BMČ a PubMed Informační zdroje pro

medicínské obory

Dagmar Marušáková

databázi zpracovává Národní lékařská knihovna v Praze (NLK)

obsahuje veškeré české (resp. česko-slovenské) odborné písemnictví z medicíny a zdravotnictví od roku 1947

v počítačové podobě jsou roky 1953-1956,58,61-64,67-76, 1978 až do současnosti, starší ročníky se doplňují

zpracovává monografie, články, časopisy (pouze odborné), recenze, referáty, statě a abstrakta ze sborníků

monografie jsou zpracovávány jako celek, časopisy a sborníky analyticky

BMČ – Bibliographia medica Čechoslovaca

slovenská produkce zahrnuta jen do r. 2000 od r. 2001pouze české knihy a časopisy; slovenskou

produkci zastupují jen časopisy, které jako česko-slovenské časopisy vydává tiskové středisko České lékařské společnosti

bohemika a slovacika (práce českých a slovenských autorů publikované v zahraničních časopisech)

slovenské knihy a časopisy jsou dostupné ve fondech českých knihoven-možnost získat prostřednictvím služby MVS (zajišťuje knihovna UTB)

databáze obsahuje cca 500 000 záznamů, roční přírůstek činí 20 000 záznamů

BMČ – Bibliographia medica Čechoslovaca

záznamy cca od r. 2008 mají odkazy na plné texty článků, pokud jsou volně dostupné (cca 40 000 záznamů)

zpoždění ve zpracování oproti tištěné verzi je cca 2-4 měsíce

pro věcné zpracování i pro vyhledávání se používá český překlad tezauru MeSH (Medical Subject Headings=řízený slovník termínů z oblasti medicíny a zdravotnictví, vydávaný od r. 1960 americkou Národní lékařskou knihovnou, který se pravidelně ročně aktualizuje); pouze abstrakta se neindexují hesly MeSH

informace nejen pro profesní studium ale i pro praxi (systém celoživotního kreditního vzdělávání nelékařských zdravotnických oborů)

BMČ – Bibliographia medica Čechoslovaca

databáze je online přístupná v portálu NLK Medvikwww.medvik.cz/bmc/

vstup do databáze též ze stránek NLKwww.nlk.cz

info o databázi Seznam excerpovaných titulů časopisů propojení na jednotlivé tituly do portálu NLK Medvik propojení na domovské stránky časopisů, možnost

získat plné texty článků (volně dostupné nebo pro registrované předplatitele)

součástí záznamu časopisu jsou odkazy na články publikované v daném časopise za určité období

BMČ – Bibliographia medica Čechoslovaca

BMČ – Seznam excerpovaných titulů časopisů

vstup do záznamu konkrétního titulu

časopisu, odkazy na publikované články,

propojení na domovskou stránku

časopisu, získání plných textů

Sestra: odborný dvouměsíčník pro zdravotní sestry (2005-2012)

Florence: časopis moderního ošetřovatelství (2006-2012)

Diagnóza v ošetřovatelství: odborný informační časopis pro zdravotnické pracovníky (2005-2012)

Medical tribune (2005-2012)

Časopisy v tištěné formě ve fondu knihovny UTB

Kontakt: vědecký časopis ZSF Jihočeské univerzity (plné texty od r. 2005)

Ošetřovatelství: teorie a praxe moderního ošetřovatelství (vydává LF UK Hradec Králové)

Ošetřovatelství a porodní asistence [elektronický zdroj] : recenzovaný odborný a vědecký časopis (plné texty od r. 2010)

Sestra v diabetologii: časopis pro lékaře a zdravotní sestry

Ošetřovatelské časopisy

Journal of nursing, social studies and public health (vyd. ZSF Jihočeské univerzity, plné texty od r. 2010)

Profese on-line [elektronický zdroj] : recenzovaný časopis pro zdravotnické obory (plné texty od r. 2008)

Moderní babictví: časopis pro porodní asistentky a ženské sestry (plné texty od r. 2003)

výhody časopiseckých článků – nejaktuálnější informace, snadná dostupnost (online dostupnost), jedinečnost (mnohá témata a problémy v knižních publikacích nelze najít)

Ošetřovatelské časopisy

nové vyhledávací rozhraní integrace zdrojů –katalogy, BMČ, autority,

MeSH přizpůsobení novým trendům (knihovní

katalog nové generace), tzn. zjednodušení vyhledávání pro koncové uživatele

zviditelnění MeSH a usnadnění jeho používání

vyhledávání současně v BMČ i katalogu NLK odkazy na plné texty a digitální archiv

Portál Medvik

Portál Medvik

základní menu

základní hledání

lze zvolit množinu pro vyhledávání–katalogy, BMČ, vše vyhledávání probíhá ve všech položkách záznamu celé

databáze–do dotazu lze zadat i např. ISBN, ISSN, autora, ale pro tyto případy je lepší použít specifické formuláře na úvodní straně nebo pokročilé hledání

klíčová slova můžeme zadávat v češtině i v angličtině zadáme-li více klíčových slov současně, jsou automaticky spojena

operátorem AND lze používat operátory OR a NOT, ty však musíme do dotazu zapsat při zadávání dotazu můžeme použít * (hvězdičku) pro pravostranné

rozšíření, např. lumb* vyhledá lumbální, lumbalgie, lumbago, lumboischialgie aj.

lze použít zástupný znak ? (otazník), např. h?ematology vyhledá hematology i haematology

chceme-li vyhledat přesnou frázi, použijeme uvozovky, např. „klasifikace nemocí“

Základní (=fulltextové) hledání

Úvod–formuláře pro vyhledávání ve vybraných polích Pokročilé hledání-možnost zadání více podmínek

výběrem polí pro vyhledávání + rejstříky, rešeršní historie

Autoři-vyhledávání autorů, návrat k posledním výsledkům vyhledávání autorů

Témata, tzn. předmět-vyhledávání deskriptorů MeSH, předmětových hesel, klíčových slov, návrat k posledním výsledkům vyhledávání předmětů

Prohlížení-prohlížení tezauru MeSH Výsledky–zobrazí vždy výsledky posledního dotazu Schránka–slouží k dočasnému ukládání záznamů,

jejich exportu/tisku

Základní menu

prohlížení tezaurus MeSH Medical Subject Headings (MeSH) - je kontrolovaný

slovník termínů z lékařství a zdravotnictví, který se používá pro indexování a vyhledávání biomedicínských a se zdravím souvisejících informací

producentem slovníku je National Library of Medicine (NLM), Bethesda, USA

termíny slovníku jsou uspořádány do stromové struktury, jeden termín se může vyskytovat na více místech stromu

obsahuje české i anglické termíny MeSH, podhesla pro každé hlavní heslo, možnost zobrazení všech záznamů k danému heslu nebo pouze záznamů s vybraným podheslem

Prohlížení

Prohlížení MeSH

heslo MeSH (česky a anglicky)

stromová struktura hesel

MesH

kliknutím na některou z možností

zobrazíme buď všechny

záznamy k danému heslu nebo pouze záznamy s vybraným podheslem

pokud hledáme již konkrétní informaci, použijeme formulář na úvodní stránce

dotaz zapisujeme do vybraných polí dle druhu dotazu (hledání probíhá právě jen v této části záznamu): název dokumentu, časopis, předmět (deskriptor MeSH, klíčová slova), konkrétní autor, akce; objeví se nápověda pro zápis dotazu

výhody-vhodné pro vyhledávání titulů časopisů; vhodné pro rychlé seznámení s tématem nebo v případě, kdy pro dotaz nenajdeme heslo MeSH; pokud hledáme autora nebo téma, automaticky nás přesměruje na záložky Autoři/Témata a vyhledáváme z rejstříků

nevýhody-nemožnost kombinace více polí

Úvod – jednoduché vyhledávání

Úvod – vyhledávací pole

jednotlivá pole pro zápis dotazu

vyhledá publikace s názvem obsahujícím zadané slovo/slova/frázi, kdekoli

zadáme-li více klíčových slov současně, jsou automaticky spojena operátorem AND. Lze použít i operátory OR a NOT, ty je však potřeba do dotazu zapsat. Při zadávání dotazu můžeme použít * (hvězdičku) pro pravostranné rozšíření, např. lumb* vyhledá záznamy dokumentů s názvem obsahujícím slova lumbální, lumbalgie, lumbago, lumboischialgie aj. Chceme-li vyhledat přesnou frázi, použijeme uvozovky, např. „klasifikace nemocí“

známe-li přesný název, použijeme uvozovky, např. „akutní poškození a selhání ledvin“

chceme-li vyhledávat podle začátku názvu, použijeme Pokročilé hledání –Rejstříky –Název –Rozšířeno zprava

pole Název použijeme také v případě, kdy hledaný termín nemá heslo MeSH

Úvod- vyhledávací pole Název

vyhledá časopisy, jejichž záznamy obsahují zadané slovo nebo slova, zkratku, ISSN atd.

zobrazený záznam časopisu obsahuje odkaz na domovskou stránku časopisu

součástí záznamu jsou odkazy na články publikované v daném časopise za určité období

odkazy na plné texty jsou u jednotlivých článků formou odkazu na článek (zpřístupňuje vydavatel) nebo odkazu do digitálního archivu (digitalizuje a zpřístupňuje NLK v projektu Kramerius)

Úvod – vyhledávací pole Časopis

Záznam titulu časopisu

odkazy na záznamy článků

z určitého období

odkaz na plné texty

popis časopisu

předmět = viz záložka Témata vyhledá odpovídající deskriptory (hesla) MeSH, klíčová slova nebo

obory NLK z předmětového rejstříku prohledává celý záznam deskriptoru dotaz můžeme zadat v češtině i v angličtině, systém vyhledává i v

anglické verzi MeSH můžeme použít * (hvězdičku) pro pravo-i levostranné rozšiřování, např.

laparo* vyhledá deskriptory (hesla) laparoskopie nebo cholecystektomie laparoskopická, *skopie vyhledá deskriptory (hesla) angioskopie, artroskopie atd. Nejsme-li si jisti pravopisem, můžeme také použít ? (otazník) pro nahrazení jednoho znaku, např. ambl?opie

po vyhledání hesla si můžeme prohlédnout záznamy idexované tímto heslem nebo vybrat heslo pro další použití/vyhledávání (uloží se do řešeršní historie v Pokročilém hledání)

pokud systém nenajde žádný deskriptor (heslo MeSH), hledáme v základním vyhledávání nebo v poli Název

návrat k posledním výsledkům vyhledávání předmětu

Úvod – vyhledávací pole Předmět

Témata

možnost prohlédnout si záznamy nebo

použít heslo pro další vyhledávání (uloží se do rešeršní historie)

vyhledané heslo MesH - kliknutím na záhlaví získáme podrobnější

informace

autor = viz záložka Autoři vyhledá jméno v rejstříku autorů podle zadaných kritérií.

Dotaz zadáváme ve tvaru Příjmení, Jméno-pokud neznáme celé znění jména, můžeme použít pouze iniciálu (bez tečky), např. Novák, Pavel, případně Novák, P, nebo pouze příjmení, např. Novák

vyhledává také korporativní autory (instituce) po vyhledání autora si můžeme prohlédnout všechny

publikace autora nebo vybrat jméno autora pro další použití/vyhledávání (uloží se do řešeršní historie v Pokročilém hledání)

návrat k posledním výsledkům vyhledávání autorů pro výběr více jmen je vhodnější použít rejstříky v

Pokročilém hledání

Úvod – vyhledávací pole Autor

Autoři

možnost prohlédnout si záznamy nebo

použít heslo pro další vyhledávání (uloží se do rešeršní historie)

informace o autorovi, kliknutím na záhlaví získáme podrobnější

informace

vyhledá sborníky z konference či jiné odborné akce, které jsou ve fondu NLK (zpracované v BMČ a katalogu Medvik)

nejedná se o databázi akcí

Úvod – vyhledávací pole Akce

hledání dle slov/výrazů lze kombinovat libovolný počet

vyhledávacích polí pomocí operátorů AND a OR

lze volit různé druhy vyhledávacích polí (autor, název, časopis, nakladatel, ISBN …)

hledání dle rejstříků – MeSH, autor, předmět, časopis/zdroj, název, nakladatel

zobrazena rešeršní historie lze kombinovat dotazy z rešeršní historie

Pokročilé hledání

Pokročilé hledání

kombinace vyhledávacích polí

rešeršní historievyhledávání podle rejstříků

pod seznamem výsledků se nachází oblak hesel-deskriptorů MeSH, který je založený na počtu výskytů hesel ve výsledcích konkrétního dotazu

velikost písma je odvozena od četnosti výskytu hesla v indexovaných záznamech

kliknutím na vybrané heslo můžeme dotaz zúžit na záznamy dokumentů, které toto heslo obsahují

tematické upřesnění také pomocí Check Tag

Upřesňování dotazu – využití MeSH

Upřesňování dotazu – využití MeSH

kliknutím na vybrané heslo můžeme zúžit dotaz na záznamy

dokumentů, které toto heslo obsahují

rok(y) vydání jazyk země Check Tag databáze vlastník typ dokumentu autoři lze kombinovat nabízené možnosti

prostřednictvím odkazu „filtrovat“

Upřesňování dotazu – formální hlediska

Upřesňování dotazu – formální hlediska

Při použití „filtrovat“ můžeme

kombinovat nabízené možnosti

lze volit různé možnosti zobrazení záznamů (standardní nebo MeSH hesla), řazení (dle data nebo relevance), vzestupně, počet výsledků na stránce

přidané filtry lze odebírat po jednom (o krok zpět) nebo všechny najednou (zpět k výchozímu stavu)

přidat dotaz-přidá dotaz do rešeršní historie vybrané (relevantní) záznamy lze ukládat do schránky (pro

tisk a export) ikony pro označení různých druhů dokumentů rešeršní historie, zvolené zobrazení záznamů a výběr

záznamů ve schránce se zruší manuálně nebo zavřením stránky Medvik

záznamy ve schránce lze jen prohlížet, mazat, tisknout nebo exportovat (nelze je dále filtrovat)

Práce se záznamy

Práce se záznamy

možnost volby zobrazení, řazení, počet záznamů na stránce; hromadné

přidávání záznamů do schránky

hesla MeSH, která popisují daný záznam; kliknutím na

heslo zúžíme dotaz na použité heslo v daném výběru; kliknutím na ikonu „i“

vyhledáme všechny záznamy v BMČ obsahující toto heslo bez

ohledu na předchozí dotaz

Schránka: přidat – přidávání záznamů po jednom Schránka: odstranit – odstranění záznamu ze schránky Digitální archiv – digitální kopie dokumentu Abstrakt – zobrazení abstraktu Detail – detailní zobrazení záznamu Citace – generovaná citace dokumentu Hypertextové odkazy – plný text článku (samotný

článek v PDF, celé číslo v PDF nebo odkaz na archiv jednotlivých čísel-nutno vyhledat rok, číslo, strana, název), obsah, obálka, domovská stránka časopisu, perzistentní link (trvalý odkaz na záznam)

Práce se záznamem

Detailní záznam knihy

náhled obálky a obsahu knihy

citace knihyhesla a podhesla

MeSH

Detailní záznam článku z časopisu

citace článku plný text z digitálního archivu

plný text ze stránek

vydavatele

hesla a podhlesla MeSH

abstrakt článku

Ústav zdravotnických informací a statistiky-ÚZIS (www.uzis.cz)-online dostupné mezinárodní klasifikace nemocí, zdravotnická statistika ČR, zdravotnické ročenky ČR, adresáře zdrav. zařízení

Český statistický úřad (www.czso.cz)-online dostupné statistické ročenky ČR a krajské ročenky

Sbírka zákonů (www.mvcr.cz/web-legislativa.aspx)-ze stránek Min. vnitra ČR (online archiv od roku 1945)

Věstník Ministerstva zdravotnictví ČR (www.mzcr.cz)-ze stránek Min. zdravotnictví ČR (online archiv od r. 1999)

Velký lékařský slovník (online) + oborové lexikony (www.lekarske.slovniky.cz)

Další zdroje informací pro medicínu

je medicínská databáze US National Library of Medicine a National Institutes of Health

volně přístupné rozhraní k databázi MEDLINE obsahuje cca 21 miliónů citací článků od r. 1950 pro věcné zpracování a vyhledávání je používán

biomedicínský tezaurus MeSH u většiny článků je odkaz na plný text, a to jak volně

dostupný, tak existuje propojení s většinou poskytovatelů, kteří poskytují plnotextové znění článků v rámci licencí

do některých licencí má UTB přístup, jako např. SpringerLink, Wiley, ScienceDirect/Elsevier

PubMed

přístup do databáze je z adresy www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

na hlavní stránce je k dispozici nápověda jednoduché vyhledávání (bez použití MeSH)

se používá jen výjimečně (např. při velmi úzkém a speciálním termínu); zadaný termín se tak hledá v jakémkoliv výskytu v databázi

standardně se používá pokročilé vyhledávání nebo formulování dotazu pomocí databáze MeSH

PubMed

PubMed jednoduché

vyhledávání bez hesel MeSH

vstup do databáze hesel MeSH

vstup do pokročilého vyhledávání

vyhledáme požadované heslo (anglickou verzi můžeme ověřit v BMČ)

heslo můžeme limitovat podhesly (Subheadings) nebo omezit pouze na MeSH Major Topic (tzv. hlavní heslo)=zužování dotazu

můžeme si prohlédnout příbuzná hesla (See also) nebo stromovou strukturu hesla

heslo vložíme do vyhledávacího pole (Add to search builder) pomocí zvoleného operátoru (AND, OR, NOT)

pokud nechceme kombinovat více hesel dáme vyhledat (Search PubMed), jinak pokračujeme ve vyhledání dalšího hesla a kombinování dotazu

MeSH Database

Formulace dotazu pomocí hesel MeSH

heslo MeSH s podhesly

omezení na MeSH Major

Topic

příbuzná hesla

formulace dotazu

pomocí hesel MeSH

Formulace dotazu pomocí hesel MeSH – kombinovaný dotaz

heslo MeSH s podhesly

omezení na MeSH Major

Topic

příbuzná hesla

formulace dotazu

pomocí hesel MeSH

Výsledek vyhledávání (bez jakýchkoliv omezení)

zadaný dotaz

možnost volby formátu

zobrazení, řazení, počet záznamů na

stránce

kliknutím na nadpis článku otevřeme jeho

detailní zobrazení

články s volně

dostupnými plnými texty

záznamy podle roků

vydání

dotaz upřesňujeme pomocí Show additional filters, můžeme volit až deset filtrů

nejčastěji se používá omezení na jazyk, rok, typ článku, plné texty (volně dostupné nebo dostupné v licencovaných zdrojích), omezení pouze na ošetřovatelské časopisy

je nutné limity aplikovat s rozmyslem, ukáže-li se, že omezení na ošetřovatelské časopisy je nevhodné, tento limit pak nepoužíváme a držíme se standardních limitů –raději např. omezení na plné texty

jednou nastavené limity platí i pro další vyhledávání (viz upozornění zatržítkem a informací Filters activated); můžeme je změnit nebo zrušit jednotlivě(Clear) nebo všechny najednou (Clear all)

Upřesňování dotazu – formální hlediska

Upřesňování dotazu – formální hlediska

roky vydání

typ článku

plné texty

jazyk

ošetřovatelské časopisy

rešeršní historie a další

předchozí aktivity

upozornění na záznam

s volně dostupným

plným textem

Detailní záznam článku z časopisu – volně dostupný plný text

citace článku s abstraktem

hesla MeSH; heslo s *

(hvězdičkou)=MeSH Major

Topic

vstup do volně

dostupného plného textu

vstup do volně dostupného plného

textu

odkazy na související

články

Detailní záznam článku z časopisu – dostupný v licencovaných zdrojích

vstup do plného textu

v licencované

databázi

Advanced search lze kombinovat libovolný počet vyhledávacích polí

pomocí operátorů AND, OR, NOT lze volit různé druhy vyhledávacích polí (např.

Author, Title, Journal, MeSH Terms…) hledání dle rejstříků (např. MeSH Terms, MeSH

Major Topic, Author…) zobrazena rešeršní historie lze kombinovat dotazy z rešeršní historie použití MeSH Major Topic znamená zúžení dotazu

(méně vyhledaných záznamů) avšak větší relevanci nalezených záznamů

Pokročilé hledání

Pokročilé hledání

formulace dotazu kombinací

vyhledávacích polí

rešeršní historie a možnost

kombinace dalších dotazů

zadávání dotazu pomocí

rejstříků

Pokročilé hledání – použití MeSH Major Topic

výsledný počet

záznamů při použití MeSH Major Topic

upozornění na záznam,

který je uložen ve schránce

označíme záznamy, které chceme uložit do schránky; pokud neuděláme výběr označením, uloží se všechny záznamy z posledního hledání

Send to: clipboard (schránka), potvrdíme počet odesílaných položek (záznamů)

u takovýchto záznamů se pak objeví označení Item in clipboard (pokud zadáváme postupně více dotazů, vidíme záznamy, které jsme vybrali do schránky z předchozích hledání)

pokud záznamy ze schránky manuálně neodstraníme, jsou automaticky odstraněny po 8 hodinách nečinnosti v PubMedu, maximální počet záznamů ve schránce je 500

Práce se záznamy – ukládání do schránky

Práce se záznamy – ukládání do schránky

příkaz k uložení vybraných záznamů

do schránky

označení záznamů pro

uložení do schránky

Práce se záznamy – odeslání e-mailem

oznámení o odeslání e-mailu

zvolit nejvhodnější formát záznamů pro

odeslání

veškerá rešeršní historie a záznamy ve schránce jsou uloženy po dobu 8 hodin (i po uzavření databáze)

My NCBI je umožní uložit i pro pozdější využití je nutná bezplatná registrace (pouze zvolení a

potvrzení uživatelského jména a hesla) a přihlášení umožňuje uložit rešeršní dotazy (Saved searched),

vyhledané záznamy (My bibliography), tvořit si tematické složky (Collections), automaticky se ukládá veškerá aktivita v databázi (Recent activity)

lze přidávat filtry (Manage filters) k vyhledaným záznamům (automaticky je navolen filtr Review a Free Full Text, můžeme přidat další z nabídky, např. English nebo Items with Abstracts)

My NCBI

při ukládání řešeršního dotazu (Saved researched) si můžeme navolit požadavek automatického zasílání novinek dle formulace dotazu

pokud v databázi přibudou nové záznamy, které odpovídají našemu zadanému dotazu, systém automaticky odešle zprávu s jejich citacemi na uvedený e-mail (tak často, jak si navolíme)

v tomto případě je nutné při registraci uvést svou funkční e-mailovou adresu

My NCBI

My NCBI – registrace a přihlášení

přihlášení

bezplatná registrace

přihlášení

My NCBI – ukládání

ukládání dotazů (Save search)

ukládání záznamů (Collection, My bibliography)

My NCBI – uložené položky

při nízkém počtu nalezených záznamů hledáme širší (obecnější) termín

při vysokém počtu záznamů hledáme užší (konkrétnější) termín

některé specifické termíny nemají hesla MeSH, musíme je tedy zadat do základního vyhledávání (např. baby-box)

pokud jsme již získali relevantní dokument (knihu, článek), všímáme si zde použitých zdrojů

inspirací, co do použité literatury, mohou být i starší studentské práce - jak studentů UTB (http://dspace.k.utb.cz/), tak ostatních univerzit v ČR (www.theses.cz)

Několik rad na závěr …

Dagmar Marušáková Knihovna UTB Zlín

marusakova@knihovna.utb.cz listopad 2012