Ústavní schůzkaÚstavní schůzka

Pondělí Pondělí 66. ledna 201. ledna 20144

Výčet nejdůležitějších událostí, co mne napadly  

1. Nové vedení SoS, audit SoS, noví zaměstnanci, struktura aj. – změny v přístupu k ústavům, atd.2. Nové vedení AVČR (předsedou zůstává Jiří Drahoš, ale mění se Akademická i Vědecká rada atd.)3. Rozpočet AVČR – více méně stejný jako v 2013, PaÚ si díky výborné produkci lehce polepší4. Změny v areálu, vestibul, nová cesta, závory, jezírka (M+M), fotky a cover stránky v PaÚ5. Velké hodnocení v 2015, o to víc publikovat v 20146. Folia Parasitologica si vedou skvěle, mají nejvyšší IF v historii (2.515), hodně submisí atd., posílejte tam!  

Our institute was successful in obtaining funding – at least most from BC, and not only from Czech sources, but also from highly competitive international sources, such as f.e.

Libor Grubhoffer et al.– European grant Jula Lukeš et al. - GAČR grantBohouš Sak et al. - GAČR grantGemma Alama et al. - GAČR grant (post-doc)several lab – funding for post-docs from EU

Nejdůležitější – pokud máme peníze, můžeme dělat vědu… Proto prosím – stále žádejte a pište a publikujte, pokud možnoco nejpestřeji…

ALENení to tak dobré, jak to vypadá!

2014 – 3!!! GAČRy (Sak, Lukeš, Gema Alama Bermejo) 2013 – 4 GAČRy (Hajdušek, Šíma, Kopáček, Oborník) 2012 – 11 GAČRů 2011 – 6 GAČRů

ROZPOČET ÚSTAVU

2013 Celkem 121 mil, z toho režie 47 mil (39%)!!

2012 Celkem 114 mil, z toho režie 46 mil (40%)

2011 Celkem 97 mil, z toho režie 53 mil (55%)

2013 2012

Papers with IF > 8 8 8

Papers with IF 117 120

Chapters 6 3

Monographs 5 0

Suma IF 408,38 399,48

VĚDECKÁ PRODUKCE - SROVNÁNÍ

Papers with IF > 4 (> 8) 2013(2.1.2013)

2012(2.8.2013)

Lukeš lab 15 (3) 14 (7)

Oborník lab 4 (2) 6 (3)

Zíková lab 0 0

Asahina-Jindrová lab 1 (1) 0

Horák lab 2 (1) -

Grubhoffer/Rudenko lab 2 (1) 1

Kopáček lab 1 1

Kopecký lab 2 1

Kotsyfakis lab 4 (1) 6

Hajdušek/Šíma lab 0 -

Holzer lab 1 2 (1)

Kváč lab 1 0

Scholz lab 2 1

Hypša/Štefka lab 2 (1) 0

Pomajbíková lab 0 -

Nebesářová lab 0 3

Relativized according to number of authors from individual labs.

Relative IF2013

(27.11.2013)2012

(7.1.2013)

Lukeš lab 97,9 112,7

Oborník lab 15,7 42,9

Zíková lab 0,0 3,3

Asahina-Jindrová lab 8,5 0,0

Horák lab 10,1 -

Grubhoffer/Rudenko lab 24,7 4,5

Kopáček lab 6,7 4,7

Kopecký lab 21,5 12,4

Kotsyfakis lab 29,3 47,0

Hajdušek/Šíma lab 0,0 -

Holzer lab 22,2 28,0

Kváč lab 45,6 27,5

Scholz lab 70,8 76,6

Hypša/Štefka lab 48,7 5,2

Pomajbíková lab 1,84 -

Nebesářová lab 18,0 22,8

Flegontov P., Votýpka J., Skalický T., Logacheva M.D., Penin A.A., Tanifuji G., Onodera N.T., Kondrashov A.S., Volf P., Archibald J.M., Lukeš J. 2013: Paratrypanosoma Is a Novel Early-Branching Trypanosomatid. CURRENT BIOLOGY 23: 1787–1793. IF = 9,494.

Husník F., Nikoh N., Koga R., Ross L., Duncan R. P., Fujie M., Tanaka M., Satoh N., Bachtrog D., Wilson A. C. C., von Dohlen C. D., Fukatsu T., McCutcheon J. P. 2013: Horizontal gene transfer from diverse bacteria to an insect genome enables a tripartite nested mealybug symbiosis. CELL 153(7): 1567–1578. IF = 31,957

Janouškovec J., Horák A., Barott K.L., Rohwer F.L., Keeling P.J. 2013: Environmental distribution of coral-associated relatives of apicomplexan parasites. ISME JOURNAL 7: 444–447. IF = 8,951

Janouškovec J., Sobotka R., Lai D.-H., Flegontov P., Koník P., Komenda J., Ali S., Prášil O., Pain A., Oborník M., Lukeš J., Keeling P.J. 2013: Split photosystem protein, linear-mapping topology and growth of structural complexity in the plastid genome of Chromera velia. MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION 30: 2447–2462. IF = 10,353

Kořený L., Oborník M., Lukeš J. 2013: Make it, take it or leave it: Heme metabolism of parasites. PLOS PATHOGENS 9: e1003088. IF = 8,136

Ma D., Mizurini D.M., Assumpçăo T.C.F., Li Y., Qi Y., Kotsyfakis M., Ribeiro J.M.C., Monteiro R.Q., Francischetti I.M.B. 2013: Desmolaris, a novel Factor XIa anticoagulant from the salivary gland of the vampire bat (Desmodus rotundus) inhibits inflammation and thrombosis. BLOOD 122: 4094–4106. IF = 9,060

Preston S.G., Majtán J., Kouremenou C., Rysnik O., Burger L.F., Cabezas-Cruz A., Guzman M.C., Nunn M.A., Paesen G.C., Nuttall P A., Austyn J.M. 2013. Novel immunomodulators from hard ticks selectively reprogramme human dendritic cell responses. PLOS PATHOGENS 9(6): e1003450. IF = 8,136

Ward J.D., Bojanala N., Bernal T., Ashrafi K., Asahina M., Yamamoto K.R. 2013: Sumoylated NHR-25/NR5A regulates cell fate during C. elegans vulval development. PLOS GENETICS 9: e1003992. IF = 8,517

ČLÁNKY S IF NAD 8

2013 – 2013 – nnejlepší článkejlepší článkyy podle Vědecké podle Vědecké rradadyy• molecular biology • 1a Janouškovec J., Sobotka R., Lai D.-H., Flegontov P., Koník P., Komenda J., Ali S., Prášil O., Pain A.,

Oborník M., Lukeš J., Keeling P.J. 2013: Split photosystem protein, linear-mapping topology and growth of structural complexityin the plastid genome of Chromera velia. Mol. Biol. Evol. 30: 2447–2462. IF=10,33

• 1b Kořený L., Oborník M., Lukeš J. Make it, take it or leave it: Heme metabolism of parasites. PLoS Pathogens 9: e1003088. IF = 8,136

• 1c Hashimi H., McDonald L., Stříbrná E., Lukeš J. 2013: Trypanosome Letm1 proteinis essential for mitochondrial potassium homeostasis. J. Biol. Chem. 288: 26914–26925. IF = 4,651

• organismal parasitology • 2a Flegontov P., Votýpka J., Skalický T., Logacheva M.D., Penin A.A., Tanifuji G., Onodera N.T.,

Kondrashov A.S., Volf P., Archibald J.M., Lukeš J. 2013: Paratrypanosoma Is a novel early-branching trypanosomatid. Current Biology 23: 1787–1793. IF= 9,494

• 2b Jirků Miloslav, Kvičerová J., Modrý D., Hypša V. 2013: Evolutionary plasticity in coccidia – Striking morphological similarity of unrelated coccidia (Apicomplexa) from related hosts: Eimeria spp. from African and Asian pangolins (Mammalia: Pholidota). Protist 164: 470–481. IF = 4,140

• 2c Bartošová P., Fiala I., Cinková M., Jirků Miloslav, Caffara M., Fioravanti M.L., Atkinson S.D., Bartholomew J.L., Holzer A.S. 2013: Sphaerospora sensu stricto: Taxonomy, diversity and evolution of a unique lineage of myxosporeans (Myxozoa). Mol. Phyl. Evol. 68: 93–105. IF = 4,066

•

ticks and tick born diseases • 3a Schwarz A., von Reumont B.M., Erhart J., Chagas A.C., Ribeiro J.M., Kotsyfakis M. (2013): De novo

Ixodes ricinus salivary gland transcriptome analysis using two next-generation sequencing methodologies. FASEB J. IF = 5,704

• 3b Sojka D., Franta Z., Horn M., Caffrey C.R., Mareš M., Kopáček P. 2013: New insights into the machinery of blood digestion by ficka. Trends Parasitol. 29: 276–285. IF = 5,513

• 3c Palus M., Vojtiskova M, Salat J., Kopecky J., Grubhoffer L., Lipoldova M., Demant P., Ruzek D. 2013: Mice with different susceptibility to tick-borne encephalitis virus infection show selective neutralizing antibody response and inflammatory reaction in the central nervous system. J. Neuroinflam. 10: 77. IF = 4,351

But ! general comparison of Czech research with

Western Europe and USA – still not good enough…

We need to double our production in order to close

the gap with the best EU countries, not necessarily

more papers, but higher impact and more respected

= cited papers

On top of that – CAS/AVCR has to produce at least

double than the best Czech universities

Nové laboratoře• Aleš Horák (Ogar)

• Ondřej Hajdůšek a Radek Šíma

• Katka Pomajbíková

• Od února 2014 přibude poslední – Zdeněk Paris (Parda)

• Cena AVČR pro mladé vědce – Dan Sojka (Sojkič)

• Wichterleho praemium – Roman Kuchta (Krtek)

• Post-doc z centrálních zdrojů AV – Ashlie Hartigan

Odchod laboratoří – na fakultu• Vašek Hypša (Vacátko)

• Honza Kopecký

• Martin Kostka (část laboratoře Astrid Holzer)

DŮLÉŽITÁ AKCE V LETECH 2014 A 2015

Přístavba celého patra na zvěřinci

Pro letošní rok investice ve výši 25 milionů, příští rok totéžNároky na stěhování laboratoří z chovů, na Tomáše a spol. Při udržení jejich fungování apod.

2NP-původní návrh

1NPsoucasne

SOCIAL FUNDSOCIAL FUND((použití prostředků)

• Příspěvek na stravování (úvazek 3/8)

• Půjčky na pořízení bytu a jeho vybavení

• Finanční pomoc v mimořádných situacích

• Významná životní výročí

• Kursy angličtiny (4 × 60 minut/týdně)