Vážení zdravotničtí pracovníci, vážení spoluobčané, · pro nemocnici a schvaluje výdej...

Laboratorní příručka úseku lékařské mikrobiologie CL SNO LP-CLSNO-M-2019-31-03

strana 1 (celkem 51)

S L E Z S K Á N E M O C N I C E V O P A V Ě

příspěvková organizace

Olomoucká 470/86

Opava

L A B O R A T O R N Í P Ř Í R U Č K A

Úseku L É K A Ř S K É M I K R O B I O L O G I E Centrálních laboratoří

2019



Seznam zkratek Aglu aglutinace ATB antibiotika ATM antimykotika CL centrální laboratoře Cp/ml kopie na mililitr DNA deoxyribonukleová kyselina EDTA ethylendiamintetraoctová kyselina ELISA Enzyme-Linked Immuno Sorbent Assay ESBL Extended-spectrum β-lactamases (širokospektré β-laktamázy) HA hemaglutinace IAv index avidity ICH imunochromatografie IČL identifikační číslo lékaře IČP identifikační číslo pracoviště IP index pozitivity IUD nitroděložní tělísko IU/ml mezinárodní jednotky na mililitr KFR komplement fixační reakce LP laboratorní příručka LPř léčivé přípravky M mikrobiologie MRSA methicilin rezistentní Staphylococcus aureus NASKL Národní autorizační středisko pro klinické laboratoře při České lékařské společnosti

Jana Evangelisty Purkyně PCR Polymerase Chain Reaction RRR rychlá reaginová reakce RT-PCR Realtime Polymerase Chain Reaction RNA ribonukleová kyselina SNO Slezská nemocnice v Opavě TBC tuberkulóza TP transfuzní přípravky TPHA Treponema pallidum hemaglutinace TRN tuberkulóza a respirační nemoci VRE vankomycin rezistentní enterokoky



1 INFORMACE O LABORATOŘI ............................................................................................................................... 4

1.1 KONTAKTNÍ ÚDAJE ..................................................................................................................................................... 4

1.2 ZAMĚŘENÍ LABORATOŘE ............................................................................................................................................ 4

1.3 ORGANIZACE LABORATOŘE ........................................................................................................................................ 4

1.4 REŽIM LABORATOŘE ................................................................................................................................................... 5

2 OBLAST NABÍZENÝCH SLUŽEB ........................................................................................................................... 5

2.1 SPEKTRUM VYŠETŘENÍ ............................................................................................................................................... 5

2.2 ANTIBIOTICKÉ STŘEDISKO .......................................................................................................................................... 6

2.3 KONZULTACE A HLÁŠENÍ VÝSLEDKŮ .......................................................................................................................... 6

3 ÚROVEŇ A STAV AKREDITACE ........................................................................................................................... 6

4 ZADÁVÁNÍ POŽADAVKŮ NA VYŠETŘENÍ ......................................................................................................... 6

4.1 POŽADAVKOVÉ LISTY – ŽÁDANKY .............................................................................................................................. 6

4.2 ÚSTNÍ POŽADAVKY NA VYŠETŘENÍ ............................................................................................................................. 7

4.3 STATIMOVÁ (URGENTNÍ) VYŠETŘENÍ .......................................................................................................................... 7

4.4 KRITÉRIA VYŘAZENÍ A ODMÍTNUTÍ BIOLOGICKÉHO MATERIÁLU ................................................................................. 8

4.5 VYŘIZOVÁNÍ STÍŽNOSTÍ ............................................................................................................................................. 8

5 PRIMÁRNÍ ODBĚR VZORKŮ A TRANSPORT DO LABORATOŘE ................................................................ 8

5.1 OBECNÉ ZÁSADY SPRÁVNÉHO ODBĚRU ....................................................................................................................... 8

5.2 VOLBA ODBĚROVÉHO SYSTÉMU ................................................................................................................................. 9

5.3 POKYNY K SPRÁVNÉMU ODBĚRU VZORKŮ ................................................................................................................ 10

Bakteriologické vyšetření respiračního traktu .............................................................................................................. 10

Bakteriologické vyšetření urogenitálního traktu .......................................................................................................... 11

Vyšetření stolice ............................................................................................................................................................ 12

Bakteriologické vyšetření klinického materiálu (stěry, tekutý materiál…) ................................................................... 12

Vyšetření klinického materiálu na přítomnost mykobakterií – speciální požadavky („Vyšetření na TBC“) ................ 13

Mykologické vyšetření .................................................................................................................................................. 14

Vyšetření na kontrolu sterility a mikrobiologie prostředí ............................................................................................. 14

PCR vyšetření ............................................................................................................................................................... 14 5.4 TRANSPORT VZORKŮ ................................................................................................................................................ 15

5.5 PŘÍJEM VZORKŮ ........................................................................................................................................................ 15

5.6 ZNAČENÍ VZORKŮ ..................................................................................................................................................... 15

6 HLÁŠENÍ VÝSLEDKŮ A PŘEDÁVÁNÍ NÁLEZŮ ............................................................................................... 16

7 ZMĚNY VÝSLEDKŮ ................................................................................................................................................ 17

8 LIKVIDACE POUŽITÝCH ODBĚROVÝCH MATERIÁLŮ .............................................................................. 17

9 SEZNAM VYŠETŘENÍ PROVÁDĚNÝCH NA ÚSEKU LÉKAŘSKÉ MIKROBIOLOGIE............................. 18

9.1 KULTIVAČNÍ VYŠETŘENÍ ........................................................................................................................................... 18

9.1.1 Bakteriologická vyšetření .................................................................................................................................... 19

Otorhinolaryngeální oblast .......................................................................................................................................... 19

Respirační trakt ............................................................................................................................................................ 20

Gastrointestinální trakt ................................................................................................................................................. 21

Urogenitální trakt ......................................................................................................................................................... 22

Krev, likvor ................................................................................................................................................................... 25

Další materiály ............................................................................................................................................................. 26

Screeningová vyšetření ................................................................................................................................................. 28

Kontrola sterility a mikrobiologie prostředí ................................................................................................................. 30

9.1.2 Mykologická vyšetření ......................................................................................................................................... 30

9.1.3 Mykobakteriologická vyšetření („Vyšetření na TBC“) ........................................................................................ 32

9.2 SÉROLOGICKÁ VYŠETŘENÍ ........................................................................................................................................ 34

9.2.1 Infekční sérologické, parazitologické a imunologické metody ............................................................................. 34

9.2.2 Molekulárně biologické vyšetření ........................................................................................................................ 45

9.3 Parazitologická vyšetření ......................................................................................................................................... 50



1 INFORMACE O LABORATOŘI

1.1 Kontaktní údaje

Název pracoviště: Úsek lékařské mikrobiologie Centrálních laboratoří

Vedoucí Centrálních laboratoří prim. Vladimír Kurfürst Telefon 553 766 430 E-mail [email protected] Vedoucí laborantka Centrálních laboratoří Eva Grabcová Telefon 553 766 432 E-mail [email protected]

Vedoucí pracovník úseku lékařské mikrobiologie RNDr. Miroslava Dvořáková Telefon 553 766 450 E-mail [email protected] Úseková laborantka lékařské mikrobiologie Iva Hamplová Telefon 553 766 452 E-mail [email protected] Garanti odbornosti RNDr. Miroslava Dvořáková RNDr. Pavel Moravec

RNDr. Martina Sosíková

MUDr. Daniel Pařízek

Mgr. Michal Beran

RNDr. Alexandra Nosková

http://www.nemocnice.opava.cz/index.php?menu=4&id=19

1.2 Zaměření laboratoře V laboratořích lékařské mikrobiologie jsou prováděna vyšetření bakteriologická, parazitologická, mykologická, serologická, vyšetření na mykobakteria a vyšetření molekulárně biologickými metodami. Součástí laboratoří je Antibiotické středisko. Procesy vyšetření jsou zaměřeny na účelnou diagnostiku klinického stavu pacientů v čase odpovídajícím klinickým potřebám. Vyšetření provádíme pro klinickou složku Slezské nemocnice, Sdružené zdravotnické zařízení Krnov a pro další zdravotnická zařízení včetně nestátních ambulantních pracovišť a samoplátců.

1.3 Organizace laboratoře Úsek lékařské mikrobiologie je umístěn v samostatné části budovy „O“ v přízemí objektu a v pavilonu „Y“. Do vnitřních prostor objektů je vstup zakázán z důvodů biologického rizika, povolen je pouze v odůvodněných případech za doprovodu personálu pracoviště.

mailto:[email protected]







Úsek lékařské mikrobiologie je členěn na laboratoře:

Laboratoř: Kontakty na laboratoře:

Příjem materiálu 553 766 453

Laboratoř molekulární biologie 553 766 454

Bakteriologická laboratoř (moče, stolice, KLI, JIP) 553 766 457, 553 766 445

Mykologická laboratoř 553 766 455

Laboratoř pro zpracování prim. ster. materiálu 553 766 458

Mykobakteriologická laboratoř 553 766 455

Laboratoř infekční sérologie 553 766 456

Serologická parazitologie 553 766 447

Parazitologie – pavilon „Y“ 553 766 459

Konzultační telefonické linky:

Antibiotické středisko 553 766 340 (primář infekčního oddělení)

Hlášení výsledků a konzultace 553 766 445 nebo 553 766 446

1.4 Režim laboratoře Pracovní doba: Pondělí – pátek: 7:00 – 15:30 hod. Sobota: 6:00 – 14:30 hod. Neděle: 7:00 – 12:30 hod. Příjem materiálu: Pondělí – pátek : 7:00 – 15:00 hod. Sobota: 6:00 – 14:00 hod. Neděle: 7:00 – 12:00 hod. Pohotovost: Je zajištěna po celou dobu mimo běžný provoz od 17:00. V pohotovostním režimu je provoz zajišťován laborantkou a vysokoškolským pracovníkem, kteří jsou přítomni na telefonu v dostupné vzdálenosti k pracovišti a v případě potřeby jsou přivoláni na pracoviště.

2 OBLAST NABÍZENÝCH SLUŽEB Laboratoř poskytuje služby v odbornosti lékařská mikrobiologie (bakteriologie, parazitologie, virologie, infekční sérologie, mykologie a mykobakteriologie, molekulární biologie) – odbornost je dle Seznamu zdravotních výkonů vydaného Ministerstvem zdravotnictví České republiky. Provádíme také vyšetření veterinárních vzorků a kontrolu sterility primárně sterilního materiálu.

2.1 Spektrum vyšetření Spektrum vyšetření viz kapitola 9 Seznam prováděných vyšetření.



Vyšetření, která neprovádíme, odesíláme pravidelně dvakrát denně přepravní službou do příslušných externích laboratoří (tzn. svoz Krnov 7:30 hod. a 12:45 hod., svoz Ostrava 7:30 – 8:00 hod. a 11:30 – 12:00 hod., svoz Laboratoře Agel 8:00 hod. a 11:30 hod.).

2.2 Antibiotické středisko Primář infekčního oddělení konzultuje a doporučuje antimikrobiální terapii na základě laboratorních výsledků a klinické diagnózy, spolupracuje s Lékovou komisí při výběru antimikrobiálních léků pro nemocnici a schvaluje výdej vázaných antibiotik, sleduje vývoj rezistence klinicky významných mikroorganismů.

2.3 Konzultace a hlášení výsledků Pro telefonická hlášení a konzultace jsou k dispozici odborní pracovníci mikrobiologie. V oblasti léčby a citlivostí/rezistencí kmenů na antibiotika konzultuje primář infekčního oddělení.

3 ÚROVEŇ A STAV AKREDITACE Pracoviště lékařské mikrobiologie je od roku 2011 zařazeno do registru klinických laboratoří. V roce 2016 pracoviště absolvovalo Audit II NASKLu a úspěšně prochází následujícími audity dle ISO 15189. Systém kvality je zajišťován prováděním interních kontrol kvality včetně interní auditní činnosti a pravidelnou účastí na externím hodnocení kvality organizovaným Státním zdravotním ústavem Praha.

4 ZADÁVÁNÍ POŽADAVKŮ NA VYŠETŘENÍ

4.1 Požadavkové listy – žádanky Žádanky pro nemocniční zařízení jsou k dispozici v elektronické podobě v příslušných NISech. Do laboratoře je doručena tištěná forma elektronické žádanky s odebraným materiálem. Žádanky pro mimonemocniční žadatele nabízíme v papírové formě. Žádanky jsou k dispozici na příjmu materiálu mikrobiologie. Na vyžádání papírové žádanky ochotně doručíme žadatelům. Žadatel si také může žádanku vytisknout z webových stránek: http://www.nemocnice.opava.cz/index.php?menu=4&id=19

Příjem materiálu je podmíněn správně vyplněnou žádankou!

Žádanka musí obsahovat tyto údaje:

rodné číslo/číslo pojištěnce datum narození a pohlaví pacienta, pokud nejsou jednoznačně určeny

číslem pojištěnce (např. u cizinců) jméno a příjmení kód pojišťovny diagnózu (za neplatnou považujeme diagnózu W… (příčinná dg.)) IČZ/IČP žadatele (IČP je dobré doplnit konkrétním oddělením nebo

pracovištěm zdravotnického zařízení) RAZÍTKO žadatele s podpisem (tato podmínka nemusí být splněna u

elektronických žádanek) datum odběru druh odebraného materiálu a anatomická lokalita, případně popisem

upřesnit lokalitu




druh požadovaného vyšetření (bakteriologické, mykologické, mykobakteriologické, parazitologické… )

Další žádoucí údaje:

adresa trvalého bydliště vedlejší diagnózy ATB terapie IČL žadatele jméno pracovníka provádějícího odběr další podstatné údaje: Návrat z ciziny; Pobyt v tropické oblasti;

Předoperační vyšetření; kontakt MRSA/ESBL; implantáty; tel. spojení na pacienta…

v případě, že se jedná o odběr stolice na bakteriologické vyšetření je žádoucí uvést telefonní číslo pacienta

Při přiřazování žádanky a materiálu se kontroluje dodaný odebraný materiál a shoda mezi žádankou a materiálem.

Požadavky na odebraný materiál:

musí být popsán jménem a příjmením a/nebo rodným číslem pacienta v případě dodání více odběrů na jedné žádance, musí být jednotlivé odběrové

soupravy popsány typem odebraného materiálu nebo pořadím odebraného materiálu

správný materiál vzhledem k požadovanému vyšetření volba správné odběrové soupravy dostatečné množství materiálu pro požadované vyšetření zkumavka nebo žádanka nesmí být v žádném případě potřísněna

materiálem Minimální požadovaná shoda mezi materiálem a žádankou je shoda příjmení a jména pacienta a/nebo rodného čísla, případně materiálu uvedeného na žádance a vlastního odebraného materiálu. Při příjmu materiálu je také kontrolováno dodržení podmínek pro dodání materiálu viz kapitola 9 Seznam vyšetření prováděných na úseku lékařské mikrobiologie. V případě zjištěné neshody mezi požadavky našeho pracoviště na žádanku a materiál je pracovník příjmu oprávněn materiál vyřadit a provedení vyšetření zamítnout viz kapitola 4.4 Kritéria vyřazení a odmítnutí biologického materiálu.

4.2 Ústní požadavky na vyšetření Tato forma doobjednání vyšetření je možná jen ve výjimečných a urgentních případech. Je možné doobjednat některá vyšetření na sérologii a molekulární biologii a to nejpozději do 48 hodin od přijetí vzorku do laboratoře. Dodatečná vyšetření nejsou možná u vzorků s požadavkem na kultivaci (bakteriologickou, mykologickou, mykobakteriologickou). Žadatel je vždy povinen zaslat novou, řádně vyplněnou žádanku s doordinovanými vyšetřeními.

4.3 Statimová (urgentní) vyšetření Požadavek na urgentní vyšetření musí být výrazně označen STATIM na průvodním listu, v rámci nemocnice je nutné požadavek statimového vyšetření dodat na žádance červené barvy. Výsledky statimového vyšetření jsou ihned po zhodnocení telefonicky hlášeny lékaři nebo zdravotní sestře. Kultivační vyšetření nelze ani v režimu statim urychlit (přínos vyšetření je závislý na určité minimální době kultivace). Na pohotovostní službě musí být materiál osobně předán službukonající laborantce.



Vyšetření prováděná v režimu Statim: Zhotovení a zhodnocení mikroskopického preparátu z likvoru Kultivační zpracování likvoru Latexová aglutinace z likvoru – průkaz antigenů původců bakteriální meningitidy Zhotovení a zhodnocení mikroskopického preparátu a kultivační zpracování u klinického

materiálu z akutních operací (hnisy, stěry…) nebo u vitálních indikací (krevní nátěr, sputum, moč… z ARO a JIP)

Kultivační a mikroskopické zpracování moče z dětského oddělení Mikroskopické zpracování pozitivní hemokultury Mikroskopické zhodnocení krevního nátěru. PCR vyšetření na chřipky, metody vyšetřované z likvoru – provádí se mimo víkendy. V pátek

doručit nejpozději do 11 hodin.

4.4 Kritéria vyřazení a odmítnutí biologického materiálu

Vzniknou-li na příjmu materiálu pochybnosti o validitě odebraného materiálu nebo nejsou-li přítomny všechny požadované informace na žádance, materiál může být vyřazen.

Možné nedostatky vedoucí k vyřazení materiálu: Chybějící, neúplné nebo nesprávné údaje na žádance Chybějící, neúplné nebo nesprávné údaje na odběrové soupravě Neshoda údajů na žádance a odebraném materiálu Žádaná metoda neodpovídá dodanému materiálu Odběr provedený do nevhodné odběrové soupravy Potřísnění zkumavky nebo žádanky materiálem Preanalytické nedostatky dodaného materiálu např.: chylózní, hemolytické sérum; nedostatek

materiálu na požadované vyšetření; dlouhá doba transportu

V případě vyřazení je vzorek zaevidován a nevyšetřen. O vyřazení je žadatel informován, žadateli je zaslán výsledkový list s uvedeným odůvodněním vyřazení.

4.5 Vyřizování stížností

Stížností se rozumí ústní nebo písemná výtka ze strany klienta nebo dodavatele, která upozorňuje na rozpor se závaznými předpisy týkající se činnosti laboratoře. Připomínka má charakter podnětu, který by pro daného klienta měl zajistit zlepšení úrovně služeb. Stížnosti lze podat do 30 dnů po obdržení výsledků vyšetření. Pokud není stížnost určena nebo adresována vedení laboratoře, přijímá ji kterýkoli pracovník laboratoře. V případě písemně podané stížnosti nebo závažné stížnosti je vždy vypracována písemná odpověď na stížnost. Písemná odpověď není vypracovaná pokud klient nebo dodavatel písemné vyjádření nevyžaduje.

5 PRIMÁRNÍ ODBĚR VZORKŮ A TRANSPORT DO LABORATOŘE

5.1 Obecné zásady správného odběru Při přípravě pacienta k odběru je nutné dodržovat zásady stanovené vyhláškou Ministerstva zdravotnictví České republiky č. 195/2005 Sb. O hygienických požadavcích na provoz zdravotnických zařízení. Příprava pacienta před vyšetřením může výrazným způsobem ovlivnit výsledek.



Každý vzorek by měl být odebrán z místa, kde lze předpokládat přítomnost patogenů, a to co nejdříve a před nasazením ATB terapie.

Odběr musí být proveden správným způsobem (asepticky, lege artis). Vzorek musí být odebrán do správných odběrových souprav. Vzorek i žádanka musí být jednoznačně a nezaměnitelně identifikovány. Vzorek musí být dopraven do laboratoře co nejrychleji, v odpovídajícím transportním médiu a

za správné teploty.

5.2 Volba odběrového systému

Odběrové systémy:

Tampon s transportním médiem

Součástí soupravy je sterilní tampon na plastové tyčince a odběrová zkumavka s transportním médiem. Vhodné pro odběr stěrů na bakteriologická a mykologická vyšetření.

Tampon na drátku s transportním médiem

Součástí soupravy je sterilní tampon na drátku a odběrová zkumavka s transportním médiem. Vhodné pro odběr stěrů (z uší, nosohltanu) na bakteriologická a mykologická vyšetření.

Tampon s transportním médiem (bez aktivního uhlí)

Součástí soupravy je sterilní tampon na plastové tyčince a odběrová zkumavka s transportním médiem. Vhodné pro odběr stěrů z prostředí (vyšetření sterilit)

Sterilní zkumavka

Sterilní zkumavka 10 ml. Vhodná pro odběr moče, aspirátu bronchu, jiného tekutého materiálu, kanyl event. tkáně na bakteriologické a mykologické vyšetření. Dále pro některé odběry na molekulárně biologické metody.

Zkumavka Urin-Monovette

Sterilní zkumavka 10 ml. Vhodná pro odběr moče na bakteriologické vyšetření.

Komerční odběrová souprava pro srážlivou krev

Vhodná pro odběry krve na serologická vyšetření a vyšetření metodami molekulární biologie.

Vacutainer zkumavka s Li - heparinem

Sterilní odběrová zkumavka s lithium - heparinem. Vhodná pro odběry krve na vyšetření QuantiFERON®-TB test. Odběrovou soupravu i s žádankou vydá laborantka na příjmu mikrobiologie. Tento druh odběru je nutné dodat do laboratoře před 8 hodinou ráno nebo do 11:30 hod., materiál musí být odeslán do smluvní laboratoře již v den odběru. V opačném případě může být materiál odmítnut.

Kontejner s lopatičkou Sterilní odběrová zkumavka s lopatičkou Vhodná pro odběry stolice na parazitologická vyšetření a průkazy antigenu patogenů ze stolice.

Kontejner 30 ml Sterilní odběrová zkumavka 30 ml se šroubovacím uzávěrem. Vhodná pro odběr sputa a jiných tekutých materiálů. Dále pro některé odběry na molekulárně biologické metody.

Kontejner 120 ml Odběrová nádobka s červeným šroubovým uzávěrem, sterilní. Vhodná pro odběr moče na přítomnost mykobakterií (TBC).

Laryngeální sonda Sterilní skleněná zkumavka s laryngeální sondou z chrommolybdenového drátu bez transportního média. Vhodné pro provedení laryngálního výtěru vyšetření na přítomnost



mykobakterií.

Mikroskopické podložní sklo

Vhodné pro odběry materiálu na přímou mikroskopii.

Hemokultura Hemokultivační lahvička obsahující tekuté kultivační médium. Aerobní; anaerobní; Pedi (dětská); mykotická. Vhodné pro odběr krve případně jiných tekutých materiálů.

Perianální otisk Sklíčko s nalepenou průhlednou páskou. Vhodné pro odběr vajíček roupů.

Uricult

Kombinované kultivační médium v plastové Petriho misce nebo v kontejneru se šroubovacím uzávěrem určené ke kultivaci mikrobů z odebrané moče. Určeno k okamžité kultivaci moče ihned po odběru na klinickém oddělení.

E-Swab Souprava obsahuje speciální odběrový tampon a transportní médium v odběrové zkumavce. Určené pro odběry na molekulárně biologické metody.

Zkumavka na helikobaktera

Sterilní zkumavka obsahující médium pro odběr bioptického materiálu ze stěny žaludeční sliznice. Dodává na vyžádání laboratoř lékařské mikrobiologie. Určeno pro průkaz Helicobacter pylori v bioptickém materiálu získaném gastroskopií.

Kultivační média

Zpravidla pevné agarové médium v Petriho misce. Druh vybírá laboratoř podle typu požadovaného vyšetření a na vyžádání dodá žadateli. Určeno pro přímé nanesení odebraného biologického vzorku nebo otisk. Vhodné např.: k vyšetření na Neisseria gonorrhoeae; otisky z prostředí, spad.

Konkrétní informace ke správné volbě odběrové soupravy pro konkrétní vyšetření je součástí tabulkové části.

Upozornění: Odběrový materiál s překročenou dobou exspirace nelze používat!

5.3 Pokyny k správnému odběru vzorků

Bakteriologické vyšetření respiračního traktu

Výtěr z krku (tonsil): Odběr provádět nejlépe ráno nalačno, pacient by neměl před odběrem jíst, pít, kouřit nebo si vyplachovat ústa. Provede se pomocí špachtle, kterou se stlačí kořen jazyka, provede se stěr z tonsil a tampon se zasune do transportního média. Při podezření na záškrt a jiné vzácné nákazy dle možností konzultovat s laboratoří předem. Výtěr z nosu: Tampon se zavede do obou nosních průduchů asi 1 – 2 cm hluboko a rotačním pohybem se setře nosní sliznice, pak se tampon zasune do transportního média.



Výtěr z nosohltanu: Odběr provádět ráno nalačno. Drátek ohnout o okraj zkumavky, špátlí stlačit kořen jazyka, provést stěr zadní klenby nosohltanu (vyhnout se tonsilám), drátek narovnat a zasunout do transportního média. Při podezření na pertuse dle možností konzultovat s laboratoří předem. Sputum: Odběr provádět ráno nalačno po provedení hygieny ústní dutiny nebo vypláchnutí úst vodou. Pacient vykašle sputum do sterilního kontejneru. Bronchoalveolární laváž (BAL), aspirát z bronchoskopie, aspirát z tracheostomické kanyly: Odběr provádět podle metodického návodu pro obor TRN.

Bakteriologické vyšetření urogenitálního traktu

Moč: Odebrat střední proud ranní moče, u infekcí prostaty poslední porci moče, u infekcí močové trubice první porci moče. Střední proud u muže: Po přetažení předkožky si pacient omyje glans vlažnou mýdlovou vodou a otře sterilní gázou. První porci moče močí pacient do WC, pak do odběrové nádobky. Střední proud u ženy: Po důkladné hygieně genitálií (žena si jednou rukou oddálí labia a druhou rukou si gázovým tamponem namočeným ve vlažné vodě očistí genitál směrem zepředu dozadu) močí žena první porci do WC, pak do odběrové nádobky. Cévkovaná moč: Po aseptickém zavedení sterilní cévky se prvních několik ml moče odstraní a k vyšetření se posílá až vzorek z následující porce. Dostatečné množství na vyšetření moče je asi 5 ml. Uricult: Vzorkem moči (střední proud nebo cévkovaná) je přelita nanášecí plocha Uricultu, která je poté kryta víčkem. Inokulovaný Uricult je možné ponechat na klinickém oddělení a inkubovat při pokojové teplotě po dobu 1-3 dní. Nebo může být transportována do laboratoře k inkubaci. V případě pozitivního nárůstu na klinickém oddělení by měl být Uricult transportován do laboratoře, doba přepravy či uchovávání plotny s pozitivním nárůstem by neměla překročit 24 hodin. Stěr z uretry: Výtěr se provádí nejlépe v ranních hodinách, pokud pacient ještě nemočil nebo 3 – 6 hodin po posledním močení. Před odběrem se otře ústí močové trubice sterilním tamponem zavede se odběrový tampon do ústí uretry u muže asi 2 – 3 cm, u ženy několik mm hluboko, pak zasunout tampon do transportního média. Výtěr z vaginy a cervixu: Výtěr z cervixu provádí lékař za použití zrcadel. Po odstranění hlenové zátky sterilním tamponem zavede lékař odběrový tampon do cervikálního kanálu 2 – 3 cm hluboko, pak tampon vloží do média. Výtěr z vaginy provádí lékař za použití zrcadel, tampon se nechá nasáknout materiálem v zadní klenbě poševní, pak se zasune do transportního média. Odběr z vaginy se provádí až po odběru z cervixu.



Pro zhotovení mikroskopického preparátu se odebere samostatný vzorek na tampon a zasune se do odběrové soupravy bez transportního média. Odběr na vyšetření Streptococcus agalactiae se provádí z bočních stěn dolní třetiny vaginy bez použití zrcadel. Ejakulát: Ejakulát odebrat po 3 – 4 denní sexuální abstinenci do sterilního kontejneru, event. prezervativu a poté přelít do sterilního kontejneru.

Vyšetření stolice

Při pobytu pacienta v rizikových oblastech zřetelně označit na žádance NÁVRAT Z CIZINY. Bakteriologické vyšetření stolice: Tampon zavést 1 – 2 cm do konečníku, po odběru zasunout do transportního média. Cílené vyšetření na Clostridium difficile toxin A/B a antigen, rotaviry a adenoviry, noroviry, Helicobacter pylori: Odebrat stolici velikosti hrášku nebo asi 0,5 ml tekuté stolice. V případě, že je požadováno více metod, je nutné dodat větší množství stolice. Parazitologické vyšetření stolice: Odebrat kusovou stolici (5 g) nebo tekutou stolici (1 ml). Odběr stolice opakovat 3x v rozmezí 3 - 7 dní. Možnost existence negativní fáze infekce, při níž nejsou ve stolici ani v perianálním otisku vajíčka ani cysty, ale klinické příznaky přetrvávají. Perianální otisk: Pacient si provádí odběr po probuzení, konečník se před odběrem neumývá ani neutírá. Lepící páska se odlepí od sklíčka, důkladně přitlačí do intergluteální rýhy, po odlepení se zpět přilepí na podložní sklíčko.

Bakteriologické vyšetření klinického materiálu (stěry, tekutý materiál…) Stěr, výtěr z rány: Provést stěr nebo výtěr z postiženého místa, nejlépe z hloubky i okraje rány, nedotknout se okolí léze, zasunout do transportního média. Je-li to možné, lépe provést odběr tekutého materiálu pro možnost mikroskopického vyšetření. Stěr ze spojivek: Po oddálení očního víčka setřít sekret ze spojivkového vaku směrem od vnitřního k zevnímu koutku oka, zasunout tampon do transportního média. Výtěr ze zevního zvukovodu: Tahem za boltec se vyrovná zevní zvukovod a za použití světelného zdroje se provede odběr z ložiska, pak tampon zasunout do transportního média. Hnis ze středního ucha při paracentéze: Provádí lékař specialista. Tekutý materiál: Odběr z postiženého místa provádí lékař sterilními nástroji za sterilních podmínek. Pro záchyt anaerobů je vhodné zabránit přístupu vzduchu použitím gumové zátky. Při požadavku také na anaerobní vyšetření není nutné dodávat dvě zkumavky s odebraným materiálem. V případě, že je požadováno více metod (např. bakteriologie, mykologie, sérologie) je nutné dodat dostatečný počet odběrových zkumavek.



Likvor: Odběr provádí lékař za sterilních podmínek punkční jehlou. První porce vytékajícího likvoru se pro bakteriologické vyšetření nehodí. Je vhodné odebrat asi 2 ml likvoru v závislosti na požadovaném druhu vyšetření. Katetr, kanyla, cévka, drén apod.: Pomocí sterilních nůžek a sterilní pinzety odstřihnout asi 2 – 5 cm materiálu a asepticky vložit do zkumavky nebo kontejneru. V případě zájmu jsme ochotni dodat sterilní zkumavky s glukózovým bujónem. Sekční materiál: Odběr provádí lékař sterilními nástroji se snahou o co nejmenší kontaminaci mikrobiotou z okolních lokalit. Tampon se po odběru zasune do odběrového média. Žaludeční biopsie pro průkaz Helicobacter pylori: Odběr provádí lékař pomocí endoskopu na specializovaném pracovišti. Hemokultura: Odběr provádět za aseptických podmínek. S použitím sterilních rukavic se provede dezinfekce místa vpichu a dezinfekce gumové zátky lahvičky. Po zaschnutí dezinfekčního přípravku se doporučuje provést stěr z kůže v místě vpichu k vyloučení případné kožní kontaminace. Odebraná krev – dospělí 3 – 10 ml, děti 1 – 3 ml – se vstříkne ihned do hemokultivačních lahviček. Gumovou zátku není nutné přelepovat. Každá hemokultura je označená odlepitelným kódem, který je nutno nalepit na žádanku v daném pořadí, jak byly hemokultury odebírány (v případě odběru více sad hemokultur to zajistí správné zařazení).

Vyšetření klinického materiálu na přítomnost mykobakterií – speciální požadavky („Vyšetření na TBC“) Sputum: 2-5 ml do sterilního kontejneru, doporučeny 3 odběry (3 dny po sobě). Moč: Ranní moč, střední proud do nádobek na 120 ml. Doporučujeme 6 odběrů po sobě (6 dní). Laryngeální výtěry: 1 vzorek = 3 laryngeální výtěry na drátku, odběr proveden tamponem zvlhčeným sterilním fyziologickým roztokem nad epiglotis, pacient musí zakašlat (odběrové tampony dodá mikrobiologie). Likvor: Minimálně 3 ml likvoru do sterilní zkumavky. Punktát, aspirát, tkáň: Odběr do sterilní zkumavky. Hnis: Odběr do sterilní zkumavky, případně stěry na tři tampony na drátku (odběrové tampony na požádání na oddělené mikrobiologie).

Pro odběry TBC nejsou vhodné soupravy s transportním médiem nebo umělohmotnou

tyčinkou!



Mykologické vyšetření K vyšetření je vhodný veškerý klinický materiál (sputum, moč, hnis, šupiny, nehty, vlasy, stěry, výtěry..), odběry viz Vyšetření na bakteriologii. Nutnou podmínkou je dostatek materiálu k požadovanému vyšetření.

Vyšetření na kontrolu sterility primárně sterilního materiálu a mikrobiologie prostředí Laboratoř sterilit kontroluje sterilitu transfuzních přípravků transfuzních oddělení, dále kontroluje sterilitu přípravků vyráběných nemocniční lékárnou (infuzní roztoky, oční kapky), provádí kontrolu mikrobiálního osídlení ze stěrů a otisků u personálu na klinických odděleních dle požadavků

zadávaných nemocničním hygienikem či epidemiologickou sestrou.

PCR vyšetření Výtěr z faryngu - sterilním tampónem krouživým pohybem důkladně vytřeme zadní stěnu faryngu, je nutné se vyhnout mandlím. Tampón vytřepeme do zkumavky s odběrovým médiem a zalomíme ve zkumavce. Materiál je vhodné transportovat na ledu, popř. při chladničkové teplotě. Výtěr z nosu - sterilní tampón šroubovitým pohybem zavedeme pod nosní skořepu a provedeme výtěr, tímto jedním tampónem provedeme výtěr i z druhé nosní dírky. Materiál je vhodné transportovat na ledu, popř. při chladničkové teplotě. Výtěr z nosohltanu - sterilním tampónem krouživým pohybem důkladně vytřeme zadní stěnu faryngu, je nutné se vyhnout mandlím. Tampón vytřepeme do zkumavky s odběrovým médiem a zalomíme ve zkumavce. Materiál je vhodné transportovat na ledu, popř. při chladničkové teplotě. BAL, tekutina z výplachu bronchů - vlastní odběr se provádí na specializovaném pracovišti. Materiál se odsává z míst s probíhajícím zánětem po vpravení vhodného objemu sterilního fyziologického roztoku do příslušné partie plic. Materiál je vhodné transportovat na ledu, popř. při chladničkové teplotě. Výtěr z uretry, děložního hrdla, pochvy, puchýřků, spojivek Výtěr z postižených míst provedeme sterilním tampónem, odběr ze sliznic musí být dostatečně razantní, tak aby došlo k setření epitelií. U výtěru z urogenitálního traktu platí nejprve setření slizničního hlenu a teprve druhým tampónem, nebo odběrovým kartáčkem se provede vlastní odběr Srážlivá krev – množství krve 2 – 5 ml (nebo 1ml odděleného séra) Zkumavka s aktivátorem hemokoagulace (odběrový systém BD Vacutainer červené víčko) – množství krve 2 – 5 ml Zkumavka s dělícím gelem (odběrový systém BD Vacutainer žluté víčko). Materiál je vhodné transportovat či uchovávat při chladničkové teplotě. Nesrážlivá krev Zkumavka s EDTA. Materiál je vhodné transportovat či uchovávat při chladničkové teplotě. Likvor - odběr likvoru provádí lékař za sterilních podmínek punkční jehlou (lumbální nebo komorová punkce). Je vhodné odebrat min. 0,2 – 1,5 ml likvoru. Materiál je vhodné transportovat či uchovávat při chladničkové teplotě. Moč - 5 – 10 ml moči ze středního proudu, při podezření na chlamýdiovou etiologii se zasílá první porce ranní moči. Materiál je vhodné transportovat či uchovávat při chladničkové teplotě.



Tkáně, bioptické materiály Odběry se provádí z postižené tkáně sterilními nástroji. Odebraná tkáň nebo bioptický vzorek se vloží do sterilní zkumavky na sucho nebo jen do minimálního množství sterilní vody. Okamžitě dodat do laboratoře nebo zamrazit při teplotě - 70°C, event. při - 20°C.

5.4 Transport vzorků Transport vzorků do laboratoře je zajištěn svozovou službou nebo ošetřovatelským personálem. Vzorky jsou dopravovány v transportních uzavřených boxech. Obecné podmínky transportu

Transport musí být dostatečně rychlý, aby nedošlo k znehodnocení odebraného materiálu. Při plánování času odběru pacienta je nutné počítat s rezervou pro dopravu a příjem vzorku

do laboratoře. Při extrémních vnějších teplotách je nutné zajistit ochranu vzorku transportem v boxech

zamezujících znehodnocení vzorku mrazem nebo horkem (chladicí vložka v létě, vytemperování boxu na laboratorní – pokojovou teplotu v zimě).

Vzorky musí být transportovány zároveň se žádankami nebo průvodkami k elektronickým žádankám.

Vzorky biologického materiálu musí být transportovány v kolmé poloze, uzavřené a odběrová nádobka ani žádanka nesmí být v žádném případě zvenčí potřísněna biologickým materiálem. Během transportu musí být odběrové nádoby umístěny v pevné a nepropustné nádobě nebo stojánku odděleně od žádanek.

Při odběru srážlivé krve je vhodné, aby se krev srazila v místě odběru (cca 20 minut při pokojové teplotě), čímž se zabrání možné hemolýze.

Při odběru nesrážlivé krve je vhodné před transportem ponechat krev vytemperovat na pokojovou teplotu.

Krev nesmí být vystavena přímému světlu, vede to k odbourávání bilirubinu.

Speciální podmínky transportu U citlivých analýz je nutné dodržet časové nároky na transport v souladu se stabilitou analytu

(např. Quantiferon). Vyšetření, která mají speciální požadavky na preanalytickou fázi jsou přijaté do laboratoře

pouze za předpokladu splnění těchto požadavků. Podmínky pro transport a uchovávání jsou uvedeny v tabulkové části kapitola 9 Seznam prováděných vyšetření.

5.5 Příjem vzorků Materiál a žádanky jsou vkládaný do posuvného šuplíku, odkud si je přebírá pracovník příjmu lékařské mikrobiologie. Povinností pracovníka příjmu je zkontrolovat, zda jsou splněny požadavky na žádanku a odebraný materiál (viz kapitola 4.1).

5.6 Značení vzorků Po přijetí a fyzickém přezkoumání vzorků jsou žádanky ihned zaevidovány do LIS, průvodka a materiál získává unikátní číselné označení. Pod tímto číslem prochází vzorek laboratoří.



6 HLÁŠENÍ VÝSLEDKŮ A PŘEDÁVÁNÍ NÁLEZŮ Výsledky laboratorních vyšetření jsou postupně uvolňovány na klinická pracoviště po autorizaci garantem odbornosti pro mikrobiologii nebo oprávněným vysokoškolským pracovníkem CL pro vydávání výsledků a to v elektronické a/nebo papírové podobě. Podle naléhavosti požadavku (statim, rutina) a charakteru vyšetření je výsledek klinickému pracovišti k dispozici v odpovídajícím časovém intervalu. Laboratoř okamžitě informuje lékaře (nebo jiného klinického pracovníka zodpovědného za péči o pacienta), jsou-li výsledky v kritických intervalech viz tabulka Hlášení kritických (varovných) výsledků. Výsledky lze sdělovat ošetřujícím lékařům a těm zdravotnickým pracovníkům, kteří se podílejí na ošetřování příslušného pacienta. Výsledky se nesdělují pacientům, rodinným příslušníkům, zaměstnavatelům pacienta a dalším nezdravotnickým orgánům a organizacím. Je zakázáno telefonické sdělování výsledků vyšetření rodinným příslušníkům. Volající je informován, že informace poskytuje ošetřující lékař a budou sděleny jemu. Pacientovi nebo jeho rodinnému příslušníkovi se vydá kopie jeho nálezu v uzavřené obálce po předložení průkazu totožnost. Současně jsou výsledky vyšetření odeslány standardním způsobem žadateli. Telefonicky laboratoř sděluje výsledky vyšetření na základě žádosti žadatele, aktivně hlásí kritické (varovné) výsledky a epidemiologicky významné nálezy. Výsledky sdělují pouze pracovníci mikrobiologie k tomu oprávnění a tito pracovníci osobně odpovídají za správnost nahlášených údajů. O všech provedených hlášeních je pořízen záznam. Orgánům činným v trestním řízení (policie, soudy) se výsledky nebo nálezy poskytují pouze na základě písemné žádosti, kterou statutární zástupce předá jako nařízení vedoucímu klinické laboratoře, v tomto případě se výsledky nebo nálezy poskytují v písemné formě prostřednictvím statutárního zástupce.

Hlášení kritických (varovných) výsledků Výsledky v kritických hodnotách jsou hlášeny aktivně. Hlášení musí obsahovat přesnou identifikaci pacienta (jména, rodné číslo). Osoba, která hlášení přijala, musí tento údaj potvrdit.

Bakteriologie

Mikroskopické* vyšetření

likvor pozitivní hemokultury krevní nátěr nátěr z uretry a pochvy (při podezřením na gonorrhoeau) nátěr z nitroděložního tělíska

Pozitivní kultivace

kmen Staphylococcus aureus MRSA kmen Enterococcus faecium a faecalis VRE kmen s fenotypem ESBL, AmpC, KPC kmen rodu Campylobacter, Salmonella, Yersinia, Shigella,

Vibrio cholerae, Vibrio parahaemolyticus; Escherichia coli - enteropatogenní, enterohemoragické, enterotoxinogenní izoláty z rektálních výtěrů

kmen rodu Listeria, Corynebacterium difteriae, Bordetella pertussis, Neisseria meningitidis, Neisseria gonorrhoeae – první záchyt

Streptococcus agalactiae u novorozenců

Pozitivní průkaz antigenu bakterie latexovou aglutinací z likvoru



Infekční sérologie

Pozitivní průkaz antigenu rotavirus, adenovirus, norovirus, toxin Clostridium difficile A/B,

pneumokok, Legionella pneumophila typ 1

Protilátky

EBV ELISA v parametrech IgM, IgA s hodnotou nad 1,1 IP –u vyšetření požadovaných terénními lékaři

VKE ELISA v parametrech IgM, IgA s hodnotou nad 1,1 IP –u vyšetření požadovaných terénními lékaři

pozitivní test TPHA, RRR - pouze první pozitivní nález pozitivní test na lékovou přecitlivělost

Mykobakteriologie

Pozitivní průkaz pozitivní mikroskopický nález – pouze první pozitivní nález pozitivní kultivační nález – pouze první pozitivní nález

Parazitologie

Pozitivní průkaz

Malárie Trypanosomy Leishmania Tropické parazitozy Amébová dysenterie Pozitivní nález zákožky svrabové Myázy Toxoplazmoza pozitivní KFR, IgG, M, A, E

Molekulární biologie

Pozitivní průkaz antigenu

Neisseria gonorrhoeae – první záchyt Mycobacterium tuberculosis komplex HEV Influenza A/B

* V případě hlášení mikroskopických nálezů je obsahem informace o barvitelnosti dle Grama a morfologii nalezených elementů.

7 ZMĚNY VÝSLEDKŮ V případě zjištění neshody na výsledkovém listu, je vyšetření vedoucím pracoviště nebo pověřených vysokoškolským pracovníkem znovu otevřeno. Výsledky jsou změněny a výsledkový list v podobě revidovaného protokolu znovu vydán v papírové a elektronické podobě. Při zjištění závažných neshod je telefonicky informován žadatel. O neshodě případně reklamaci je pořízen záznam.

8 LIKVIDACE POUŽITÝCH ODBĚROVÝCH MATERIÁLŮ Po zpracování vzorku je biologický materiál uchováván týden v chladničce k tomu vyčleněné. U serologických vyšetření je sérum zpracováno ihned nebo rozděleno na alikvoty, které jsou očíslovány a označeny druhem vyšetření a uloženy do mrazničky s teplotou -20 °C do doby zpracování. Primární vzorek je uchováván při chladničkové teplotě 1 týden, zpracovaný alikvot také. Poté je materiál bezpečně zabalen a odvezen dopravní službou SNO k likvidaci do spalovny (viz Provozní řád Úseku lékařské mikrobiologie).



9 SEZNAM VYŠETŘENÍ PROVÁDĚNÝCH NA ÚSEKU LÉKAŘSKÉ MIKROBIOLOGIE

9.1 Kultivační vyšetření U kultivačních vyšetřovacích metod nelze provést vyšetření v režimu statim. Statimové vyšetření lze provést jen u mikroskopického vyšetření viz kapitola 3.4 Statimová (urgentní) vyšetření. Předpokladem pro správnost výsledku je dodržení preanalytické fáze (správný odběr, podmínky transportu…). Po telefonické konzultaci žadatele vyšetření s laboratoří mikrobiologie je možné standardní kultivační vyšetření doplnit o další kultivační média zaměřená na detekci požadovaných agens. Po zpracování vzorku již není možné doobjednat další metody.

Vysvětlivky k použitým zkratkám:

A aerobní kultivace

ACT cílená kultivace na Actinomyces sp.

AN anaerobní kultivace

CAMP cílená kultivace na Campylobacter sp.

CIN cílená kultivace na Yersinia sp. (CIN) cíleně se kultivace zakládá u pacientů infekčního oddělení, dětské oddělení

CLO cílená kultivace na Clostridium sp. (CLO) cíleně se kultivace zakládá u materiálů, které mohli být kontaminované střevním obsahem

CPE cílená kultivace na producenta karbapenemázy

ESBL cílená kultivace na kmeny s produkcí ESBL

GBS cílená kultivace na Streptococcus agalactiae

HS cílená kultivace na Haemophilus sp. (HS) cíleně se kultivace zakládá u materiálu z oblasti ORL

MRSA cílená kultivace na Staphylococcus aureus MRSA

(MRSA)

cílená kultivace se zakládá u pacientů z ARO a JIP

MYK základní mykologická kultivace (MYK) cíleně se kultivace zakládá při mikroskopickém nálezu kvasinek

NG cílená kultivace na Neisseria gonorrhoeae

(NG) cíleně se kultivace zakládá u materiálu z urogenitální oblasti

NM cílená kultivace na Neisseria meningitidis

SORB cílená kultivace na enteropatogenní Escherichia coli

(SORB)

cíleně se kultivace zakládá u dětí do 2 let

STAU cílená kultivace na Staphylococcus aureus

(STAU) cílená kultivace na Staphylococcus aureus se zakládá na žádost žadatele

VI cílená kultivace na Vibrio sp. (VI) cílená kultivace na Vibrio sp. se zakládá na žádost žadatele



9.1.1 Bakteriologická vyšetření

Otorhinolaryngeální oblast

Stěr/výtěr krk (tonsily), nosohltan, hltan Odběrový systém: tampon s transportním médiem Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru

Uchování vzorku: pokojová teplota, do 24 hodin

Vyšetření: kultivace

Kultivace zaměřená na: - standard: A, HS, (MRSA)

- cílená kultivace na Corynebacterium diphhteriae

- cílená kultivace na Neisseria meningitidis

Frekvence provedení: denně (pondělí až neděle)

Předběžný/konečný výsledek: 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů

Interference: přítomnost ATB ve vzorku

Hodnocení: kvalitativně, kvantitativně (hodnoceno na kříže)

Stěr/výtěr nos Odběrový systém: tampon s transportním médiem Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru

Uchování vzorku pokojová teplota, do 24 hodin


Kultivace zaměřená na: standard: A, (MRSA)





Stěr/výtěr nosohltan a hrtan Odběrový systém: tampón na drátě s transportním médiem Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru

Uchování vzorku pokojová teplota, do 24 hodin


Kultivace zaměřená na: Cílená kultivace na Bordetella sp.





Stěr/výtěr dutina ústní Odběrový systém: tampon s transportním médiem Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru

Uchování vzorku: Pokojová teplota, do 24 hodin




Kultivace zaměřena na: standard: A, AN, MYK, (MRSA)


Předběžný/ konečný výsledek: 24 hodin/ dle nálezu 2 až 7 dnů



Stěr/výtěr ucho Odběrový systém: tampon s transportním médiem Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru



Kultivace zaměřena na: standard: A, AN, HS, MYK, (MRSA)





Respirační trakt

Sputum, 2 ml Odběrový systém: sterilní kontejner 30 ml Podmínky transportu: 2-8 °C, dodat do 2 hodin od odběru

Uchování vzorku 2-8ºC, do 24 hodin

Vyšetření: mikroskopie, kultivace

Kultivace zaměřena na: standard: A, MYK, NM, (MRSA)


Předběžný/ konečný výsledek: 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů


Hodnocení: kvalitativně, kvantitativně (ředěný materiál 10-3

, 10-5

,

10-7

; neředěný materiál hodnocen na kříže)

Aspirát tracheální, tekutý materiál z TSK, 2 ml Odběrový systém: sterilní zkumavka Podmínky transportu: 2-8 °C, dodat do 2 hodin od odběru

Uchování vzorku: 2-8°C, do 24 hodin


Kultivace zaměřena na: standard: A, AN, MYK, NM, (MRSA)







Aspirát z bronchoskopie, 2 ml Odběrový systém: sterilní zkumavka Podmínky transportu: 2-8 °C, dodat do 2 hodin od odběru

Uchování vzorku: 2-8ºC, do 24 hodin


Kultivace zaměřena na: standard: A, AN, MYK, NM, (MRSA)





Stěr z okolí tracheostomie

Odběrový systém: tampon s transportním médiem Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru








Gastrointestinální trakt

Bioptický materiál z žaludeční sliznice

Odběrový systém: speciální odběrové medium Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru


Vyšetření: mikroskopie, biochemie

Frekvence provedení: denně (pondělí až pátek)

Předběžný/konečný výsledek: 24 hodin/2 dny

Interference: -

Hodnocení: mikroskopie: kvalitativně

ureázový test: pozitivní, negativní

Žaludeční šťáva, 2 ml Odběrový systém: sterilní zkumavka Podmínky transportu: Pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru










Anální výtěr




Kultivace zaměřena na: - standard: A, CAMP, (CIN), (SORB), (VI), (STAU)

- standard pro ARO, JIP: A, AN, CAMP, CIN, CLO,

(SORB)



Interference: -

Hodnocení: kvalitativně

Urogenitální trakt

Moč - střední proud, cévka, permanentní katétr, ureterální katétr, nefrotický

drén, 5 ml Odběrový systém: sterilní zkumavka Podmínky transportu: 2-8 °C, dodat do 2 hodin od odběru

Uchování vzorku: 2-8 ºC, do 24 hodin


Kultivace zaměřena na: A, (MYK), (MRSA)




Hodnocení: kvalitativně, kvantitativně (≥ 10e4 v ml)

Uricult Odběrový systém: speciální odběrová souprava Podmínky transportu: Pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru

Uchování vzorku 7-25 °C max. 48 hodin, poté inkubace 36± 1 °C 16 až

24 hodin


Kultivace zaměřena na: A, (MYK)




Hodnocení: kvalitativně, kvantitativně (≥ 10e4 v ml)



Stěr/výtěr pochva Odběrový systém: - tampon s transportním médiem

- nebo 2 tampony – 1 s médiem (kultivace) a 2. bez

média (mikroskopie) Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru


Vyšetření: kultivace, (mikroskopie)

Kultivace zaměřena na: standard: A, AN, GBS, NG, MYK, (LIST)


Předběžný/konečný výsledek: kultivace 24 hodin/dle nálezu 2 až 7 dnů,

(mikroskopie 24 hodin)



Stěr/výtěr pochva na kultivačním médiu

Odběrový systém: speciální odběrová souprava Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat co nejdříve v den odběru

Uchování vzorku: Nedoporučuje se


Kultivace zaměřena na: Neisseria gonorrhoeae



Interference: -


Pochva nátěr na sklíčku

Odběrový systém: mikroskopické podložní sklíčko Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin


Vyšetření: mikroskopie


Předběžný/konečný výsledek: 1 hodina/1 hodina

Interference: -


Stěr/výtěr vulva




Kultivace zaměřena na: standard: A, AN, MYK, NG, (GBS, LIST)







Stěr/výtěr uretra Odběrový systém: tampon s transportním médiem Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru



Kultivace zaměřena na: standard: A, AN, MYK, NG



Interference: -


Stěr/výtěr uretra na kultivačním médiu

Odběrový systém: speciální odběrová souprava Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin



Kultivace zaměřena na: Neisseria gonorrhoeae



Interference: -


Uretra nátěr na sklíčku Odběrový systém: mikroskopické podložní sklíčko Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin





Interference: -


IUD, nitroděložní tělísko

Odběrový systém: sterilní zkumavka Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru



Kultivace zaměřena na: standard: A, AN, ACT, MYK, NG


Předběžný/konečný výsledek: mikroskopie 1 hodina, kultivace 24 hodin/dle nálezu

až 11 dnů





Krev, likvor

Hemokultivační lahvička aerobní (3-10 ml), anaerobní (3-10 ml),

dětská (1-3 ml) Odběrový systém: hemokultura

aerobní – PLUS AEROBIC/F

anaerobní – LYTIC ANAEROBIC/F

dětská – PEDS PLUS/F Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru


Vyšetření: hemokultivace

Kultivace zaměřena na: A, AN, NM, (MRSA), další kultivační média jsou

doplněny dle mikroskopie

Frekvence provedení: denně (pondělí až neděle) – hemokultivační lahvička

je vložena do přístroje po dobu 5 dnů

Předběžný/konečný výsledek: mikroskopie z pozitivní hemokultivace je hlášena

ihned/dle nálezu 2 až 7 dnů

negativní hemokultivace 5 dnů



Hemokultivační lahvička - mykotická (3-10 ml) Odběrový systém: hemokultura MYCOSIS IC/F Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru


Vyšetření: hemokultivace

Kultivace zaměřena na: kvasinky a plísně

Frekvence provedení: denně (pondělí až neděle) – hemokultivační lahvička

je vložena do přístroje po dobu 14 dnů

Předběžný/konečný výsledek: mikroskopie z pozitivní hemokultivace je hlášena

ihned/dle nálezu 2 až 7 dnů

negativní hemokultivace 15 dnů

Interference: přítomnost ATM ve vzorku


Stěr z kůže před hemokulturou




Kultivace zaměřena na: standard: A, AN, MYK



Interference: -




Krevní nátěr na skle Odběrový systém: mikroskopické podložní sklíčko Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru





Interference: -


Likvor, 2 ml Odběrový systém: sterilní zkumavka Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat co nejdříve od odběru


Vyšetření: mikroskopie, kultivace, hemokultivace (viz str. 23)

Kultivace zaměřena na: standard: A, AN, HS, NM, (MRSA), další kultivační

média jsou doplněny dle mikroskopie


Předběžný/konečný výsledek: mikroskopie do 1 hodiny, kultivace 24 hodin/

dle nálezu 2 až 7 dnů

Doobjednání dalšího požadavku: do 48 hodin od přijetí do laboratoře

(dle požadované metody a objemu vzorku)

Interference: příměs krve ve vzorku


Další materiály

Stěr/výtěr oko




Kultivace zaměřena na: standard: A, AN, HS, MYK, NG, (MRSA)





Stěr/výtěr rána, defekt, dekubit Odběrový systém: tampon s transportním médiem Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru





Kultivace zaměřena na: standard: A, AN, MYK (MRSA); další kultivační

média jsou doplněny dle lokality odběru





Kanyla, katétr, drén Odběrový systém: sterilní zkumavka Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru

Uchování vzorku: Pokojová teplota, 24 hodin





Interference: -


Implantační materiál Odběrový systém: - tampon s transportním médiem

- sterilní nádoba Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru




lze založit prodlouženou kultivaci (10 dnů) Frekvence provedení: denně (pondělí až neděle)




Stěr/výtěr z jiné lokality Odběrový systém: tampon s transportním médiem Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru



Kultivace zaměřena na: standard: A, AN, MYK, (MRSA); další kultivační

média jsou doplněny dle lokality







Punktát, 3 ml Odběrový systém: sterilní zkumavka Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru

Uchování vzorku: Pokojová teplota do 24 hodin








Hnis, 3 ml Odběrový systém: sterilní zkumavka Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru









Jiný materiál Odběrový systém: - tampon s transportním médiem

- sterilní zkumavka Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru









Screeningová vyšetření

MRSA screening: Stěr/výtěr krk, nos, perineum; jiný klinický materiál Odběrový systém: - tampon s transportním médiem




Kultivace zaměřena na: MRSA





Interference: nevhodně provedený odběr


ESBL screening: klinický materiál Odběrový systém: - tampon s transportním médiem




Kultivace zaměřena na: - producenti ESBL s vyšetřením ATB citlivosti

- producenti ESBL bez vyšetření ATB citlivosti



Interference: -


GBS screenig: Stěr/výtěr pochva; stěr/výtěr axila a ucho novorozenců Odběrový systém: tampon s transportním médiem Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru



Kultivace zaměřena na: GBS (Streptococcus agalactiae)



Interference: -


CPE screening: klinický materiál Odběrový systém: - tampon s transportním médiem




Kultivace zaměřena na: producenti CPE



Interference: -




Kontrola sterility primárně sterilního materiálu a mikrobiologie prostředí

TP, LPř, roztoky

Odběrový systém: - originální balení

Podmínky transportu: 2-8ºC do 15 minut

Uchování vzorku 2-8ºC, do 24 hodin

Kultivace na: A, AN, MYK

Frekvence provedení: jednou týdně

Předběžný/konečný výsledek: 12 dnů/14 dnů

Interference: -


Otisky, stěry z různých lokalit Odběrový systém: - tampon s transportním médiem bez aktivního

uhlí

- otisky: kultivační médium s otiskem Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 2 hodin od odběru

Uchování vzorku Nedoporučuje se

Kultivace na: A, MYK

Frekvence provedení: jednou týdně

Předběžný/konečný výsledek: 12 dnů/14 dnů

Interference: -

Hodnocení: Kvalitativně, kvantitativně

9.1.2 Mykologická vyšetření

Sputum, 5 ml Odběrový systém: sterilní kontejner 30 ml

Podmínky transportu: 2 – 8 °C, dodat do 24 hodin od odběru

Uchování materiálu: 2 – 8 °C, do 24 hodin od odběru




Předběžný/konečný výsledek: mikroskopie 24 hodin/kultivace dle nálezu 5 – 7 dní





Moč, 5 ml Odběrový systém: sterilní zkumavka









Hnis, 5 ml Odběrový systém: sterilní zkumavka









Stěr, výtěr z různých lokalit Odběrový systém: tampon s transportním médiem Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat do 24 hodin od odběru

Uchování materiálu: pokojová teplota, do 24 hodin od odběru







Kožní adnexy (šupiny, kůže, vlasy, vousy, nehty) Odběrový systém: sterilní zkumavka, sterilní Petriho miska Podmínky transportu: Pokojová teplota, dodat do 72 hodin od odběru

Uchování materiálu: pokojová teplota, do 72 hodin od odběru


Kultivace zaměřena na: Staphylococcus aureus, kvasinky, plísně, dermatofyta


Předběžný/konečný výsledek: 48 hodin/dle kultivačního nálezu 28 dní a více

Interference: málo materiálu, přítomnost ATM ve vzorku




9.1.3 Mykobakteriologická vyšetření

Sputum, 2 až 5 ml Odběrový systém: sterilní kontejner 30 ml Podmínky transportu: 2 – 8 °C, dodat do 72 hodin od odběru



Kultivace zaměřena na: Mycobacterium sp.


Předběžný/konečný výsledek: mikroskopie 24 – 48 hodin, kultivace 14 dnů/

dle kultivačního nálezu 63 dnů a více

Interference: velké množství kontaminující mikrobioty


Aspirát, 3 ml Odběrový systém: sterilní zkumavka Podmínky transportu: 2 – 8 °C, dodat do 72 hodin od odběru









Likvor, 3 ml Odběrový systém: sterilní zkumavka Podmínky transportu: 2 – 8 °C, dodat do 24 hodin od odběru









Punktát, 3 ml Odběrový systém: sterilní zkumavka








Předběžný/konečný výsledek: mikroskopie 24 – 48 hodin, kultivace 14 dnů/dle

kultivačního nálezu 63 dnů a více

Doobjednání dalšího požadavku: nelze



Moč Odběrový systém: sterilní odběrové nádobky, umělohmotné (120 ml)






Předběžný/konečný výsledek: 14 dnů/dle kultivačního nálezu 63 dnů a více



Tkáň Odběrový systém: sterilní zkumavka






Předběžný/konečný výsledek: mikroskopie 24 – 48 hodin, 14 dnů/dle kultivačního

nálezu 63 dnů a více



Laryngeální výtěry, 3 ks

Odběrový systém: laryngeální sondy






Předběžný/konečný výsledek: 14 dnů/dle kultivačního nálezu 63 dnů a více



Pro odběry na mykobakteriologická vyšetření nejsou vhodné soupravy s transportním

médiem nebo umělohmotnou tyčinkou!



9.2 Sérologická vyšetření

Při požadavku na provedení více serologických metod, je nutné zohlednit množství dodaných

odběrových souprav (obecně na jednu požadovanou metodu, prosíme dodat jednu zkumavku srážlivé

krve).

9.2.1 Infekční sérologické, parazitologické a imunologické metody

Anti-CMV IgM, IgA, IgG

ELISA

Materiál, objem: sérum, citrátová plazma, min. 1 ml

Odběrový systém: komerční odběrová souprava pro srážlivou krev

Podmínky transportu: pokojová teplota nebo při 2-8°C, dodat do 2 hodin od

odběru

Uchování vzorku: 2-8°C, 48 hodin

Frekvence provedení: 1x týdně při dostatečném počtu vzorků

Maximální doba odezvy: 7 dní

Vyšetření RUTINA

STATIM

pondělí až pátek

nelze vyšetřit statimově


Interference: lipémické, hemolytické, bakteriálně kontaminované

vzorky, antikoagulanty obsažené v plazmě (kromě

citrátu), přítomnost revmatoidního faktoru IgM

Hodnocení: index pozitivity (IP)

Interpretace výsledku: negativní hraniční pozitivní jednotka

< 0,9 0,9 – 1,1 1,1 > IP

Anti-EBV IgM, IgG (EBNA, VCA) ELISA




odběru




Vyšetření RUTINA

STATIM









< 0,9 0,9 – 1,1 1,1 > IP



Anti-Chlamydia sp. IgM, IgA, IgG

ELISA




odběru




Vyšetření RUTINA

STATIM









< 0,9 0,9 – 1,1 1,1 > IP

Anti-Mycoplasma pneumoniae IgM, IgA, IgG

ELISA




odběru




Vyšetření RUTINA

STATIM









< 0,9 0,9 – 1,1 1,1 > IP



Anti-virus klíšťové encefalitidy IgM, IgG

ELISA

Materiál, objem: sérum, citrátová plazma, likvor, min. 1 ml

Odběrový systém: komerční odběrová souprava pro srážlivou krev,

sterilní zkumavka


odběru




Vyšetření RUTINA

STATIM









< 0,9 0,9 – 1,1 1,1 > IP

Anti-Yersinia enterocolitica IgM

ELISA

Materiál, objem: sérum, plazma (s EDTA), min. 1 ml



odběru




Vyšetření RUTINA

STATIM




Interference: lipémické, hemolytické sérum, přítomnost

revmatoidního faktoru IgM

Hodnocení: U/ml


≤ 7 8 – 11 12 ≥ U/ml



Anti-morbilli IgG

ELISA




odběru


Frekvence provedení: 1-2x týdně při dostatečném počtu vzorků


Vyšetření RUTINA

STATIM




Interference: lipémické, hemolytické sérum

Hodnocení: IP


≤ 0,8 0,8 – 1,2 1,2 ≥ IP

Anti-Toxocara canis IgG + avidita

ELISA




Uchování materiálu: 2 – 8 °C



Vyšetření RUTINA

STATIM







Hodnocení: index pozitivity (IP), index avidity (Iav)

Interpretace výsledku ELISA: negativní hraniční pozitivní jednotka

< 0,9 0,9 – 1,1 1,1 > IP

Interpretace výsledku avidity: časná nákaza hraniční prodělaná nákaza jednotka

< 40 40 – 50 51 > Iav

Anti-Toxoplasma gondii IgM, IgA, IgG, IgE KFR, ELISA (v případě pozitivity KFR)









Vyšetření RUTINA

STATIM







Hodnocení: titr, index pozitivity (IP)

Interpretace KFR: negativní pozitivní

do titru 1:16 od titru 1:32


< 0,9 0,9 – 1,1 1,1 > IP

Anti-Borrelia afzelii IgM, IgG

ELISA, Western blot

Materiál, objem: sérum, citrátová plazma, likvor, synoviální tekutina,

min. 1 ml Odběrový systém: komerční odběrová souprava pro srážlivou krev,

sterilní zkumavka




Maximální doba odezvy: 7 dní ELISA, 7 dní Western blot

Vyšetření RUTINA

STATIM









< 0,9 0,9 – 1,1 1,1 > IP

Interpretace výsledku Western blotu: negativní hraniční pozitivní

hodnocení se provádí podle kombinace výskytu linií (VlsE, OspC) a jejich intenzit

Anti-Brucella abortus Aglutinačně



Materiál, objem: sérum, min. 1 ml



odběru


Frekvence provedení: denně

Maximální doba odezvy: 2 dny

Vyšetření RUTINA

STATIM


lze vyšetřit statimově



Hodnocení: pozitivní, negativní, hraniční titr

Interpretace výsledků: negativní negativní hraniční pozitivní

1:20 1:40 1:80 1:160

Anti-Francisella tularensis Aglutinačně




odběru




Vyšetření RUTINA

STATIM







1:20 1:40 1:80 1:160

Anti-Listeria monocytogenes Aglutinačně




odběru






Vyšetření RUTINA

STATIM







1:20 1:40 1:80 1:160

Anti-Listeria ivanovii Aglutinačně




odběru




Vyšetření RUTINA

STATIM







1:20 1:40 1:80 1:160

Anti-Treponema pallidum metodou RRR (rychlá reaginová reakce) Aglutinačně




odběru




Vyšetření RUTINA pondělí až pátek



STATIM lze vyšetřit statimově



Hodnocení: pozitivní, negativní, titr

Semikvantitativní interpretace výsledků: negativní pozitivní

titr titr titr titr titr titr titr

- 1:2 1:4 1:8 1:16 1:32 1:64

Anti-Treponema pallidum metodou TPHA

Hemaglutinačně




odběru




Vyšetření RUTINA

STATIM





Hodnocení: pozitivní, negativní, titr

Semikvantitativní interpretace výsledků: negativní pozitivní

titr titr titr titr titr titr titr titr

- 1:80 1:160 1:320 1:640 1:1280 1:… 1:…

Panel Pneumobact NIF IgM, IgG

(Legionella pneumophilla, Mycoplasma pneumoniae, Coxiella burnetii,

Chlamydia pneumoniae, Chlamydia psittaci) Nepřímá imunofluorescence




odběru




Vyšetření RUTINA

STATIM


po dohodě lze vyšetřit statimově



Hodnocení: pozitivní, negativní



Průkaz antigenů původců bakteriální meningitidy

(Neisseria meningitidis A, B, C, Y, W 135; Streptococcus sk. B; Escherichia coli

K1; Haemophilus influenzae B; Streptococcus pneumonie) Latexová aglutinace

Materiál, objem: likvor, min. 2 ml

Odběrový systém: sterilní zkumavka

Podmínky transportu: pokojová teplota, ihned

Uchování vzorku: nedoporučuje se


Maximální doba odezvy: 1 den

Vyšetření RUTINA

STATIM

pondělí až neděle


Doobjednání dalšího požadavku: nelze doobjednat další metodu, riziko kontaminace

likvoru

Interference: -


Průkaz antigenu Streptococcus pneumonie

Imunochromatograficky

Materiál, objem: likvor min. 2 ml, moč 5 až 10 ml


Podmínky transportu: 2-8°C, dodat do 2 hodin od odběru

Uchování vzorku: 2-8°C, max. 24 hodin



Vyšetření RUTINA

STATIM




Interference: metoda nevhodná pro pacienty užívající antibiotika

po více jak 24 hod.; pro pacienty, kteří právě

skončili antibiotickou léčbu; nově očkované pacienty

kmenem Streptococcus pneumonie


Průkaz antigenu Legionella pneumophila Imunochromatograficky

Materiál, objem: moč, 5 až 10 ml


Podmínky transportu: 2-8°C, dodat do 2 hodin od odběru




Vyšetření RUTINA

STATIM





Doobjednání dalšího požadavku: do 48 hodin od přijetí do laboratoře, možná

kontaminace moče

Interference: -


Průkaz antigenu rotaviru, adenoviru a noroviru Imunochromatograficky

Materiál, objem: stolice, 50 mg pevné stolice nebo 50 µl vzorku tekuté

Odběrový systém: kontejner s lopatičkou


odběru




Vyšetření RUTINA

STATIM




Interference: -


Průkaz antigenu Helicobacter pylori Imunochromatograficky

Materiál, objem: stolice, 0,1 ml tekuté stolice nebo vzorek tuhé stolice

o velikosti hrášku (cca 0,1 g)


Podmínky transportu: pokojová teplota nebo při 2-8°C, ihned




Vyšetření RUTINA

STATIM




Interference: -


Průkaz antigenu Clostridium difficile antigen a Toxin A/B Imunochromatograficky

Materiál, objem: stolice, 1-2 g pevné nebo 1-2 ml řídké stolice


Podmínky transportu: pokojová teplota nebo při 2-8°C, ihned




Vyšetření RUTINA

STATIM






Interference: -


Semikvantitativní stanovení Calprotectinu ze stolice Imunochromatograficky

Materiál, objem: stolice, 1-2 g pevné nebo 1-2 ml řídké stolice



odběru




Vyšetření RUTINA

STATIM




Interference: -

Hodnocení: negativní, hraniční, pozitivní

Semikvantitativní interpretace výsledků: negativní hraniční pozitivní

0 - 30 ug/g 31 – 70 ug/g 71 a více ug/g

Průkaz antigenu Plasmodium sp. (malárie) Imunochromatograficky

(Průkaz malárie (Plasmodium sp.) viz str. 47)

Materiál, objem: plná krev, min. 1 ml

Odběrový systém: komerční odběrová souprava pro nesrážlivou krev

Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat ihned po odběru

Uchování materiálu: pokojová teplota


Maximální doba odezvy 24 hodin

Vyšetření RUTINA

STATIM


po dohodě lze vyšetřit statimově


Interference: -


Léková přecitlivělost Precipitace v gelu

Materiál, objem: sérum, min. 1 ml (dle počtu léků) + vzorky léků,

přípravky na olejové bázi (masti a pod.) touto

metodou nelze zpracovat.




Podmínky transportu: 2-8 °C, dodat do 2 hodin od odběru




Vyšetření RUTINA

STATIM





Hodnocení: pozitivní – objevení se precipitační linie

9.2.2 Molekulárně biologické vyšetření

DNA Cytomegalovirus Real-time PCR kvalita/kvantita

Materiál, objem: sérum, plazma (s EDTA), likvor, min. 1 ml


komerční odběrová souprava pro nesrážlivou krev

sterilní zkumavka


Uchování vzorku: 2 – 8 °C

Frekvence provedení: 1x týdně

Maximální doba odezvy: 1 týden

Vyšetření RUTINA

STATIM


možno po domluvě


Interference: lipémické, hemolytické sérum; bilirubin,

antikoagulant heparin, volný hemoglobin ve vzorku,

talek z rukavic

Hodnocení: negativní, pozitivní

kvantifikace: vyjádřeno v cp/ml

DNA Epstein Barrové virus

Real-time PCR kvalita/kvantita

Materiál, objem: sérum, plazma (s EDTA), likvor, min. 1 ml



sterilní zkumavka





Vyšetření RUTINA

STATIM


možno po domluvě






talek z rukavic


kvantifikace: vyjádřeno v cp/ml

DNA Hepatitis B virus Real-time PCR kvalita/kvantita








Vyšetření RUTINA

STATIM






talek z rukavic


kvantifikace: vyjádřeno v IU/ml

RNA Hepatitis C virus

Real-time PCR kvalita/kvantita








Vyšetření RUTINA

STATIM






talek z rukavic


kvantifikace: vyjádřeno v IU/ml

RNA Hepatitis E virus Real-time PCR kvalita







Uchování vzorku: 2 - 8 °C



Vyšetření RUTINA

STATIM


lze, doba odezvy 2 dny




talek z rukavic


DNA Herpes simplex virus 1, 2 Real-time PCR kvalita

Materiál, objem: sérum, plazma (s EDTA), likvor, min. 1 ml; stěry



sterilní zkumavka

speciální odběrová souprava ESwab





Vyšetření RUTINA

STATIM


možno po domluvě




talek z rukavic


DNA Chlamydia trachomatis

Real-time PCR kvalita

Materiál, objem: výtěr z uretry, pochvy, stěr ze spojivky, moč, kloubní

punktát, tekutý materiál z Douglasova prostoru;

min. 2 ml Odběrový systém: speciální odběrová souprava ESwab

sterilní zkumavka





Vyšetření RUTINA

STATIM




Interference: volný hemoglobin ve vzorku, talek z rukavic




DNA Mycobacterium tuberculosis complex Real-time PCR kvalita

(současně bude založena kultivace na mykobakteria viz str. 29-31)

Materiál, objem: respirační materiál, stěry, tkáně, min. 2 ml

Odběrový systém: speciální odběrová souprava ESwab

sterilní zkumavka





Vyšetření RUTINA

STATIM






DNA Neisseria gonorrhoeae Real-time PCR kvalita

Materiál, objem: výtěr z uretry, pochvy, moč, tekutý materiál

z Douglasova prostoru; min. 2 ml

Odběrový systém: speciální odběrová souprava ESwab

sterilní zkumavka





Vyšetření RUTINA

STATIM






DNA Varicella zoster virus Real-time PCR kvalita

Materiál, objem: sérum, plazma (s EDTA), likvor, min. 1 ml; stěry



sterilní zkumavka

speciální odběrová souprava ESwab





Vyšetření RUTINA

STATIM


možno po domluvě






talek z rukavic


DNA původců bakteriálních meningitid (Streptococcus pneumoniae,

Haemophilus influenzae, Neisseria meningitidis) Real-time PCR kvalita

Materiál, objem: likvor, min. 1 ml






Vyšetření RUTINA

STATIM


lze, doba odezvy 2 dny




RNA Influenza A/B

Real-time PCR kvalita

Materiál, objem: výtěr krk, nos, nosohltan, sputum, bronchiální/nosní

výplach, tkáně

Odběrový systém: eSchwab

Podmínky transportu: 2 – 8 °C, dodat do 12 hodin od odběru, tkáně

okamžitě dodat do laboratoře

Uchovávání vzorků 2 – 8 °C, dodat do 12 hodin od odběru, při delší době

uchovávání vzorek zamrazit na – 20 až – 80 °C.

Tkáně pokud nelze okamžitě dodat zamrazit ihned.



Vyšetření RUTINA

STATIM


lze, doba odezvy do druhého dne.

V pátek statimově do jedenácti hodin, vzorky dodané

později zpracovány v pondělí.



Hodnocení: pozitivní – typ A/B, negativní



9.3 Parazitologická vyšetření

Stolice na parazitózy

Materiál, objem: stolice, 5 g nebo 1 ml tekuté stolice


Podmínky transportu: 2 – 8 °C, dodat v den odběru




Předběžný/konečný výsledek 24 hodin/dle nálezu 48 hodin


Interference: -


Perianální otisk

Materiál, objem: perianální otisk

Odběrový systém: lepící páska LEPEX a mikroskopické podložní sklo

Podmínky transportu: bez omezení

Uchování materiálu: bez omezení





Interference: -


Průkaz Trichomonas vaginalis

Materiál, objem: poševní sekret

Odběrový systém: - mikroskopické podložní sklo

- speciální odběrová souprava

Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat v den odběru






Interference: -


Průkaz Schistosoma haematobium



Materiál, objem: moč, poslední porce ranní moče, 30 ml

Odběrový systém: kontejner 30 ml

Podmínky transportu: 2 – 8 °C, dodat v den odběru






Interference: -

Průkaz malárie (Plasmodium sp.)

Materiál, objem: srážlivá krev; krevní roztěr a tlustá kapka

Odběrový systém: podložní mikroskopické sklo

Podmínky transportu: pokojová teplota, dodat ihned po zaschnutí


Vyšetření: Mikroskopie




Interference: -


U PODEZŘENÍ NA MÉNĚ ČASTÉ ETIOLOGICKÉ AGENS NEBO

U NEJASNOSTÍ PŘI ODBĚRU DOPORUČUJEME TELEFONICKOU KONZULTACI S LABORATOŘÍ!

V Opavě dne 31.1.2019 Zpracovala: Monika Richtrová

Mgr. Jana Kunzová RNDr. Michaela Klementová RNDr. Miroslava Dvořáková

Schválila: RNDr. Miroslava Dvořáková

Date post:	18-May-2020
Category:	Documents
Upload:	others
View:	9 times
Download:	0 times

Vážení zdravotničtí pracovníci, vážení spoluobčané, · pro nemocnici a schvaluje výdej...

Documents