+ All Categories
Home > Documents > čeniny/barvi ky -...

čeniny/barvi ky -...

Date post: 23-Jul-2019
Category:
Upload: lamhanh
View: 213 times
Download: 0 times
Share this document with a friend
98
Transcript
Page 1: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 2: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 3: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

FM styrylové sloučeniny/barvičky(fy. Mol.Probes) fluoreskují po

zapojení do membrány.Internalizují se endocyózou.

Optimální je pro rostlinné buňky FM4-64

Page 4: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 5: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Cytokinese a endocytóza

GFP či YFP-AtEB1 a CLIP170 značí + konce MTs.GFP či YFP- MAP4 značí celéMTs.

Page 6: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

http://www.pubmedcentral.gov/articlerender.fcgi?tool=pubmed&pub

medid=15831100

Videa, která stojí za vidění jako Suppl. Data na konci článku.

Page 7: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

KAT1 draselný vtokový kanál a změny objemu

svěracích buněk průduchů.

Měření membránové kapacitance

Page 8: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Genom Arabidopsis obsahuje celý komplement genů kódujících a regulujících klatrinové obaly

Page 9: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 10: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Various receptors and clathrin protein coats recognize vesicle types, and these are delivered (along cytoskeleton pathways?) to appropriate target sites in the cell.

Other recognition molecules, such as (vesicle) v - snares and (target) t-snares are involved in targeting vesicles with one set of contents to one site, and another set of vesicles to another site.

Fig. 13-6 Clathrin coated vesicles. Deep freeze etching EM of inner surface of plasma membrane of cultured fibroblast cells.

Page 11: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 12: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 13: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 14: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 15: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 16: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

• Aktivovaný receptor (př. receptorovákináza) může stabilizovat vznikající

• „obalené jámy“.

Page 17: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

v

Page 18: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Internalizace obsazeného receptoru nemusí být jen krok, vedoucí k

jeho destrukci (a oslabení signalizace), ale v některých

případech signalizace pokračuje v endosomu –signalizační

endosom. (př. signal. brassinosteroidy – BRI1).

Page 19: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Při endocytóze PM velmi pravděpodobně může také docházet k internalizaci (modifikaci a posléze recyklaci) části pektinů a

xyloglukanů buněčné stěny.

Internalizace AGP, které silně interagují s pektiny.

Page 20: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Po přidání BFA (B) jsou téměř všechny xyloglukany internalizoványdo BFA kompartmentu.

Page 21: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 22: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

U rostlinřada

otazníků!

Page 23: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Endosomy

Page 24: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 25: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Odlišný osud obsazených/aktivovaných transferrinovýcha opioidníchreceptorů – z časného endosomu jdou transferrinové rec. přes recyklující endosomzpět do PM, zatímco opioidní rec. putují do lysosomu/vakuoly přes „late“ endosom.

Příklad z živočišné buňky.

Page 26: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Nějak podobně je pravděpodobně regulována lokalizace PIN auxinových přenašečových komplexů. Auxin také blokujeblokujeblokujeblokuje endocytózua tak automaticky zvyšuje výskyt výtokových přenašečů na PMTo je pravděpodobně klíčovou součástí procesu kdy auxin reguluje svůjvlastní transport.

Page 27: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 28: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Homolog RabF/Rab5 Ara6 je lokalizován v časném endosomu.

Page 29: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

GTPázy-lipidy : zákl. regul. smyčka endomembránového systému

• Lokální specifické domény membránových fosfolipidů jsou klíčovou součástí udržování identity nejen organel, ale také sub- doménna organelách.

• Proto zvl. Arf, ale i Rho a Rab GTPázyregulují některé aktivity - kinázy, fosfolipázy, flipázy! které vytvářejí lokalizované membránové domény.

Page 30: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

• PI(4)P (blue) -concentrated on Golgi

• PI(3)P (green) - early endosomes

• PI(4,5)P2 -plasma membrane

• PI(3,5)P2 - multi-vesicular endosomes

Distribution ofphosphatidylinositidesin cells:

Roth 2004

Page 31: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Structures of PI(3)P-binding Modules

Lemmon 2003

Page 32: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 33: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Two RabA of pea have different subcellular localization (detail)

toto pozorování ukazuje na různorodost endosomů v jedné buňce.

Page 34: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 35: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

GTPázy-lipidy : zákl. regul. smyčka endomembránového systému

• Lokální specifické domény membránových fosfolipidů jsou klíčovou součástí udržování identity nejen organel, ale také sub- doménna organelách.

• Proto zvl. Arf, ale i Rho a Rab GTPázyregulují některé aktivity - kinázy, fosfolipázy, flipázy! které vytvářejí lokalizované membránové domény.

Page 36: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 37: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

• Endosomy se mohou pohybovat také mechanismem aktinové komety. Pohyb je závislý na polymeraci aktinua nezávislý na myosinu.

Page 38: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Důležitým nástrojemstudia sekreční dráhy je brefeldin A

BFA

Page 39: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Obsah BFA kompartmentuodhaluje bílkoviny PM, které

cyklují mezi PM a recyklujícímendosomem.

Page 40: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 41: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 42: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

GDP

GTP

ARF-GEF

Vesicle budding in Golgi is ARF1-dependent;ARF1 undergoes recruitment to Golgi membraneby ARF-GEF-promoted GTP for GDP exchange;ARF1 recruits protein coats (green) needed forvesicle budding; brefeldin A binds at ARF1-GDP/ARF1-GEF interface and inhibits GTP exchange/membrane recruitment of ARF1 and coats; Golgistack is disrupted and protein trafficking through the Golgi is inhibited, ALE I DALŠÍ KOMP.Arf-GEFy p ůsobí na několika „stanicích“ endom. Syst.

Research tool for membrane trafficking: BFA

Page 43: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 44: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

• NE KAŽDÝ ARF GEF JE CITLIVÝ K BFA!!

Page 45: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

BFAonGA

Page 46: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

V rostlinných buňkách se po působení BFA objevují min.dva nové kompartmenty(v různých buňkách různě):1. Hybridní cisGA-ER(podobně jako u živočichů).2. Tzv. „BFA„BFA„BFA„BFA----

compartmentcompartmentcompartmentcompartment““““ – transGA-endosom.

Page 47: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 48: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Problém interpretace vlivu BFA

1. V buňce je (podle stavu diferenciace) několik GEFů (8x u At) pro několik ARFů(12x u At), různě silně

exprimovaných a různě lokalizovaných.2. Některé ARF-GEFy (u At 3x) nejsou!!!inhibovány BFA.

Page 49: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 50: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

C, F, I – linieodolná k BFA

Page 51: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Polární transport IAA je závislý na polární lokalizaciPIN auxinových výtokových přenašečů.Jejich lokalizace je závislá na polarizované sekreci a aktinovém cytoskeletu.

Page 52: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Recyklace PIN1je závislá na aktinu

Page 53: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 54: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

• Recyklace IAA přenašeče PIN2 je závislá na jiném typu endosomu– obsahujícím „sorting nexin 1“, který je citlivý k wortmanninu(inhibitor PI-3-Kin, PI3kin)

Page 55: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

•CytokineseCytokineseCytokineseCytokinese a a a a

endocytózaendocytózaendocytózaendocytóza

Page 56: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Uspo řádání MT během bun ěčného cyklu rostlinné bu ňkyUspo řádání MT během bun ěčného cyklu rostlinné bu ňky

Po PPB zbývá „actin depleted zone“ a bílkovina TANGLEDTANGLEDTANGLEDTANGLED.

Page 57: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 58: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 59: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Před nástupem mitózy se tvoří v místě zaostřujícícho se PPB pás zvýšené

endocytózy.

Page 60: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

F až K – EMTs (endplasmic MTs)Dorustají do oblasti předchozího PPB a tak se setkávají s endosomy, které po nich putují v minus-směru.

Page 61: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Inhibitortransportuauxinu NPA(naphthylphtha-lamic acid)narušuje tvorbuPPB a orientacibuněčnépřepážky.(viz. také video)

Page 62: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

• Endocytóza je intenzivní v místech kde se endoplasmatické MTs setkávají s PPB.

• Pás endosomů proto leží v těsné blízkosti PPB a je zachován i po rozpadu PPB při tvorbě mitotického vřeténka.

• Kyselina naftylftalamová (NPA) – inhibitor polárního výtoku auxinu - působí anomální PPBsa následně posuny v rovině buněčného dělení.

Page 63: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Dynamiky cytoskeletu a endomembránového systému jsou neoddělitelně recipročně

provázány.

Page 64: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 65: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

či spíše vakuoly

Page 66: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Protoplast aleuronukukuřice

V1=PSVV2=LV

Page 67: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Topologicky je to extracytoplasmatický

kompartment a také se velmi rychle vyrovnává se změnami

osmotických poměrů v apoplastu.

Page 68: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 69: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

ESCRT complex

Prevacuol. comp.Multi Vesicular Body

Page 70: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Sort. rec. BP-80

Page 71: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Vakuolární lokalizační signály

NPIR

NPIR

Page 72: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 73: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Třídění do lytické vakuoly přes BP-80/ELP receptory.

Page 74: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 75: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Prolaminy

Agregace jako třídící mechanismus v ER - PB.Lokalizovaná translace na spec. doménách ER.

Page 76: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Od ER odvozená PB jsou obklopována a pohlcována vakuolami.

PROBLÉM HOMOTYPICKÉ FÚZE.

Page 77: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

PEP12 je prevakuolární t-SNARE u Arabidopsis

Page 78: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Podstatnou součástí třídění leguminů je jejich postupná agregace v periferních oblastech

GA.

Page 79: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

CVV, které vznikají na PB dom. GA pravděpodobně odtřiďují složky, které do

PSV nepatří.

Page 80: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 81: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Tvorba MVB

Page 82: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 83: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 84: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Třídění bílkovin z MVB do vakuoly je řízeno třemi komplexyESCRT - u Arabidopsis jsou některé podjednotky známy díkyanalýze mutantů hyade.

Page 85: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Vesicular traffic and the role of Golgi apparatus (body) as a “traffic controller”. Protein modifications take place in the Golgi, which result in acquisition of appropriate signals, and hence packaging into correct vesicles. Hydrolytic enzymes are sent to lysosome, export vesicles to plasmalemma and ER membranes and proteins are recycled back to ER (Fig 13-21).

Retromerpomáhárecyklovatz PVCdo TGN

Page 86: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Homology jsou také u rostlin a je pravděpodobné, že funguje podobně.

Page 87: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 88: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

• Rostliny jsou schopny přežívat fáze nedostatku živin mj. také díky bohatě rozvinuté schopnosti autofagie - degradace cytoplasmatickýchčástí ve speciální vakuole.

Page 89: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Autofagická vakuola

4 dráhy

Page 90: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Bílkoviny řídící tvorbu autofagických vakuol jsou dobře evolučně konzervovány.Celá dráha je aktivována TOR kinázou a pak procesem podobným ubiquitinaci.Důležitou roli hraje PI3K - VPS34, která je inhibována wortmanninem.

Page 91: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 92: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

• PI(4)P (blue) -concentrated on Golgi

• PI(3)P (green) - early endosomes

• PI(4,5)P2 -plasma membrane

• PI(3,5)P2 - multi-vesicular endosomes

Distribution ofphosphatidylinositidesin cells:

Roth 2004

Page 93: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Ve vakuole dochází k nespecifickédegradaci řady

substrátů včetně lipidů, polysacharidů a bílkovin.

Page 94: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Arabidopsis s postiženou tvorbou autofágníchvakuol rychleji stárne a hůře odolává hladovění.

Page 95: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

•Vakuoly jsou Vakuoly jsou Vakuoly jsou Vakuoly jsou

centrální pro centrální pro centrální pro centrální pro

pochopení života pochopení života pochopení života pochopení života

rostlinné rostlinné rostlinné rostlinné buňky.buňky.buňky.buňky.

Page 96: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

• Robinsonovy

shrnující

• modely

• 2005

Page 97: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,
Page 98: čeniny/barvi ky - kfrserver.natur.cuni.czkfrserver.natur.cuni.cz/studium/prednasky/bunka/2007/EndocytosaVakuolaFin07.pdf · clerender.fcgi?tool=pubmed&pub ... • Proto zvl. Arf,

Recommended