MenuPlot
Plots Plots
Uživatelem definované grafické výstupy
• Všem grafům je předřazena společná sada
dialogových oken pro výběr vzorků
• Vykreslí se projekce těch vzorků, pro které jsou k
disposici příslušná data (odfiltrují se analýzy s
chybějícími daty)
• Většinu grafů lze dále editovat pomocí menu Plot
editing
• Grafy se otevírají v samostatných oknech, která lze
uložit v podobě souboru
Plots Plots
Plots Plots
(Calculations | CIPW Calculations | Append results to data Plots | Ternary)
Plots: 3D plot Plots: 3D plot
Grafem lze rotovat zadáním úhlu
otočení kolem jednotlivých os
Plots: xyz plot with circles Plots: xyz plot with circles
V binárním grafu je třetí proměnná vyjádřená velikostí/barvou bodů
Plots Plots
Sada grafů závislosti jedné proměnné na dalších (obojí lze definovat
libovolně z dostupných dat) (Harkerovy diagramy ap.)
Plots Plots
hodnotě třetí proměnné rozčleněné do intervalů (Coplot) nebo podle skupin
(Coplot by group)
Vykreslí sérii binárních
diagramů v závislosti na
Plots Plots
Spidergramy podle pořadí a
normalizačních hodnot různých autorů
Vlastní sestavu prvků lze definovat v
souboru GCDkit\spider.data
Citace předdefinovaných hodnot - viz
nápověda k funkci select.norm
Normalizovat lze i vybraným vzorkem (SAMPLE) nebo průměrem (MEAN OF
(SPECIFIED) SAMPLES)
•MORB (Pearce 1983)–Sr, K, Rb, Ba, Th, Ta, Nb, Ce, P, Zr, Hf, Sm, Ti, Y, Yb
•NMORB (Sun & McDonough 1989)–Cs, Rb, Ba, Th, U, Nb, K, La, Ce, Pb, Pr, Sr, P, Nd, Zr, Sm, Eu, Ti, Dy, Y, Yb, Lu
•EMORB (Sun & McDonough 1989)–Cs, Rb, Ba, Th, U, Nb, K, La, Ce, Pb, Pr, Sr, P, Nd, Zr, Sm, Eu, Ti, Dy, Y, Yb, Lu
•PrimitiveMantle (Sun & McDonough 1989)–Cs, Rb, Ba, Th, U, Nb, K, La, Ce, Pb, Pr, Sr, P, Nd, Zr, Sm, Eu, Ti, Dy, Y, Yb, Lu
•OIB(Sun & McDonough 1989)–Cs, Rb, Ba, Th, U, Nb, K, La, Ce, Pb, Pr, Sr, P, Nd, Zr, Sm, Eu, Ti, Dy, Y, Yb, Lu
•REE chondrite (Boynton 1984)–La, Ce, Pr, Nd, Pm, Sm, Eu, Gd, Tb, Dy, Ho, Er, Tm, Yb, Lu
•ORG (Pearce et al.1984)–K2O, Rb, Ba, Th, Ta, Nb, Ce, Hf, Zr, Sm, Y, Yb
•Chondrite (Thompson 1982)–Ba, Rb, Th, K, Nb, Ta, La, Ce, Sr, Nd, P, Sm, Zr, Hf, Ti, Tb, Y, Tm, Yb
•Upper crust (Taylor & McLennan 1985)–Rb, Ba, Th, U, K, Nb, Ta, La, Ce, Sr, Nd, P, Hf, Zr, Sm, Ti, Tb, Y, Tm, Yb
•Lower crust (Weaver & Tarney 1984)–Rb, Ba, Th, U, K, Nb, Ta, La, Ce, Sr, Nd, P, Hf, Zr, Sm, Ti, Tb, Y, Tm, Yb
•Average crust (Weaver & Tarney 1984)–Rb, Ba, Th, U, K, Nb, Ta, La, Ce, Sr, Nd, P, Hf, Zr, Sm, Ti, Tb, Y, Tm, Yb
Plots Plots
REEREE
LILELILE
HFSEHFSE
Plots Plots
Plots Plots
Uloží parametry binárního nebo
ternárního grafu pro
opakované použití do souboru
Vyvolání pomocí menu:
File | Source R code
Plots Plots Blabla2
Plots - peterplotPlots - peterplot
Ano přiřadí symboly pro použití v dalších graf. výstupech
INTERMEZZO - ukládání INTERMEZZO - ukládání
Teoreticky:
• rastrový (bitmapový) formát (.bmp, .png, .jpg)
– minimální možnost dalších úprav
+ jednoduché vkládání do textu (Word)
• vektorový formát (.ps, .wmf)
– náročnější na počítačovou gramotnost uživatele
+ bohaté možnosti editace ve vektorovém editoru (CorelDraw)
doporučená metoda
• formát .pdf - bez software Adobe nezpracovatelný
• kopírování přes schránku - obě první možnosti
INTERMEZZO - ukládání INTERMEZZO - ukládání Prakticky:
• v menu GCDkit | Save all
graphics ...
• V menu File (okno s grafem musí
být aktivní)
• Přes kontextové menu (pravé
tlačítko myši)
MenuClassification
ClassificationClassification Projekce do nejpoužívanějších
klasifikačních diagramů
detailní popis diagramů - viz nápověda
fungování:
• standardní sada dialog. Oken
• ...
ClassificationClassification• vykreslení grafu
• nabídka klasifikace jednotlivých
vzorků
• možnost připojit výsledky k
proměnné labels pro pozdější
použití
• souhrnné výsledky - R-console
• detailní v proměnné results
ClassificationClassification
Irvine T N & Baragar W R A (1971) A guide to the chemical classification of the common volcanic rocks. Can J Earth Sci 8: 523-548
ClassificationClassification
Peccerillo R & Taylor S R (1976) Geochemistry of Eocene calc-alkaline volcanic rocks from the Kastamonu area, Northern Turkey. Contrib Mineral Petrol 58: 63-81
ClassificationClassification
Shand (1943) Eruptive Rocks. John Wiley & Sons
ClassificationClassification
Le Bas M J, Le Maitre R W, Streckeisen A & Zanettin B (1986) A chemical classification of volcanic rocks based on the total alkali-silica diagram. J Petrology 27: 745-750
TAS digram nabízí i kompletní klasifikaci dle
IUGS (členění trachytických hornin, hi-Mg
hornin a test na obsah CO2 a H2O)
ClassificationClassification
Cox K G, Bell J D & Pankhurst R J (1979) The Interpretation of Igneous Rocks. George Allen & Unwin, p. 1-450 (see help for details)
ClassificationClassification
Jensen L S (1976) A new cation plot for classifying subalkalic volcanic rocks. Ont Div Mines, Misc Pap 66, 1-21 (see help for details)
ClassificationClassification
De La Roche H, Leterrier J, Grandclaude P & Marchal M (1980) A classification of volcanic and plutonic rocks using R1 - R2 diagram and major element analyses - its relationships with current nomenclature. Chem Geol 29: 183-210
ClassificationClassification
Winchester J A & Floyd P A (1977) Geochemical discrimination of different magma series and their differentiation products using immobile elements. Chem Geol 20: 325-343
ClassificationClassification
Winchester J A & Floyd P A (1977) Geochemical discrimination of different magma series and their differentiation products using immobile elements. Chem Geol 20: 325-343
ClassificationClassification
Debon F & Le Fort P (1983) A chemical-mineralogical classification of common
plutonic rocks and associations. Trans Roy Soc Edinb; Earth Sci 73: 135-149
ClassificationClassification
Debon F & Le Fort P (1983) A chemical-mineralogical classification of common plutonic rocks and associations. Trans Roy Soc Edinb; Earth Sci 73: 135-149
ClassificationClassification
Debon F & Le Fort P (1983) A chemical-mineralogical classification of common plutonic rocks and associations. Trans Roy Soc Edinb; Earth Sci 73: 135-149
MenuGeotectonic
GeotectonicGeotectonic
Mantle Fractionates Pre-plate Collision
Post-collision Uplift Late-orogenic
Anorogenic Syn-collision
Post-orogenic
Batchelor R A & Bowden P (1985) Petrogenetic interpretation of granitoid
rock series using multicationic parameters. Chem Geol 48: 43-55
GeotectonicGeotectonic
IAG Island Arc Granitoids CAG Continental Arc Granitoids
CCG Continental Collision Granitoids POG Post-orogenic Granitoids
RRG Rift-related Granitoids OP Oceanic Plagiogranites
CEUG Continental Epeirogenic Uplift Granitoids
Maniar P D & Piccoli P M (1989) Tectonic discrimina-
tions of granitoids. Geol Soc Amer Bull 101: 635-643
GeotectonicGeotectonic
ORG Ocean Ridge Granites
VAG Volcanic Arc Granites
WPG Within Plate Granites
COLG Collision Granites
Pearce J A, Harris N W & Tindle A G (1984) Trace element discrimination
diagrams for the tectonic interpretation of granitic rocks. J Petrology 25: 956-983
GeotectonicGeotectonic
GeotectonicGeotectonic
AI-AII Within-Plate Alkaline Basalts
AII-C Within-Plate Tholeiites
B P-type Mid-Ocean Ridge Basalts
D N-type Mid-Ocean Ridge Basalts
C-D Volcanic Arc Basalts
Meschede M (1986) A method of discriminating between different types of
mid-ocean ridge basalts ... Chem Geol 56: 207-218
GeotectonicGeotectonic
CAB Calc-Alkaline Basalts
IAT Island Arc Tholeiites
MORB Mid-Ocean Ridge Basalts
OIA Ocean Island Andesites
OIT Ocean Island Tholeiites
Mullen E D (1983) MnO/TiO2/P2O5: a minor element discriminant for
basaltic rocks of oceanic environments ... . Earth Planet Sci Lett 62: 53-62
GeotectonicGeotectonic
IAT Low-K Tholeiites
MORB Ocean Floor Basalts
CAB Island Arc Basalts
WPB Within Plate Basalts
Pearce J A & Cann J R (1973) Tectonic setting of basic volcanic rocks
determined using trace element analyses. Earth Planet Sci Lett 19: 290-300
GeotectonicGeotectonic
Within-plate Basalts
Island-arc basalts
Mid-ocean Ridge BasaltsPearce J A & Norry M J (1979) Petrogenetic implications of Ti, Zr, Y, and Nb
variations in volcanic rocks. Contrib Mineral Petrol 69: 33-47
GeotectonicGeotectonic
Spreading Center
Orogenic
Ocean Ridge
Ocean Island
Continental
Pearce T H, Gorman B E & Birkett T C (1977) The relationship between
major element geochemistry ... . Earth Planet Sci Lett 36: 121-132
GeotectonicGeotectonic
IAT Island-arc Tholeiites
CAB Calc-alkaline Basalts
N-MORB N-type Mid-ocean Ridge Basalts
E-MORB E-type Mid-ocean Ridge Basalts
WPT Within-plate Tholeiites
WPA Alkaline Within-plate Basalts
MenuPlot editing
Plot editingPlot editing
Implemenatace systému FIGARO pro vynášení a úpravy grafů v R
(autor C.M. Farrow)
Všechny úpravy se týkají naposledy použitého grafu !
Plot editingPlot editing
Plot editingPlot editing
Plot editingPlot editing
Plot editingPlot editing
Další použitelné parametry - viz nápověda
Plot editingPlot editing
Graf definovaný pomocí systému FIGARO lze:
• Uložit do souboru včetně dat (Save a graph)
• Načíst ze souboru (Load a graph)
• Překreslit (Redraw)
Plot editingPlot editing
Vložení:
• legendy
• libovolného textu (včetně stylu, barvy a velikosti)
• šipky (včetně barvy a stylu)
• obdélníku (včetně barvy)
Plot editingPlot editing
Linear fit: Proložení dat regresní přímkou (metoda nejmenších čtverců)
Proložit lze i podle jednotlivých skupin
Curve: vložení uživatelem definované křivky
Plot editingPlot editing Zoom - zvětší oblast označenou myší, kterou
zároveň vyšrafuje v původním grafu
Myší je třeba klikat v pořadí levý dolní roh,
pravý horní roh zoomované oblasti
Měnit lze i rozsah jednotlivých os
Plot editingPlot editing
Identifikace bodů - interaktivně (popisky)
Zvýraznění bodů - podle zadané
podmínky (červené kroužky)
Plot editingPlot editing
Vykreslí grafy pro jednotlivé skupiny (groups)
Pro přehlednost je namístě vypnout zobrazování textů v menu
GCDkit | plot annotations on plots?
Plot editingPlot editing
Definice skupin na základě polí označených
pomocí myši v diagramu (barvy byly
novým skupinám přiřazeny v menu
Data handling)
Plot editingPlot editing
Vloží izolinie kernelové hustoty bodů
jako parametr lze zadat šířku pásma
(bandwidth)
Plot editingPlot editing
Vykreslí izolinie podle hustoty bodů v
polích pravidelné sítě
Vhodné pro velmi rozsáhlé datové
soubory ( > 1000 bodů)
That’s all,folks!
Hah, hah, hah ...