.1104/pp.011494; IF = 5.634
7. Nordström A., Tarkowski P., Tarkowská D., Doležal K., Åstot C., Sandberg G., Moritz T.: Derivatization for LC electrospray ionization-MS: A tool for improving reversed-phase separation and ESI responses of bases, ribosides, and intact nucleotides. ANALYTICAL CHEMISTRY 76(10):2869−2877 (2004). DOI 10.1021/ac0499017; IF = 5.450
8. Nordström A., Tarkowski P., Tarkowská D., Norbaek R., Åstot C., Doležal K., Sandberg G. Auxin regulation of cytokinin biosynthesis in Arabidopsis thaliana: A factor of potential importance for auxin-cytokinin-regulated development. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 101(21): 8039−8044 (2004). DOI 10.1073/pnas.0402504101; IF = 10.452
9. Tarkowski P., Tarkowská D., Novák O., Mihaljevic S., Magnus V., Strnad M., Salopek-Sondi B.: Cytokinins in the perianth, carpels, and developing fruit of Helleborus niger L. JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 57(10), 2237−2247 (2006). DOI 10.1093/jxb/erj190; IF = 3.630
Mgr. DANUŠE TARKOWSKÁ, Ph.D.
2
10. Miyawaki K., Tarkowski P., Matsumoto-Kitano M., Kato T., Sato S., Tarkowská D., Tabata S., Sandberg G., Kakimoto T. Roles of Arabidopsis ATP/ADP isopentenyltransferases and tRNA isopentenyltransferases in cytokinin biosynthesis. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 103(44): 16598−16603 (2006). DOI 10.1073/pnas.0603522103; IF = 9.643
11. Beuchat J., Scacchi E., Tarkowská D., Ragni L., Strnad M., Hardtke C.S. BRX promotes Arabidopsis shoot growth. NEW PHYTOLOGIST 188(1):23−29 (2010). DOI 10.1111/j.1469-8137.2010.03387.x; IF = 6.516
12. Urbanová T., Tarkowská D.*, Strnad M., Hedden P. Gibberellins-terpenoid plant hormones: biological importance and chemical analysis. COLLECTION OF CZECHOSLOVAK CHEMICAL COMMUNICATIONS 76(12):1669−1686 (2011). DOI 10.1135/cccc2011098; IF = 1.283
13. Sankar M., Osmont K.S., Rolcik J., Gujas B., Tarkowska D., Strnad M., Xenarios I., Hardtke C.S. A qualitative continuous model of cellular auxin and brassinosteroid signaling and their crosstalk. BIOINFORMATICS 27(10):1404−412 (2011). DOI 10.1093/bioinformatics/btr158; IF = 5.468
14. Habib S.H., Ooi S.-E., Novák O., Tarkowská D., Rolčík J., Doležal K., Syed-Alwee S. S. R., Ho C.-L., Namasivayam P. Comparative mineral and hormonal analyses of wild type and TLS somaclonal variant derived from oil palm (Elaeis guineensis Jacq. var. tenera) tissue culture. PLANT GROWTH REGULATION 68(2):313–317 (2012). DOI 10.1007/s10725-012-9707-1; IF = 1.670
15. Oracz K., Voegele A., Tarkowská D., Jacquemoud D., Turečková V., Urbanová T., Strnad M., Sliwinska E., Leubner-Metzger G. Myrigalone A Inhibits Lepidium sativum Seed Germination by Interference with Gibberellin Metabolism and Apoplastic Superoxide Production Required for Embryo Extension Growth and Endosperm Rupture. PLANT CELL AND PHYSIOLOGY 53 (1):81–95 (2012). DOI 10.1093/pcp/pcr124; IF = 4.134
16. Podlesakova K., Tarkowska D. , Pencik A., Oklestkova J., Tureckova V., Flokova K., Tarkowski P. New trends in phytohormone analysis. CHEMICKÉ LISTY 106 (5):373−379 (2012). No DOI issued; IF = 0.453
17. Tarkowská D.*, Filek M., Biesaga-Kościelniak J., Marcińska I., Macháčková I., Krekule J., Strnad M. Cytokinins in shoot apices of Brassica napus plants during vernalization. PLANT SCIENCE 187: 105−112 (2012). DOI 10.1016/j.plantsci.2012.02.003; IF = 2.922
18. Voegele A., Graeber K., Oracz K., Tarkowská D., Jacquemoud D., Turečková V., Urbanová T., Strnad M., Leubner-Metzger G. Embryo growth, testa permeability, and endosperm weakening are major targets for the environmentally regulated inhibition of Lepidium sativum seed germination by myrigalone A. JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 63 (14): 5337–5350 (2012). DOI 10.1093/jxb/ers197; IF = 5.242
19. Polko J.K., Pierik R., van Zanten M., Tarkowská D., Strnad M., Voesenek L.A.C.J., Peeters A.J.M. Ethylene promotes hyponastic growth through interaction with ROTUNDIFOLIA3/CYP90C1 in Arabidopsis. JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 64 (2): 613–624 (2013). DOI 10.1093/jxb/ers356; IF = 5.794
Mgr. DANUŠE TARKOWSKÁ, Ph.D.
3
20. Urbanová T., Tarkowská D.*‡, Novák O., Hedden P., Strnad M. Analysis of gibberellins as free acids by ultra-performance liquid chromatography–tandem mass spectrometry. TALANTA 12: 85−94 (2013). DOI 10.1016/j.talanta.2013.03.068; IF = 3.511 (‡ joint first author)
21. Fridborg I., Johansson A., Lagensjö J., Leelarasamee N., Floková K., Tarkowská D., Meijer J., Bejai S. ML3: a novel regulator of herbivory-induced responses in Arabidopsis thaliana. JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 64 (4): 935−948 (2013). DOI 10.1093/jxb/ers372; IF = 5.794
22. Khripach V.A., Tarkowská D., Zhabinskii V.N., Gulyakevich O.V., Ermolovich Y.V., Drašar P., Strnad M. Synthesis and Mass Spectral Fragmentation Patterns of Brassinolide Early Biosynthetic Precursors Labeled at C-26. NATURAL PRODUCT COMMUNICATIONS 8 (6): 771−774 (2013). No DOI issued; IF = 0.924
23. Stirk W.A., Bálint P., Tarkowská D., Novák O., Strnad M., Ördög V., van Staden J. Hormone profiles in microalgae: Gibberellins and brassinosteroids. PLANT PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY 70: 348−353 (2013). DOI 10.1016/j.plaphy.2013.05.037; IF = 2.352
24. Stirk W.A. Tarkowska D., Tureckova V., Strnad M., van Staden J. Abscisic acid, gibberellins and brassinosteroids in Kelpak ®, a commercial seaweed extract made from Ecklonia maxima. JOURNAL OF APPLIED PHYCOLOGY 26(1):561–567 (2014). DOI 10.1007/s10811-013-0062-z; IF = 2.559
25. Stirk W.A., Bálint P., Tarkowská D., Novák O., Maroti G., Ljung K., Turečková V., Strnad M., Ördög V., van Staden J. Effect of light on growth and endogenous hormones in Chlorella minutissima (Trebouxiophyceae). PLANT PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY 79:66–76 (2014). DOI 10.1016/j.plaphy.2014.03.005; IF = 2.756
26. Graeber K., Linkies A., Steinbrecher T., Mummenhoff K., Tarkowská D., Turečková V., Ignatz M., Sperber K., Voegele A., de Jong H., Urbanová T., Miroslav Strnad, Leubner-Metzger G. DELAY OF GERMINATION 1 mediates a conserved coatdormancy mechanism for the temperature- and gibberellin-dependent control of seed germination. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 111(34) E3571–E3580 (2014). DOI 10.1073/pnas.1403851111; IF = 9.674
27. Islam M. A., Tarkowská D., Clark J. L., Blystad D.-R., Gislerød H. R., Torre S., Olsen J. E. Impact of end-of-day red and far-red light on plant morphologyand hormone physiology of poinsettia. SCIENTIA HORTICULTURAE 174:77–86 (2014). DOI 10.1016/j.scienta.2014.05.013; IF = 1.365
28. Lu Y., Tarkowská D., Turečková V., Luo T., Xin Y., Li J., Wang Q., Jiao N., Strnad M., Xu J. Antagonistic roles of abscisic acid and cytokinin during response to nitrogen depletion in oleaginous microalga Nannochloropsis oceanica expand the evolutionary breadth of phytohormone function. THE PLANT JOURNAL 80(1):52–68 (2014). DOI 10.1111/tpj.12615; IF = 5.972
29. Singh A. P., Fridman Y., Friedlander-Shani L., Tarkowska D., Strnad M., Savaldi-Goldstein S. Activity of the brassinosteroid transcription factors BZR1 and BES1/BZR2 blocks developmental reprogramming in response to low phosphate availability. PLANT PHYSIOLOGY 166(2):678–688 (2014). DOI 10.1104/PP.114.245019; IF = 6.841
30. Weier D., Thiel J., Kohl S., Tarkowska D., Strnad M., Schaarschmidt S., Weschke W., Weber H., Hause B. Gibberellin-to-abscisic acid balances govern development and differentiation of the
Mgr. DANUŠE TARKOWSKÁ, Ph.D.
4
nucellar projection of barley grains. JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 65(18):5291–5304 (2014). DOI 10.1093/JXB/ERU289; IF = 5.526
31. Tarkowská D.*, Novák O., Floková K., Tarkowski P., Turečková V., Grúz J., Rolčík J., Strnad M. Quo vadis plant hormone analysis? PLANTA 240(1):55–76 (2014). DOI 10.1007/s00425-014-2063-9; IF = 3.263
32. Flokova K., Tarkowska D., Miersch O., Strnad M., Wasternack C., Novak O. UHPLC-MS/MS based target profiling of stress-induced phytohormones. PHYTOCHEMISTRY 105:147–157 (2014). DOI 10.1016/j.phytochem.2014.05.015; IF = 2.547
33. Martín-Rodríguez J. A., Ocampo J. A., Molinero-Rosales N., Tarkowská D., Ruíz-Rivero O., García-Garrido J. M. Role of gibberellins during arbuscular mycorrhizal formation in tomato: new insights revealed by endogenous quantification and genetic analysis of their metabolism in mycorrhizal roots. PHYSIOLOGIA PLANTARUM 154(1):66–81 (2015). DOI 10.1111/ppl.12274; IF = 3.520
34. Aremu A.O., Stirk W.A., Kulkarni M.G., Tarkowská D., Turečková V., Grúz J., Šubrtová M., Pěnčík A., Novák O., Doležal K., Strnad M., van Staden J. Evidence of phytohormones and phenolic acids variability in garden-waste-derived vermicompost leachate, a well-known plant growth stimulant. PLANT GROWTH REGULATION 75(2):483–492 (2015). DOI 10.1007/s10725-014-0011-0; IF = 2.333
35. Kamlar M., Rothova O., Salajkova S., Tarkowska D., Drasar P., Kocova M., Harmatha J., Hola D., Kohout L., Macek T. The effect of exogenous 24-epibrassinolide on the ecdysteroid content 4 in the leaves of Spinacia oleracea L. STEROIDS 97:107–112 (2015). DOI 10.1016/j.steroids.2014.12.024; IF = 2.513
36. Sebastian J, Ryu K.H., Zhou J., Tarkowská D., Tarkowski P., Cho Y.-H., Yoo S.-D., Kim E.-S., Lee J.-Y. PHABULOSA controls the quiescent center-independent root meristem activities in Arabidopsis thaliana. PLOS GENETICS 11(3): e1004973 (2015). DOI:10.1371/journal.pgen.1004973; IF = 6.661
37. Pielot R., Kohl S., Manz B., Rutten T., Weier D., Tarkowská D., Rolčík J., Strnad M., Volke F., Weber H., Weschke W. Hormone-mediated growth dynamics of the barley pericarp as revealed by magnetic resonance imaging and transcript profiling. JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 66(21): 6927–6943 (2015). DOI 10.1093/jxb/erv397t; IF = 5.677
38. Floková K., Feussner K., Herrfurth C., Miersch O., Mik V., Tarkowská D., Strnad M., Feussner I., Wasternack C, Novák O. A previously undescribed jasmonate compound in flowering Arabidopsis thaliana - The identification of cis-(+)-OPDA-Ile. PHYTOCHEMISTRY 122:230–237 (2016). DOI 10.1016/j.phytochem.2015.11.012; IF = 2.779
39. Hluska T., Dobrev P.I., Tarkowská D., Frébortová J., Zalabák D., Kopečný D., Plíhal O., Kokáš F., Briozzo P., Zatloukal M., Motyka V., Galuszka P. Cytokinin metabolism in maize: Novel evidence of cytokininabundance, interconversions and formation of a new trans-zeatin metabolic product with a weak anticytokinin activity. PLANT SCIENCE 247:127–137 (2016). DOI 10.1016/j.plantsci.2016.03.014; IF = 3.362
40. Shahnejat-Bushehri S., Tarkowska D., Sakuraba Y., Balazadeh S. Arabidopsis NAC transcription factor JUB1 regulates GA/BR metabolism and signaling. NATURE PLANTS: article number 16013 (2016). DOI 10.1038/NPLANTS.2016.13; IF = 10.300
Mgr. DANUŠE TARKOWSKÁ, Ph.D.
5
41. Steiner E., Livne S., Kobinson-Katz T., Tal L., Pri-Tal O., Mosquna A., Tarkowská D., Mueller B., Tarkowski P., Weiss D. The Putative O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY inhibits class I TCP proteolysis to promote sensitivity to cytokinin. PLANT PHYSIOLOGY 171: 1485–1494 (2016). DOI 10.1104/pp.16.00343; IF = 6.280
42. Tarkowská D.*, Strnad M. Plant ecdysteroids: plant sterols with intriguing distributions, biological effects and relations to plant hormones. PLANTA 244: 245–555 (2016). DOI 10.1007/s00425-016-2561-z; IF = 3.239
43. Tarkowská D.*, Novák O., Oklestkova J., Strnad M. The determination of 22 natural brassinosteroids in a minute sample of plant tissue by UHPLC–ESI–MS/MS. ANALYTICAL AND BIOANALYTICAL CHEMISTRY 408: 6799–6812 (2016). DOI 10.1007/s00216-016-9807-2; IF = 3.125
44. Martín-Rodríguez J.A., Huertas R., Ho-Plágaro T., Ocampo J.A., Turečková V., Tarkowská D., Ludwig-Müller J., García-Garrido J.M. Gibberellin-abscisic acid balances during arbuscular mycorrhiza formation in tomato. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE 7: 1273 (2016). DOI 10.3389/fpls.2016.01273; IF = 4.495
45. Boccaccini A., Lorrai R., Ruta V., Frey A., Mercey-Boutet S., Marion-Poll A., Tarkowská D., Strnad M., Costantino P., Vittorioso P. The DAG1 transcription factor negatively regulates the seed-to-seedling transition in Arabidopsis acting on ABA and GA levels. BMC PLANT BIOLOGY 16: 198 (2016). DOI 10.1186/s12870-016-0890-5; IF = 3.631
46. Niehaus E.M., Muensterkoetter M., Proctor R., Brown D., Sharon A., Idan Y., Oren-Young L., Sieber C., Novak O., Pencik A., Tarkowska D., et al. Comparative "omics" of the Fusarium fujikuroi species complex highlights differences in genetic potential and metabolite synthesis. GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION 8(11): 3574–3599 (2016). DOI 10.1093/gbe/evw259; IF = 4.098
47. Asari S., Tarkowská D., Rolčík J., Novák O., Palmero Vellázquez D., Bejai S., Meijer J. Analysis of plant growth-promoting properties of Bacillus amyloliquefaciens UCMB5113 using Arabidopsis thaliana as host plant. PLANTA 245:15–30 (2017). DOI 10.1007/s00425-016-2580-9; IF = 3.239
48. Ševčíková H., Mašková P., Tarkowská D., Mašek T., Lipavská H. Carbohydrates and gibberellins relationship in potato tuberization. JOURNAL OF PLANT PHYSIOLOGY 214:53–63 (2017). DOI 10.1016/j.jplph.2017.04.003; IF = 2.971
49. Oklestkova J., Tarkowská D., Eyer L., Elbert T., Marek A., Smržová Z., Novák O., Fránek M., Zhabinski V.N., Strnad M. Immunoaffinity chromatography combined with tandem mass spectrometry: a new tool for the selective capture and analysis of brassinosteroid plant hormones. TALANTA 170:432–440 (2017). DOI 10.1016/j.talanta.2017.04.044; IF = 4.035
50. Wei Y., Zuan T., Tarkowská D., Kim J., Nam H.G., Novák O., He K., Gou X., Li J. COG1 regulates brassinosteroid biosynthesis via PIF4 and PIF5 in Arabidopsis thaliana. PLANT PHYSIOLOGY 174: 1260–1273 (2017) DOI 10.1104/pp.1601.778; IF = 6.280
51. Béres T., Dragull K., Pospíšil J., Tarkowská D., Dančák M., Bíba O., Tarkowski P., Doležal K., Strnad M. Quantitative analysis of ingenol in Euphorbia species via validated isotope dilution ultra-high
Mgr. DANUŠE TARKOWSKÁ, Ph.D.
6
performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry. PHYTOCHEMICAL ANALYSIS 29:23–29 (2018). DOI 10.1002/pca.2711; IF = 2.292
52. Lenser T., Tarkowská D., Novák O., Wilhelmsson P., Rensing S., Strnad M., Theissen G. Fruit dimorphism is linked to shoot branching in Aethionema. THE PLANT JOURNAL 94:252–371 (2018). DOI 10.1111/tpj.13861; IF = 5.901
53. Liu Q., Vain T., Viotti ., Doyle S.M., Tarkowská D., Novák O., Zipfel C., Sitbon F., Robert S., Hofius D. Vacuole integrity maintained by DUF300 proteins is required for brassinosteroid signaling regulation. MOLECULAR PLANT 11:553–567 (2018). DOI 10.1016/j.molp.2017.12.015; IF = 8.827
54. Racca S., Welchen E., Gras D., Tarkowská D., Turečková V., Maurino V., Gonzalez D. Interplay between cytochrome c and gibberellins during Arabidopsis vegetative development. THE PLANT JOURNAL 94:105–121 (2018). DOI 10.1111/tpj.13845; IF = 5.901
55. Tarkowská D.*, Strnad M. Isoprenoid-derived plant signaling molecules: biosynthesis and biological importance. PLANTA 247:1051-1066 (2018). DOI 10.1007/s00425-018-2878-x; IF = 3.239
56. Stirk W.A., Bálint P., Tarkowská D., Strnad M., van Staden J., Ördög V. Endogenous brassinosteroids in microalgae exposed to salt and low temperature stress. EUROPEAN JOURNAL OF PHYCOLOGY 53:273–279 (2018). DOI 10.1080/09670262.2018.1441447; IF 2.412
57. Lenser T., Tarkowská D., Novák O., Wilhelmsson P.K.I., Bennett T., Rensing S.A., Strnad M., Theißen G. When the BRANCHED network bears fruit: How carpic dominance causes fruit dimorphism in Aethionema. THE PLANT JOURNAL 94:352–371 (2018). DOI 10.1111/tpj.13861; IF = 5.901
58. Tarkowská D*., Strnad M. Isoprenoid-derived plant signaling molecules: biosynthesis and biological importance. PLANTA 247:1051–1066 (2018). DOI 10.1007/s00425-018-2878-x; IF = 3.239
59. Tůmová L., Tarkowská D., Řehořová K., Marková H., Kočová M., Rothová O., Čečetka P., Holá D. Drought-tolerant and drought-sensitive genotypes of maize (Zea mays L.) differ in contents of endogenous brassinosteroids and their drought-induced changes. PLOS ONE 13(5):e0197870 (2018). DOI 10.1371/journal.pone.0197870; IF = 2.806
60. Šimura J., Antoniadi I., Široká J., Tarkowská D., Strnad M., Ljung K., Novák O. Plant hormonomics: multiple phytohormone profiling by targeted metabolomics. PLANT PHYSIOLOGY (2018). DOI 10.1104/pp.18.00293; IF = 6.456
61. Gommers Ch., Buti S., Tarkowská D., Pěnčík A., Banda J., Arricastres V., Pierik R. Organ-specific phytohormone synthesis in two Geranium species with antithetical responses to far-red light enrichment. PLANT DIRECT 1-12 (2018). DOI 10.1002/pld3.66; IF zatím není stanoven
62. Bahaji A., Almagro G., Ezquer I., Gámez-Arcas S., Sánchez-López A.M., Muñoz F.J., José Barrio R., Sampedro M.C., De Diego N., Spíchal L., Doležal K., Tarkowská D., Caporali E., Mendes M.A., Baroja-Fernández E., Pozueta-Romero J. Plastidial phosphoglucose isomerase is an important determinant of seed yield through involvement in gibberellin-mediated reproductive development and biosynthesis of storage reserves in Arabidopsis. PLANT CELL (2018). DOI 10.1105/tpc.18.00312; IF = 8.228
Mgr. DANUŠE TARKOWSKÁ, Ph.D.
7
• Kapitoly v monografiích nebo knihách 1. Tarkowská D., Strnad M.: Protocol for extraction and isolation of brassinosteroids from plant tissue. In:
Brassinosteroids: Methods and Protocols, Russinova E and Caño-Delgado A. (Eds.), Springer Science+Business Media, LLC, New York, USA. DOI 10.1007/978-1-4939-6813-8, eBook ISBN 978-1-4939-6813-8, Hardcover ISBN 978-1-4939-6811-4
Konferenční příspěvky
Zvané přednášky
Seznam zvaných přednášek je uveden ve formátu rok – místo – instituce/konference – název přednášky
2017 – Gent, Belgie – Ghent University – Ultra trace analysis in biological research
2016 – Osnabrück, Německo – University of Osnabrück – Changes in gibberellins biosynthesis and
metabolism under light controlled conditions
2016 – Rehovot, Izrael – Hebrew University of Jerusalem, Robert H. Smith Faculty of Agriculture, Food and
Environment – Phytohormone profiling by mass spectrometry
2016 – Vídeň, Rakousko – Gregor Mendel Institute of Molecular Plant Biology – Plant hormones in
Aethionema arabicum
2015 – Velké Karlovice, Česká republika – International Conference “Biotechnology of Phytohormones and
Natural Substances” – Analytical tools for gibberellin and phytoecdysteroids research
2014 – Třeboň, Česká republika – Plant Cell Cycle Workshop – The analysis and occurrence of selected plant
hormones in algae
2014 – Praha, Česká republika – 22nd Conference on Isoprenoids – Targeted analysis of naturally occurring
brassinosteroids and plant ecdysteroids of biological importance
2013 – Vídeň, Rakousko – Medizinische Universität Wien – Brassinosteroids – growth-promoting substances
2010 – Tarragona, Španělsko – 20th International Conference on Plant Growth Substances – Determination
of naturally occurring brassinosteroids by UPLC-MS/MS in planta
2010 – Les Diablerets, Švýcarsko – University of Lausanne – The analytical tools for brassinosteroid analysis
Příspěvky na konferencích
1. Tarkowská D., Kopecký P., Tarkowski P.: Profiling of phytoecdysteroids and gibberellins during early stages of ontogenesis of superfood quinoa. 42nd Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS) on From Molecules to Cells and Back, Jerusalem, Izrael, 2017.
2. Tarkowská D., Strnad M.: Novel approach for targeted profiling of plant ecdysteroids by UHPLC-MS/MS
vs. SFC-UV/MS. World Congress of Chromatography, Amsterdam, Holandsko, 2016.
Mgr. DANUŠE TARKOWSKÁ, Ph.D.
8
3. Marion-Poll A., Tarkowská D., Strnad M., Lorrai R., Boccaccini A., Ruta V., Costantino P., Vittorioso P.: The Arabidopsis DAG1 transcription factor controls the dormancy/germination developmental switch acting on the balance of ABA and GA. 22nd International Conference on Plant Growth Substances, Toronto, Kanada, 2016.
4. Götz K. P., Chmielewski F. M., Tarkowská D., Strnad M.: New insights into sweet cherry´s dormancy. 3rd
International Conference on Phenology, Kusadasi, Turecko, 2015.
5. Béres T., Dragull K., Pospíšil J., Tarkowská D., Dančák M., Doležal K., Strnad M.: Analysis of ingenol and its conjugates in some species of the Euphorbia genus by ultra-high performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry using isotope dilution method. 63rd International Congress and Annual Meeting of the Society for Medicinal Plant and Natural Product Research, Budapešť, Maďarsko, 2015.
6. Tarkowská D., Strnad M.: Targeted analysis of naturally occurring brassinosteroids and plant ecdysteroids of biological importance. 22nd Conference on Isoprenoids, Praha, Česká republika, 2014.
7. Kamlar M., Salajková S., Rezek J., Rothová O., Tarkowská D., Drašar P., Kočová M., Harmatha J., Holá
D., Kohout L., Macek T.: Exogenous brassinosteroids induce changes in ecdysteroid content in plants. 22nd Conference on Isoprenoids, Praha, Česká republika, 2014.
8. Kamlar M., Holá D., Salajková Š., Kočová M., Tarkowská D., Drašar P., Rothová O., Macek T.: Exogenous oxysterols increase the net photosynthetic rate, O2 production and CO2 binding. 11th International Phytotechnologies Conference, Kréta, Řecko, 2014.
9. Tarkowská D., Filek M., Biesaga-Kościelniak J., Marcińska I., Krekule J., Strnad M.: Cytokinins and gibberellins in Brassica napus plants during vernalization, EPSO, Porto Heli, Řecko, 2013.
10. Ševčíková H., Konrádová H., Mašková P., Tarkowská D., Lipavská H.: Spontaneously tuberizing potato – a model plant for tuber induction study. 11. dni doktorandov experimentálnej biológie rastlín a 13. konferencia experimentálnej biológie rastlín. Košice, Slovenská republika, 2013.
11. Tarkowská D., Oklešťková J., Novák O., Strnad M.: Routine quantitative analysis of naturally occurring
brassinosteroids by UPLC-MS/MS in planta. 1st International Brassinosteroid Conference, Barcelona, Španělsko, 2012.
12. Tarkowská D., Strnad M., Schmülling T.: Metabolism of isoprenoid cytokinins and identification of new substances in transgenic tobacco plants expressing rolC gene. 2nd Cytokinin meeting, Berlín, Německo, 2012.
13. Strnad M., Novák O., Rolčík J., Tarkowská D., Grúz J., Doležal K.: Phytohormone targeting in plant
tissues. IUFRO Tree Biotechnology Conference: From Genomes to Integration and Delivery. Arraial d Ajuda, Bahia, Brazílie, 2011.
14. Tarkowská D., Strnad M.: Determination of naturally occurring brassinosteroids by UPLC-MS/MS in planta. 20th International Conference on Plant Growth Substances, Tarragona, Španělsko, 2010.
Mgr. DANUŠE TARKOWSKÁ, Ph.D.
9
15. Nordström A., Sandberg G., Tarkowski P., Tarkowská D., Doležal K., Åstot C.: Cytokinin biosynthesis and interaction with auxin. Annual Meeting of the American Society of Plant Biologist, Honolulu, USA, 2003.
16. Pěchová D., Kotouček M.: Voltammetric determination of 6-benzylaminopurine. 8th International Conference on Electroanalysis (ESEAC 2000), Bonn, Německo, 2000.
Práce publikované ve sbornících konferencí
1. Tarkowská D., Kopecký P., Tarkowski P. Profiling of phytoecdysteroids and gibberellins during early stages of ontogenesis of superfood quinoa. 42nd Congress of the Federation-of-European-Biochemical-Societies (FEBS) on From Molecules to Cells and Back, FEBS Journal 284: 359-360, 2017. ISSN: 1742-464X
2. Tarkowská D., Strnad M.: Targeted analysis of naturally occurring brassinosteroids and plant ecdysteroids of biological importance. 22nd Conference on Isoprenoids, Chemické listy 108, p. 118, 2014.
3. Kamlar M., Salajková S., Rezek J., Rothová O., Tarkowská D., Drašar P., Kočová M., Harmatha J., Holá D., Kohout L., Macek T.: Exogenous brassinosteroids induce changes in ecdysteroid content in plants. 22nd Conference on Isoprenoids, Chemické listy 108, p. 132, 2014.
4. Doležal K., Hauserová E., Popa I., Tarkowská D., Hradecká V., Trávníček Z., Strnad M.: Methoxybenzylaminopurines - new endogenous class of cytokinins. 18th IPGSA conference, Conference Handbook, p. 85, Canberra, Austrálie, 2004.
5. Salopek-Sondi B., Tarkowski P., Tarkowská D., Strnad M., Magnus V.: Cytokinins in fertilized flowers of Helleborus niger L. 18th IPGSA Conference, Conference Handbook, p. 110, Canberra, Austrálie, 2004.
6. Nordström A., Sandberg G., Tarkowski P., Tarkowská D., Doležal K., Åstot C.: Cytokinin biosynthesis and interaction with auxin. Plant Biology 2003 - the 2003 Annual Meeting of the American Society of Plant Biology, p. 141, Honolulu, USA, 2003.
7. Doležal K., Tarkowski P., Tarkowská D., Popa I., Holub J., Strnad M. Isolation, identification and biological activity of new endogenous cytokinin class. Plant Biology 2003 - the 2003 Annual Meeting of the American Society of Plant Biology, p. 150, Honolulu, USA, 2003.
8. Sandberg G., Tarkowski P., Petersson S.V., Tarkowská D., Benfey P., Doležal K., Ljung K.: Cellular resolution of the distribution of IAA, IAA precursors and conjugates in Arabidopsis thaliana root tips. Biologia Plantarum 49: S26, Conference Auxins and Cytokinins in Plant Development, Praha, Česká republika, 2005. ISSN: 0006-3134
9. Pěchová D., Kotouček M.: Voltametric determination of 6-benzylaminopurine. Electroanalysis, Book of Abstracts, Emons H., Ostapczuk P. (Editors), D23, Bonn, Německo (2001). ISBN 3-89336-26
Mgr. DANUŠE TARKOWSKÁ, Ph.D.
10
2. Výzkumné projekty (řešitel, spoluřešitel, člen týmu)
• MŠMT
LO1204 (2014-2019): Národní program udržitelnosti I. Řešitel: I. Frébort – členka řešitelského týmu
GAČR 1810349S (2018-2020): Biosyntéza a signalizace u giberelinů - identifikace nových cílů pro
regulaci růstu rostlin. Řešitel: P. Hedden – spoluřešitelka
Aplikace výsledků
• Ověřená technologie (druh výsledku Z podle RIV)
1. Strnad M., Tarkowská D., Hényková E., Doležal K., Novák O., Havlíček L.: New technology for production of [15N4]meta-topolin (2010). Identifikační kód RIV: RIV/61989592:15310/10:10216972
2. Strnad M., Szüčová L., Tarkowská D., Doležal K., Novák O., Havlíček L.: New production technology for [15N4]meta-methoxytopolin (2010). Identifikační kód RIV: RIV/61989592:15310/10:10216971
3. Strnad M., Doležal K., Novák O., Havlíček L., Hényková E., Tarkowská D.: Technology for syntheses of aromatic cytokinin [15N4]ortho-topolin (2010). Identifikační kód RIV: RIV/61989592:15310/10:10216978
4. Strnad M., Tarkowská D., Hényková E., Doležal K., Novák O., Havlíček L.: Technology leading to production of [15N4]para-topolin (2010). Identifikační kód RIV: RIV/61989592:15310/10:10216981
Audiovizuální tvorba (druh výsledku A podle RIV)
1. Nordström A., Tarkowski P., Tarkowská D., Doležal K., Sandberg G., Moritz T.: Analysis of nucleotides, ribosides and bases in a single run with capillary reversed phase liquid chromatography - positive electrospray-MS/MS detection. Identifikační kód RIV: RIV/61989592:15310/03:00001586
Mgr. DANUŠE TARKOWSKÁ, Ph.D.
12
3. Pedagogická činnost
Kandidátka vykonává pedagogickou činnost na Přírodovědecké fakultě Univerzity Palackého v
Olomouci nepřetržitě od zimního semestru roku 2012, přičemž za tu dobu byla pověřena výukou či se stala
garantem (G) přednášek (P) a seminářů (S) těchto předmětů: Bioanalytika (P), Izolační a purifikační techniky
(P), Experimentální metody chemie 1 (P, S), Experimentální metody chemie 2 (G, P, S). Časový rozsah výuky
je následující:
Přednášky
Experimentální metody chemie 1 (LRR/EMCH1), PřF UP v Olomouci – 2h/týden (zimní semestr)
Experimentální metody chemie 2 (LRR/EMCH2), PřF UP v Olomouci – 2h/týden (letní semestr)
Izolační a purifikační metody (LRR/PTECH), PřF UP v Olomouci – 2h/týden (zimní semestr)
Bioanalytika (LRR/BIOAN), PřF UP v Olomouci – 2h/týden (zimní semestr)
Semináře
Experimentální metody chemie 1 (LRR/EMCH1), PřF UP v Olomouci – 2h/týden (zimní semestr)
Experimentální metody chemie 2 (LRR/EMCH2), PřF UP v Olomouci – 2h/týden (letní semestr)
Vedení a oponentura absolventských prací
Práce jsou uvedeny ve formátu rok obhajoby/předpokládaný rok obhajoby práce – jméno studenta –
název práce
Vedené bakalářské práce na UP
2015 – Jana Demlová – Profilování farmakologicky významných fytoekdysteroidů ve vybraných rostlinných
druzích
2017 – Eliška Krampolová – Interakce brassinosteroidů a fytoekdysteroidů v rostlinách
2018 – Libuše Pechová – Analýza přírodních sympatolytik
Vedené diplomové práce na UP
2016 – Bc. Kateřina Mašková – Studium fytoekdysteroidů během ontogeneze špenátu setého (Spinacia
