L Ln Utuinmaré CeIoSinnudNP
Lausanne,
Le traitemenouvelles p
Un moyen umorale effnterdisciplinmodélisation
pproche exésultat.
Cette étudeexpérimentaoannis Xen
Sein-CHUV,nstitutions sovateur entiliser la moes cellules
National SuiPlos Compu
Le diLes minfiltrleur angiofonctessecanc Une La noet dmodéimmu L’étumono
16 mars 2
ent du capossibilité
de reprogrfficace a énaire qui pon mathémaxpérimental
a été meale, Centre narios (UNI UNIL). Au
scientifiquestre l’oncoloodélisation de patient
sse pour lautational Bio
ialogue momonocytes rent égalemcapacité à
ogénique) etion immunontielles au ers humain
approche iouvelle appu SIB conélisation pounosuppres
de a démoocytes sang
015
ncer du sés
rammer uneété révélé orte sur le atique et de traditionn
née conjoiLudwig de
L, SIB, Vitau-delà d’êtres nationale
ogie expérimpour guide
tes atteintea Rechercheology témoig
onocyte-tumsont des c
ment les tum induire leet à suppriosuppressivdéveloppems sont enco
interdiscipproche interdnsiste à c
our identifierssives des m
ontré que, cguins atteig
sein - un a
e réponse par les récancer du e l’expérim
nelle aurait
ntement pae l’UNIL poal-IT) et le e une manis de pointementale et er l'identificas d’un cane Scientifiqugnent de la
meur ellules imm
meurs. Dandéveloppe
mer la répve). Combiment de la ore largeme
plinaire poudisciplinaireconjuguer r ces mécamonocytes d
chez les patgnent la tum
appui mat
immunitairésultats d’usein(1). Grâ
mentation, 2nécessité 5
ar la Docteour la rech
Professeuifestation de, la particula modélisaation d'appcer du seinue et la pubvalidité scie
munitaires cns ce conteement du rponse immuen même ctumeur, leu
ent inconnus
ur trouver le amenée pl’oncologie nismes et bdans le can
tientes attemeur, ils aug
thématiqu
re défectueune récenteâce à la co20 expérie596 expérie
eure Marie-herche sur ur Jean-Frae la collaboularité de l’ation. En e
proches thén. Le soutieblication de entifique et
irculant danexte, les moréseau sanunitaire dirigces fonctiours mécaniss.
la faille par les cher
clinique ebloquer les ncer du sein
eintes d’un cgmentent ra
e à l’onco
use en une étude tra
ombinaison nces ont snces pour o
-Agnès Doule cancer)
nçois Delaoration con’étude résid
effet, elle esrapeutiquesen obtenu ases résultadu potentie
ns le sang. onocytes songuin tumorgée contre ns sont recsmes sous-j
cheurs du Cet expérimfonctions a
n.
cancer du sadicalemen
ologie offr
ne réponse ranslationell
innovante suffi, là oùobtenir le m
ucey (Onco), le Profe
aloye (Centntinue entrede dans l’ast la premis efficaces auprès du
ats dans la rel de ce trav
De ce fait,ont connusral (dite fon la tumeurconnues cojacents dan
CHUV, de l’mentale aveangiogéniqu
sein, lorsqunt leurs fonc
re de
anti-le ou de la
ù une même
ologie sseur re du
e trois alliage ère à dans Fond revue vail.
elles pour
nction (dite
omme ns les
’UNIL ec la ues et
ue les ctions
P
angiocapa Le pimmumécala faiéchamodé InhibUn mdonntraiteété tetraiteinhibcontrmono Des Le l’expéoptimappromêm L’étusont cellulrésulthéraimmu
PLOS Comp
(1) Angiosyste
Nicolas Hull2, S
ogéniques eacité de faço
rincipal objunosuppresanismes moble quantité
antillons tumélisation ma
ber la commmodèle boonées expérements capaestées expé
ement a été e les voiesrôlent syneocytes tumo
avantages bénéfice sérimentatio
male les reoche expére résultat ta
de a permextrêmemeles capabletats soulig
apeutique etunothérapeu
putational
ogenic activems modelin
Guex1*, IsaSolange Kh
et immunosonner les fo
jectif de l’éssive des oléculaires qé de monocmoraux. C’eathématique
municationoléen du coimentales. ables d’inteérimentalem identifié cos de signalrgiquementoraux.
et découvsignificatif n et permet
essources eimentale traandis que 2
is une pisteent adaptabes d’induirenent que lt laissent enutique dans
Biology, p
vity of breang and exp
aac Crespo1
haroubi2, Ro
suppressiveonctions mo
étude était monocytes
qui contrôlecytes dans lest dans cee et de l’exp
n omportemenCe modèl
erférer avecment sur deomme étantlisation liéet les fonctio
vertes en prde cette
t de découvet les échaaditionnelle 20 expérienc
e de découbles et souse une répoles monocyntrevoir l’utis le cancer d
loscompbi
ast cancer perimental ap
1*, Sylvian Bobin Liecht
es. Cette obnocytaires
ainsi de bls tumorauxent ces fonces tumeurse contexte périmentatio
nt des mone a ensuit
c les fonctioes monocytet extrêmemes aux réceons angiog
rime approche
vrir de nouvantillons deaurait néce
ces ont suff
uverte supps l’effet du nse immunytes tumorilisation de du sein.
iol.org
patients’ mopproaches
Bron2, Assiati1, Patricia
bservation en sa faveu
oquer les fx. Ceci a ctions, un vés et de la pe
que la comon est entré
nocytes a éte été inteons monocyes tumorauxent efficaceepteurs kingéniques et
e est queveaux traitemes patienteessité 596 efi grâce à ce
plémentairedouble trait
nitaire dirigéaux représce double t
onocytes re
a Ifticene-Tra Werffeli4,
indique queur.
fonctions anécessité
éritable défietite taille gémbinaison ée en jeu.
été construerrogé afin ytaires. Cesx de patien
e. Le traitemases TIE-2t immunosu
e la modments, en u
es. A titre expériencesette nouvell
. Les monotement se cée contre lsentent uneraitement c
everted by c
reboux3, EvMark Ibbe
e la tumeu
angiogéniqud’identifie
i compte tenénéralemeninnovante
uit, basé sude prédire
s prédictionntes et un dment en que2 et VEGFRuppressives
délisation utilisant de comparatif,s pour obtele approche
ocytes tumoconvertissela tumeur. e nouvelle comme appr
combined u
veline Faeserson1, Fra
- 2 -
r a la
es et r les nu de nt des de la
ur les e les
ns ont ouble estion R qui s des
guide façon , une enir le e.
oraux ent en
Ces cible
roche
use of
-van’t ancois
P
MLC1FE
IoUVL1TFE
Majo5, MLehr8, BIoannis
1 Vital-IT
2Ludwig
3Centre Lausann
4DepartmLausann
5Hopital
6Merck G
7Harvard
8InstituteJohanne
9Departm
10DepartVaudois
* Ces au
Pour plus d
Marie-AgnèsLudwig @UnChemin des
066 EpalingFax: + 41 21Email: Marie
oannis XenaUniversité deVital-IT, SIB Le Génopod
015 LausanTel: +41 21 6Fax: +41 21 Email: ioann
Michaël NicBrian J. SteXenarios1 a
T, SIB (Swis
Center for
du Sein,ne, Switzerl
ment of oncne, Switzerl
Ophtalmiq
Group, Dar
d Medical S
e of Patholes Gutenbe
ment of Me
tment of gs), Universit
uteurs ont c
de renseign
s Doucey nilBiopole IIBoveresse
ges 1 692 39 55e-Agnes.Do
arios e LausanneSwiss Insti
de nne 692 40 31 692 40 65
nis.xenarios
colas5, Julievenson1, Cand Marie-A
ss Institute
Cancer Re
CHUV (land
cology, CHland
ue Jules-Go
mstadt, Ge
School, Bos
logy, Univeerg Universi
dicine, Univ
gynecology ty of Lausan
contribué à p
nements co
I es 155
ucey@unil.
e tute of Bioin
@isb-sib.ch
en LaurentCurzio RüeAgnès Douc
of Bioinform
esearch, Un
Centre Ho
UV (Centre
onin, Lausa
rmany
ton, United
ersity of Laty, Mainz, G
versity of Fr
and obstnne, Switze
part égale à
ontacter:
ch
nformatics
h
t6, Abhisheegg9, Georgcey2
matics), Uni
iversity of L
ospitalier U
e Hospitalie
anne, Switze
States
ausanne, SwGermany
ribourg, Sw
tetrics, CHerland
à ce travail
ek Garg7, Kge Coukos2
versity of L
Lausanne, S
Universitaire
er Universita
erland
witzerland
itzerland
UV (Centre
Khalil Zama2, Jean-Fran
ausanne, S
Switzerland
e Vaudois)
aire Vaudoi
and Institut
e Hospitali
an3, Hans-Ançois Dela
Switzerland
), Universi
is), Univers
te of Patho
ier Univers
- 3 -
Anton loye3,
ty of
sity of
ology,
sitaire
Ioannis Xenarios Jean‐FrancoisDelaloye
Marie‐Agnès Doucey
Why do we need a dynamical model?
Minimal combination to activate D, E, F and G:
Stimulations
Interactions identified experimentally
Targets
Simple case
Complex case
The state of E is defined by the dominant effect (either activation
by A or inhibition by B)
E = A AND NOT B
Logic function to define the state of E
Model defined by a system of logic functions (one function per node)
Example
The problem can be formulated as Minimum matching in a bipartite graph
(dynamical model not needed)
Model construction
‐ 7 receptors‐ 11 secreted factors
Filtering:* Amplitude of change (upper/lower quartile of variation)* Reproducibility (3/4 biological replicates)* Coherent variation across stimulation experiments
Experiments
Stimulations
Input Output
Observations
924 possible links(7 receptors x 11secreted factors x 12stimulations)
74 links
Growing the network
12x