Keeling, 2004 - botany.natur.cuni.cz · Yoon et al., 2006, Curr. Biol. 16 jaderné genomy z kultury...

Post on 02-Mar-2019

221 views 0 download

transcript

Keeling, 2004

Paulinella chromatophora

testátní améba křemitá schránka stabilní endosymbióza sinice

jediná známá “rostlinná” nerostlina

Yoon et al., 2006, Curr. Biol. 16

jaderné genomy z kultury druhu Paulinella chromatophora

alignment plastidových genů

co jsou řasy??? Adl et al. 2012

Kde v systému se nacházíme? Impérium: Eukaryota Říše: Rostliny – Plantae = Archaeplastida

společné znaky rostlinných skupin

vznik - před více než 1,5 miliardou let na souš - cca před 1 miliardou let

Dvě podříše - Biliphyta a Viridiplantae (Chloroplastida)

Glaucocystis nostochinearum

Kde v systému se nacházíme? Impérium: Eukaryota Říše: Rostliny - Plantae Podříše: Biliphyta Oddělení: Glaucophyta

Glaucophyta - nejmenší a nejpůvodnější rostlinná větev

fykobilizómy, ch a, peptidoglykanová BS

Cyanophora paradoxa

žije v planktonu kyselých sladkých vod

Kde v systému se nacházíme? Impérium: Eukaryota Říše: Rostliny - Plantae Podříše: Biliphyta Oddělení: Rhodophyta

zatím známo přes 6000 druhů, většina mořských

typické znaky životního cyklu: absence bičíkatých stádií, oogamický pohlavní proces

dvě třídy - Bangiophyceae a Florideophyceae

karposporofyt

karpospory 2n

tetrasporofyt

tetraspory n

gametofyt

spermácie

karpogonium

spermatangium

trichogyn

tetrasporangium

Chlorofyl d - objeven v malých množstvích u ruduch v r. 1943 – byl často považován za artefakt izolace

Potvrzen u Acaryochloris marina (sinice) Prochlorofyta

chlorofyl d u ruduch pravděpodobně pocházel z epifyticky žijící sinice, kde ve velkém množství (a:d = 1:30)

Pit - plugs

škrob v cytoplasmě

hemiparazitická 2N tkáň (gonimoblast)

+ ♀výživná tkáň= cystokarp

sliz

♀ ♀

Cyanidium

nejpodobnější předkům chromistních chloroplastů?

diverzitu známe z environm. sekvenování

Galdieria

extrémně kyselé biotopy pH 0,8 - 1, teplota do 56ºC

3-11 μm

In acidic thermal springs in Naples

Ciniglia et al., 2004 Mol. Ecol. 13:1827-1838.

- Předek cyanidiofyt žil pravděpodobně v termálním a acidickém prostředí - Novější jsou invaze terestrických a bentických subanaerobních biotopů - Cyanidiophyta - řádově desítky druhů

Porphyridium

pouštní krusty, extrémní biotopy

PUFA

terestrické ruduchy - Chroothece, Porphyridium

Porphyra

sklizeň porphyry v marikultuře

Dr Kathleen Drew-Baker (1901-1957)

Bangia

Compsopogon

Batrachospermum

karposporofyt

životní cyklus Batrachospermum

Chantransia (Audouinella) - sporofytní stádia batrachosperm a lemaneí

Lemanea

Hildenbrandia

sladkovodní ruduchy - bioindikátory oligosaprobních a oligotrofních zón vodního prostředí

Co to je saprobita? Intenzita hnilobných procesů ve vodním ekosystému. Saprobní index - číselná hodnota

saprobní hodnoty vycházející z druhového složení

Saprobní zóny - xenosaprobita, oligosaprobita, beta-mesosaprobita (klimax ve středních a dolních tocích temperátních ekosystémů), alfa-mesosaprobita, polysaprobita

Corallinales – „korálové ruduchy”

kalcifikace, rhodolity význam ruduch v ekosystémech korálových útesů

koralinová pláž - Hawaii

Kde nenajdeme korálové útesy?

Co tvoří korálový útes?

- koráli nesoucí Symbiodinium

- koralinní ruduchy, primární producent, transport C, K-stratégové

- ryby (predátoři)

klimaktický ekosystém, náchylný na disturbance (např. eutrofizace)

rhodolith beds (maerl) – „ruduchové dno“

Phymatolithon Lithothamnion

nekalcifikovaná genicula

negenikulátní (krustózní) koraliny

intertidální zóna

genikulátní koraliny

Corallina

subtropická a tropická moře všude na světě

koralinátní negenikulátní ruduchy

Lithophyllum

korálové útesy, atoly - zejména Pacifik a Karibské moře

i epizoické

Hydrolithon

atoly, korálové útesy

Lithophyllum a Ezo

parazitická ruducha

Nemalion

subtropický druh

oblíbení sousedi svijonožci a přílipky

Gracilaria

Gelidium

agar

subtropická a tropická moře

agar, karagen

Agar a agaróza

agarové misky

agarózový gel pro elektroforézu

Gigartina, Chondrus

„irský mech” (atlantické pobřeží Evropy, temperátní a subtropická moře) - karagen

centrum rozšíření mimo tropy

rezistentní

náchylný

virulence Acrochaete ovlivněna složením BS hostitele (Chondrus)

Ulvophyceae

Ceramium

jeden z mála rodů žijících i v Baltu

co jsou řasy??? Adl et al. 2012

Kde v systému se nacházíme? Impérium: Eukaryota Říše: Rostliny - Plantae Podříše: Viridiplantae - zelené rostliny

dvě vývojové linie - Chlorophytae a Streptophytae

mechorosty a cévnaté rostliny se ze streptofytní linie začaly vyvíjet asi před 700 milióny lety

Zechmann et al 2010, J. Phycol.

Verdigellas

Palmophyllum

Palmoclathrus

hlubokomořská skupina řas

Palmophyllum

Phalmophyllales

Leliaert et al. 2011

Pyramimonas

sladkovodní a mořští bičíkovci - popsáno několik nových tříd

Kde v systému se nacházíme? Prasinophyta – polyfyletická skupina

Nephroselmis

Marin & Melkonian

Protist 2010

Pyramimonadales

Prasinococcus/Prasinoderma

Mamiellophyceae

Pycnococcaceae

Nephroselmidophyceae

Chlorodendrophyceae

trichocysty- extracelulární trávení

Pyramimonas

Organické šupiny

Cymbomonas

tetramitiformis

krabicovitá

limuloidní

malé čtvercové

Organické šupiny

Pterosperma

mořský fytoplankton - chladná moře fosilní záznamy z pozdního Prekambria (600 mil.let)

phycoma =nepohlavní cysta

fosilní

Micromonas – pikoplankton

oceánů, chladnější voda

Kde v systému se nacházíme? Třída: Mamiellophyceae

Ostreococcus

ubikvitní rozšíření, horní-osvětlené vrstvy oceánů

Vegetační zákaly v moři; nejmenší euk. genom

rozmnožují se pohlavně???

Kde v systému se nacházíme? Třída: Nephroselmidophyceae

převážně mořští bičíkovci

Tetraselmis

Splývání organických šupin v théku

Kde v systému se nacházíme? Třída: Chlorodendrophyceae sesterská skupina k UTC

Ekologie - endosymbionti různých heterotrofních organismů

Convoluta roscoffensis –

nemá ústa, symbióza s Tetraselmis Noctiluca

Radiolaria

Convoluta